研究 ID
hum0014-v14リリース情報
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最新バージョン (v37)研究題目
オーダーメイド医療の実現プログラム
研究概要
- 目的
- 日本人における疾患関連遺伝子の特定、日本人における転移因子挿入多型の網羅的探索、日本人集団に特化したリファレンスパネルの開発
- 研究方法
- Human610-Quad BeadChip、HumanHap550v3 Genotyping BeadChip、HumanOmniExpress-12 BeadChip、HumanExome BeadChip、 OmniExpressExome Beadchip（Illumina社）、high-density oligonucleotide arrays （Perlegen Sciences社）、もしくはインベーダー法（Hologic Japan社）により遺伝子型を決定し、心筋梗塞、2型糖尿病、アトピー性皮膚炎、心房細動、Body Mass Index（BMI）、開放隅角緑内障、58形質、初潮・閉経年齢、喫煙習慣、身長、42疾患（4疾患は以前のリリースと一部重複あり）、食習慣、および冠動脈疾患のゲノムワイド関連解析（Genome Wide Association Study：GWAS）や2型糖尿病腎症および2型糖尿病発症のGWASメタ解析を実施した。51疾患患者26.9万名のSNPアレイ解析を実施した。また、Illumina社 HiSeq 2500/X Fiveを用いて、BBJ第1コホート1,026＋1,007名、心筋梗塞1,765症例、認知症199症例、胃がん256＋2,067症例、大腸がん617症例、糖尿病2,162症例の全ゲノムシークエンス（Whole Genome Sequencing：WGS）を実施した。乳がん7,104症例と対照者23,731名における遺伝性乳がん原因11遺伝子翻訳領域、遺伝性前立腺がん7,636症例と対照者12,366名における遺伝性前立腺がん原因8遺伝子翻訳領域、バイオバンクジャパン11,234名における23遺伝子、膵がん1,005症例、大腸がん12,503症例および対照者23,705名、腎がん740症例および対照者5,996名、リンパ腫1,982症例、胃がん10,366症例および対照者37,592名の遺伝性腫瘍関連27遺伝子翻訳領域ならびに腎がん740症例および対照者5,996名の腎がん関連13遺伝子翻訳領域のTarget Capture Sequencingを実施した。また、乳がん10,008症例、胃がん10,576症例、大腸がん13,922症例および心不全6,038症例、脳梗塞10,486症例などを含む計140,597名に対してTP53のTarget Capture Sequencingを実施した。バイオバンクジャパン7,472名もしくは3,256名のWGSデータから作成したvcfファイルと1000ゲノムプロジェクト（Phase3v5）2,504名のvcfファイルを統合し、genotype imputation用reference panelを作成した。バイオバンクジャパン137,693名について、男女別にCox回帰分析を実施した。当研究室が開発したソフトウェアを用い、バイオバンクジャパンの第1コホート4,880名のWGSデータから転移因子多型の同定を行った。バイオバンクジャパンの心房細動ケース9,826人とコントロール140,446人で心房細動GWASを実施し、さらに欧米人の心房細動GWAS（http://csg.sph.umich.edu/willer/public/afib2018; 60,620人ケースと970,216人コントロール、FinnGen; https://www.finngen.fi/en; 7,244人ケースと56,378人コントロール）とメタ解析を行った。メタ解析の結果からポリジェニックリスクスコアを構築した。
- 対象
- オーダーメイド医療実現化プロジェクトおよびオーダーメイド医療の実現プログラム参加者
データセット
データセットの一覧はこのバージョンのものですが、各データセットの内容は現在のものを表示しています。
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| NHA000001 | 心筋梗塞1,666症例および 対照健常者3,198名のGWAS |
| 非制限公開 | 2014-09-30 | |
| NHA000008 | 健常者934名の遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000031 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000014 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000040 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000017 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000035 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000028 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000032 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000041 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000039 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000011 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000012 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000019 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000015 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000030 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000037 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000013 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000018 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000027 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000016 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000025 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000023 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000036 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000043 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000033 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000042 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000022 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000034 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000038 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000010 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000026 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000009 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000020 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000029 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000021 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000024 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000006 | 食道がん182症例の遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000007 | 筋萎縮性側索硬化症92症例の遺伝子型カウント情報 （JSNPのデータ） |
| 非制限公開 | 2015-12-28 | |
| NHA000044 | 2型糖尿病9,817症例および 対照者6,763名のGWAS |
| 非制限公開 | 2016-01-28 | |
| NHA000045 | 2型糖尿病5,646症例および 対照者19,420名のGWAS |
| 非制限公開 | 2016-01-28 | |
| NHA000046 | アトピー性皮膚炎患者1,472症例および 対照者7,966名のGWAS |
| 非制限公開 | 2016-02-02 | |
| JGAD000101 | 心房細動患者8,180症例のPhenotypeデータ、Genotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000102 | 心房細動患者8,180症例のPhenotypeデータ、Genotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| NHA000052 | 心房細動患者8,180症例および対照者28,612名のGWAS |
| 非制限公開 | 2017-05-18 | |
| JGAD000124 | 158,284名のBMIデータ 182,505名のGenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000123 | 158,284名のBMIデータ 182,505名のGenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| NHA000053 | 158,284名のBMIのGWAS |
| 非制限公開 | 2017-09-08 | |
| JGAD000144 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000145 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000146 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000147 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000148 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000149 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000150 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000151 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000152 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000153 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000154 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000155 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000156 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000157 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000158 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000159 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000160 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000161 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000162 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000163 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000164 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000165 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000166 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000167 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000168 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000169 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000170 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000171 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000172 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000173 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000174 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000175 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000176 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000177 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000178 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000179 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000180 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000181 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000182 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000183 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000184 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000185 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000186 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000187 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000188 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000189 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000190 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000191 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000192 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000193 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000194 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000195 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000196 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000197 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000198 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000199 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000200 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000201 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000220 | BBJ第1コホート1,026名のWGSデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| JGAD000410 | JGAD000220のWGSデータのbam/gvcfデータ |
| 制限公開（Type I） | 2021-06-21 | |
| JGAD000679 | JGAD000220（reference panel）の加工データ（TogoImputation用reference panelデータ） |
| 制限公開（Type I） | 2023-01-26 | |
| JGAD000690 | JGAD000220（BBJ1,026名のWGS）の加工データ（CRAM、gVCF） |
| 制限公開（Type I） | 2023-07-30 | |
| JGAD000758 | JGAD000220（BBJ1,026名のWGS）の加工データ（joint call）（aggregate VCF） |
| 制限公開（Type I） | 2023-07-30 | |
| JGAD000867 | JGAD000220（バイオバンクジャパン1,026名のWGSデータ）の加工データ（TogoImputation用reference panelデータ） |
| 制限公開（Type I） | 2024-09-04 | |
| JGAD000885 | JGAD000220（BBJ1,026名のWGS）の加工データ（ミトコンドリアのバリアントコール） |
| 制限公開（Type I） | 2024-10-24 | |
| NHA000068 | 開放隅角緑内障3,980症例および 対照者18,815名のGWAS |
| 非制限公開 | 2018-04-04 | |
| NHA000070 | 162,255名の58臨床検査値のGWAS |
| 非制限公開 | 2018-05-01 | |
| NHA000073 | 初潮年齢データを有する女性67,029名および閉経年齢データを有する女性43,861名のGWAS |
| 非制限公開 | 2018-08-07 | |
| NHA000072 | 初潮年齢データを有する女性67,029名および閉経年齢データを有する女性43,861名のGWAS |
| 非制限公開 | 2018-08-07 | |
| JGAD000209 | 乳がん7,104症例と対照者23,731名の遺伝性乳がん原因11遺伝子翻訳領域のTarget Capture Sequencingデータ |
| 制限公開（Type I） | 2020-09-28 | |
| NHA000075 | 2型糖尿病腎症2,809症例および 2型糖尿病対照5,592症例のGWASメタ解析 |
| 非制限公開 | 2018-12-10 | |
| NHA000078 | 2型糖尿病36,614症例および 対照者155,150名のGWASメタ解析 |
| 非制限公開 | 2019-01-25 | |
| NHA000084 | 日本人集団165,436名における喫煙習慣のGWAS |
| 非制限公開 | 2019-03-26 | |
| NHA000080 | 日本人集団165,436名における喫煙習慣のGWAS |
| 非制限公開 | 2019-03-26 | |
| NHA000081 | 日本人集団165,436名における喫煙習慣のGWAS |
| 非制限公開 | 2019-03-26 | |
| NHA000082 | 日本人集団165,436名における喫煙習慣のGWAS |
| 非制限公開 | 2019-03-26 | |
| NHA000083 | 日本人集団165,436名における喫煙習慣のGWAS |
| 非制限公開 | 2019-03-26 |
提供者
- 研究代表者
- 久保 充明
- 所属機関
- 理化学研究所 統合生命医科学研究センター 疾患多様性医科学研究部門
研究プロジェクト情報
| 研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
オーダーメイド医療の実現プログラム |
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
日本医療研究開発機構 革新的先端研究開発支援事業（AMED-CREST） | 加齢や炎症に伴う組織の再構築と機能低下 |
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科学研究費助成事業 基盤研究（S） | 先端ゲノミクスを駆使したがんの初期発生とクローン進化に関わる分子基盤の解明 |
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日本医療研究開発機構（AMED） 疾病克服に向けたゲノム医療実現プロジェクト ゲノム創薬基盤推進研究事業 | 乳がん・大腸がん・膵がんに対する適切な薬剤投与を可能にする大規模データ基盤の構築 |
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科学研究費助成事業 若手研究 | 転移因子の挿入多型と疾患とのゲノムワイド関連解析 |
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科学研究費助成事業 基盤研究（B） | 心不全発症の基盤となる心筋脆弱性を規定する遺伝要因の解明 |
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科学研究費助成事業 基盤研究（S） | ゲノム免疫：内在性ウイルスの抗ウイルス活性の動作原理解明と機能資源としての確保 |
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科学研究費助成事業 基盤研究（B） | ヘルペスウイルスのゲノムへの組み込みと再活性化: 大規模解析から探る疾患との関連 |
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日本医療研究開発機構（AMED） ゲノム医療実現バイオバンク利活用プログラム（B-Cure） | 利活用を目的とした日本疾患バイオバンクの運営・管理 |
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日本医療研究開発機構（AMED） 循環器疾患・糖尿病等生活習慣病対策実用化研究事業 | 心房細動・重篤合併症予防を実現する多層的・統合的エビデンス創出研究 |
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日本医療研究開発機構（AMED） ゲノム医療実現バイオバンク利活用プログラム | 全ゲノム解析と組織オミックス解析による心房細動の病態解明と精密医療 |
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日本医療研究開発機構（AMED） ゲノム医療実現バイオバンク利活用プログラム | マルチオミックス連関による循環器疾患における次世代型精密医療の実現 |
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日本医療研究開発機構（AMED） 難治性疾患実用化研究事業 | 難治性心血管疾患におけるマルチオミックス解析による病態解明と精密医療 |
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日本医療研究開発機構（AMED） 生命科学・創薬研究支援基盤事業 | 生体試料を用いた大規模機能ゲノミクス解析支援及びヒト免疫機能評価基盤の高度化 |
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日本医療研究開発機構（AMED） 革新的がん医療実用化研究事業 | 23がん種14万人を用いた遺伝・環境・生活習慣を統合した各個人の疾患リスクの推定 |
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日本医療研究開発機構（AMED） ゲノム研究バイオバンク事業 | 利活用を目的とした日本疾患バイオバンクの運営・管理 |
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文部科学省 科学技術試験研究委託事業費 | オーダーメイド医療の実現プログラム（第3期） | N/A |
日本医療研究開発機構（AMED） オーダーメイド医療の実現プログラム | 疾患関連遺伝子等の探索を効率化するための遺伝子多型情報の高度化 |
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日本医療研究開発機構（AMED） 次世代がん医療創生研究事業（P-CREATE） | 大規模シーケンス解析に基づく、造血器腫瘍のゲノム、エピゲノムにおける、空間的・時間的多様性の研究 |
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関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
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制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| Mark Daly | Broad Institute of MIT and Harvard | アメリカ合衆国 (マサチューセッツ州) | BioBank Japan (BBJ) Dataset | 2018-09-11 – 2028-07-31 | |
| 岡田 随象 | 遺伝統計学, 大阪大学大学院医学系研究科 | 日本 | 日本人由来B細胞株DNAのゲノムデータを用いた遺伝統計解析手法の研究 | 2018-09-20 – 2029-03-31 | |
| 上辻 茂男 | 統計解析事業部, 株式会社スタージェン | 日本 | 開発薬X投与による副作用発症の遺伝的要因の探索 | 2018-10-04 – 2019-08-29 | |
| 徳永 勝士 | 人類遺伝学分野, 東京大学大学院医学系研究科 | 日本 | 日本人大規模全ゲノム情報を基盤とした多因子疾患関連遺伝子の同定を加速する情報解析技術の開発と応用 | 2018-11-13 – 2027-03-31 | |
| 角田 達彦 | 難治疾患研究所・医科学数理分野, 東京医科歯科大学 | 日本 | オーダーメイド医療のためのビッグデータ解析に関する研究 | 2018-12-18 – 2021-06-18 | |
| Liming Liang | Department of Epidemiology, Harvard T.H. Chan School of Public Health | アメリカ合衆国 (マサチューセッツ州) | Genetic effect, genetic correlation and interaction with environmental exposure for complex traits and diseases across populations | 2019-01-21 – 2028-12-31 | |
| 長崎 正朗 | ゲノム解析部門バイオメディカル情報解析分野, 東北大学東北メディカル・メガバンク機構 | 日本 | 日本人大規模全ゲノム情報を基盤とした多因子疾患関連遺伝子の同定を加速する情報解析技術の開発と応用 | 2019-01-31 – 2021-03-17 | |
| 小川 誠司 | 腫瘍生物学講座, 京都大学大学院医学研究科 | 日本 | 固形腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析 | 2019-02-04 – 2021-07-30 | |
| 上辻 茂男 | 統計解析事業部, 株式会社スタージェン | 日本 | 斜視の遺伝的要因の探索のためのゲノムワイド関連研究 | 2019-03-13 – 2022-03-29 | |
| 河野 隆志 | ゲノム生物学研究分野, 国立研究開発法人国立がん研究センター研究所 | 日本 | ゲノム解析に基づく宿主並びに腫瘍における免疫応答ネットワーク機構の解明 | 2019-04-15 – 2029-03-31 | |
| 堀江 重郎 | 泌尿器科学講座, 順天堂大学 | 日本 | 血液細胞のY染色体モザイクロスに伴う疾患リスク解析 | 2019-05-14 – 2029-03-31 | |
| 角田 達彦 | 生物科学専攻医科学数理研究室, 東京大学大学院理学系研究科 | 日本 | オーダーメイド医療のためのシーケンス、画像データなどの解析に関する研究 | 2019-06-06 – 2023-08-29 | |
| 山本 雅之 | 東北メディカル・メガバンク機構, 東北大学 | 日本 | 日本人全ゲノムデータベースの構築 | 2019-06-24 – 2022-04-15 | |
| 白石 航也 | ゲノム生物学研究分野, 国立研究開発法人国立がん研究センター研究所 | 日本 | ゲノム解析に基づく宿主並びに腫瘍における免疫応答ネットワーク機構の解明 | 2019-08-05 – 2029-03-31 | |
| 上辻 茂男 | 統計解析事業部, 株式会社スタージェン | 日本 | 尿酸代謝に関連する遺伝子を操作変数としたメンデル無作為化解析 | 2019-08-16 – 2024-03-13 | |
| 上辻 茂男 | 統計解析事業部, 株式会社スタージェン | 日本 | 網羅的な臨床検査値のメンデル無作為化解析 | 2019-08-22 – 2024-03-13 | |
| 小笠原 理 | 生命情報・DDBJセンター, 国立遺伝学研究所 | 日本 | JGA/AGD ゲノムデータを利用したヒトゲノム解析ワークフローの評価 | 2019-10-11 – 2024-07-05 | |
| 小川 誠司 | 医学研究科, 京都大学 | 日本 | 造血器腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析 | 2019-11-14 – 2024-07-11 | |
| 岡﨑 康司 | 大学院医学研究科難治性疾患診断・治療学, 順天堂大学 | 日本 | 疾患コホート研究ネットワークによる疾患マーカー探索研究 | 2020-06-04 – 2023-06-30 | |
| 秦 千比呂 | 生命情報・DDBJセンター, 国立遺伝学研究所 | 日本 | 日本人乳癌患者シーケンスデータにおけるhypomorphic変異同定 | 2020-06-04 – 2028-03-31 | |
| 河合 洋介 | ゲノム医科学プロジェクト, 国立国際医療研究センター | 日本 | ヤポネシア人の起源をさぐるための現代人ゲノム塩基配列の大規模解析 | 2020-06-19 – 2028-03-31 | |
| 岩田 仲生 | 医学部精神神経科学, 藤田医科大学 | 日本 | 遺伝子解析によるこころの健康とこころの病気に対するかかりやすさ（発症脆弱性）や薬の効きめや副作用（治療反応性）等の解明に関する研究 | 2020-08-17 – 2024-07-22 | |
| Charleston Chiang | Center for Genetic Epidemiology, Keck School of Medicine, University of Southern California | アメリカ合衆国 (カリフォルニア州) | Investigating the evolution of complex genetic architecture in participants of Biobank Japan | 2022-03-03 – 2030-07-01 | |
| Hae Kyung Im | Biological Sciences Division, University of Chicago | アメリカ合衆国 (イリノイ州) | Predicted Gene Expression: High Power, Mechanism, and Direction of Effect | 2020-09-15 – 2023-11-06 | |
| Atray Dixit | Coral Genomics, Inc. | アメリカ合衆国 (カリフォルニア州) | Derivation and Evaluation of Functional Response Scores | 2020-08-24 – 2022-01-17 | |
| 上辻 茂男 | 統計解析事業部, 株式会社スタージェン | 日本 | ステント血栓症発症の遺伝的要因の探索のためのゲノムワイド関連研究 | 2022-03-07 – 2025-02-17 | |
| 中山 一大 | 先端生命科学専攻, 東京大学大学院新領域創成科学研究科 | 日本 | 褐色脂肪組織活性に寄与するゲノム多型の探索 | 2022-03-07 – 2027-09-18 | |
| 莚田 泰誠 | ファーマコゲノミクス研究チーム, 理化学研究所 生命医科学研究センター | 日本 | 小麦アレルギーの遺伝子多型解析 | 2021-03-26 – 2028-03-31 | |
| Zhao Hongyu | Department of Biostatistics, Yale School of Public Health | アメリカ合衆国 | Leveraging multi-ethnic data and functional annotations in casual variant identification, genetic correlation estimation, and genetic risk prediction | 2024-12-25 – 2030-03-01 | |
| FUJIO KEISHI | アレルギー・リウマチ内科, 東京大学大学院医学系研究科 | 日本 | 日本人免疫細胞eQTLデータと日本人大規模GWASデータの統合解析 | 2020-12-16 – 2026-09-29 | |
| 菊地 正隆 | 大学院医学系研究科, 大阪大学 | 日本 | 日本人リファレンスパネルを用いたゲノムデータ補完 | 2020-12-16 – 2022-10-03 | |
| 松田 文彦 | 附属ゲノム医学センター, 京都大学大学院医学研究科 | 日本 | 日本人の遺伝的多様性の解明（G751-5） | 2021-02-08 – 2025-03-31 | |
| 恵美子 野口 | 医学医療系, 国立大学法人筑波大学 | 日本 | アレルギー疾患における遺伝要因の探索研究 | 2021-03-26 – 2032-03-31 | |
| Gil McVean | King Charles House, Genomics plc | イギリス | Development of polygenic risk scores in diverse ancestries for diseases, traits and conditions | 2022-07-19 – 2025-06-17 | |
| 長﨑 正朗 | 大学院医学研究科附属ゲノム医学センター 学際融合教育研究推進センター, 京都大学 | 日本 | 日本人大規模全ゲノム情報を基盤とした多因子疾患関連遺伝子の同定を加速する情報解析技術の開発と応用（ゲノム情報解析技術開発） | 2021-04-01 – 2024-08-23 | |
| 佐藤 憲子 | 分子疫学, 東京医科歯科大学難治疾患研究所 | 日本 | 地域コホート縦断データに基づく肥満・糖尿病発症・進行の遺伝・環境リスクの解析 | 2021-04-13 – 2022-03-17 | |
| 河野 隆志 | ゲノム生物学研究分野, 国立研究開発法人国立がん研究センター研究所 | 日本 | AYA(Adolescence and Young Adult)世代がんの個別化予防に資する遺伝要因の同定を目指す研究 | 2021-05-26 – 2028-12-31 | |
| 藤本 明洋 | 大学院医学系研究科人類遺伝学教室, 東京大学 | 日本 | 全ゲノムシークエンスデータの解析による突然変異・遺伝的多様性・転写異常の包括的解析 | 2021-09-21 – 2024-12-02 | |
| 永田 安伸 | 血液内科, 日本医科大学 | 日本 | 新たな遺伝学的異常を用いた造血器腫瘍発症メカニズムの探索 | 2021-06-08 – 2026-03-31 | |
| 川上 純 | リウマチ・膠原病内科, 長崎大学病院 | 日本 | 免疫チェックポイント阻害薬ニボルマブが誘発する1型糖尿病、間質性肺疾患の発症に関連する原因遺伝子多型・変異の探索的研究 | 2021-06-16 – 2024-04-02 | |
| 朝野 仁裕 | 大学院医学系研究科循環器内科学, 大阪大学 | 日本 | 遺伝性心血管疾患の感受性遺伝子解析研究 | 2021-07-26 – 2027-05-31 | |
| 増子 裕典 | 呼吸器内科, 筑波大学 | 日本 | 炎症性肺疾患の遺伝素因に関する研究 | 2021-08-16 – 2027-03-31 | |
| 河野 隆志 | ゲノム生物学研究分野, 国立研究開発法人国立がん研究センター研究所 | 日本 | AYA(Adolescence and Young Adult)世代がんの個別化予防に資する遺伝要因の同定を目指す研究 | 2021-09-28 – 2028-12-31 | |
| 松田 文彦 | 附属ゲノム医学センター, 京都大学大学院医学研究科 | 日本 | オーダーメイド医療開発プロジェクト | 2021-09-16 – 2028-03-31 | |
| 松田 喬 | アドバンストインフォマティクス＆アナリティクス室, アステラス製薬株式会社 | 日本 | 肝がん並びにB型肝炎発症と遺伝子多型の相関に関する検討 | 2021-11-11 – 2022-08-01 | |
| 有田 正規 | 生命情報・DDBJ センター, 国立遺伝学研究所 | 日本 | DDBJ センターと NBDC による JGA 解析データの提供 | 2021-10-07 – 2030-03-31 | |
| 恵美子 野口 | 医学医療系遺伝医学, 筑波大学 | 日本 | 食物アレルギーの発症要因の解明 | 2021-12-08 – 2029-03-31 | |
| Joshua Chiou | Internal Medicine Research Unit, Pfizer | アメリカ合衆国 (マサチューセッツ州) | Evaluating GWAS associations from Biobank Japan to Support Confidence in Rationale for Therapeutic Targets | 2022-02-03 – 2025-12-21 | |
| 河合 洋介 | 人癌病因遺伝子分野, 東京大学医科学研究所 | 日本 | 集団遺伝学的解析による日本人集団のなりたちの解析 | 2021-12-15 – 2026-01-22 | |
| 有田 正規 | 生命情報・DDBJ センター, 国立遺伝学研究所 | 日本 | 個人ゲノム解析環境における imputation 解析の解析プログラム開発および実行環境構築 | 2021-11-29 – 2030-03-31 | |
| 二宮 利治 | 大学院医学研究院 衛生・公衆衛生学分野, 九州大学 | 日本 | 健康長寿社会の実現を目指した大規模認知症コホート研究（JPSC-AD） | 2021-12-13 – 2029-07-31 | |
| 中岡 博史 | 腫瘍ゲノム研究部, 公益財団法人佐々木研究所 | 日本 | 大規模シーケンスデータを用いた乳がん関連遺伝子における活性低下型変異の研究 | 2022-08-18 – 2026-07-23 | |
| Gil McVean | King Charles House, Genomics plc | イギリス | Using large-scale reference panels for imputation and ancestry analysis to support target discovery and polygenic risk score models | 2022-08-04 – 2025-07-23 | |
| 野口 恵美子 | 医学医療系遺伝医学, 筑波大学 | 日本 | 炎症性肺疾患の遺伝素因に関する研究 | 2022-09-21 – 2027-03-31 | |
| 山崎 慶子 | 公衆衛生学, 千葉大学大学院医学研究院 | 日本 | 炎症性腸疾患における分子標的薬の効果予測システムの構築 | 2022-11-15 – 2030-03-31 | |
| Nuria Lopez-Bigas | Biomedical Genomics Lab Cancer Science, Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona) | スペイン | Study of the genetic basis of clonal hematopoiesis | 2022-11-08 – 2027-09-12 | |
| 菊地 正隆 | 大学院新領域創成科学研究科, 東京大学 | 日本 | 日本人リファレンスパネルを用いたゲノムデータ補完 | 2022-10-03 – 2025-10-09 | |
| 鬼頭 良輔 | 医学部 耳鼻咽喉科頭頸部外科, 信州大学 | 日本 | 突発性難聴の発症・治療効果に関する遺伝子解析 | 2022-12-22 – 2027-03-31 | |
| 由良 敬 | 基幹研究院自然科学系, お茶の水女子大学 | 日本 | がん抑制遺伝子BRCA1バリアントの表現型予測に関するデータ解析研究 | 2023-03-17 – 2028-03-31 | |
| 上辻󠄀 茂男 | 統計解析事業部, 株式会社スタージェン | 日本 | 斜視の遺伝的要因の検証のためのゲノムワイド関連研究 | 2023-02-14 – 2027-02-28 | |
| 尾内 善広 | 公衆衛生学, 千葉大学大学院医学研究院 | 日本 | 川崎病の関連遺伝子解析に関する多施設共同研究 | 2023-04-06 – 2030-03-31 | |
| 尾内 善広 | 公衆衛生学, 千葉大学大学院医学研究院 | 日本 | 新型コロナワクチンへの抗体応答の個人差の遺伝的背景に関する研究 | 2023-04-24 – 2030-03-31 | |
| 加藤 正樹 | 精神神経科, 関西医科大学 | 日本 | 精神疾患個別化治療アルゴリズムの構築を目的とする生物学的反応因子の探索・検証試験 | 2023-08-25 – 2028-06-30 | |
| 木村 大樹 | 精神医学分野, 名古屋大学大学院医学系研究科 | 日本 | 遺伝子解析による脳とこころの病気に対するかかりやすさ（発症脆弱性）や薬の効きめや副作用（治療反応性）等の解明に関する研究 | 2023-11-17 – 2028-10-28 | |
| 三嶋 博之 | 原爆後障害医療研究所 ゲノム機能解析部門 人類遺伝学研究分野, 長崎大学 | 日本 | ヒト全ゲノムシークエンシングにおけるバッチ効果軽減方法の開発 | 2024-04-16 – 2027-03-31 | |
| 持田 泰寛 | 腎臓病総合医療センター, 湘南鎌倉総合病院 | 日本 | 日本人におけるクローン性造血と慢性腎臓病進展への関連に関する 後ろ向きコホート研究 | 2024-02-07 – 2027-03-31 | |
| 寺尾 知可史 | ゲノム解析応用研究チーム, 理化学研究所生命医学研究センター | 日本 | ゲノミクス情報を基盤とした個別化医療の研究 | 2023-11-21 – 2026-07-10 | |
| 寺尾 知可史 | 臨床研究部 免疫研究部, 静岡県立総合病院 | 日本 | ヒト形質関連遺伝因子に関する研究 | 2024-04-25 – 2028-12-03 | |
| 長﨑 正朗 | 生体防御医学研究所附属高深度オミクスサイエンスセンターバイオメディカル情報解析分野, 九州大学 | 日本 | 日本人大規模全ゲノム情報を基盤とした多因子疾患関連遺伝子の同定を加速する情報解析技術の開発と応用（ゲノム情報解析技術開発） | 2024-06-24 – 2027-03-31 | |
| 松田 浩一 | クリニカルシークエンス分野, 東京大学 | 日本 | 疾患コホート研究ネットワークによる疾患マーカー探索研究 | 2024-06-17 – 2029-03-31 | |
| 加藤 規弘 | 遺伝子診断治療開発研究部, 国立国際医療研究センター | 日本 | 原発性アルドステロン症の遺伝素因とその臨床的意義に関する研究 | 2024-06-24 – 2029-03-31 | |
| 白石 航也 | 臨床ゲノム解析部門, 国立がん研究センター研究所 | 日本 | 肺がんの個別化予防に資する遺伝要因の同定を目指す研究 | 2024-06-24 – 2025-12-15 | |
| 莚田 泰誠 | ファーマコゲノミクス研究チーム, 理化学研究所 生命医科学研究センター | 日本 | 薬疹関連遺伝子の探索 | 2024-08-01 – 2028-03-31 | |
| 中杤 昌弘 | 大学院医学系研究科 実社会情報健康医療学, 名古屋大学 | 日本 | 筋萎縮性側索硬化症の発症・進行・予後に関与する因子の探索 | 2024-08-27 – 2030-03-31 | |
| 有田 正規 | 生命情報・DDBJ センター, 国立遺伝学研究所 | 日本 | DDBJセンターとDBCLSによるJGA登録データの加工と公開 | 2025-04-28 – 2030-03-31 | |
| 大野 敦司 | 大学院 医系科学研究科 消化器内科学, 広島大学 | 日本 | 肝疾患の課題解決にむけたゲノム情報の活用 | 2025-06-25 – 2034-03-31 | |
| 白石 航也 | 臨床ゲノム解析部門, 国立がん研究センター研究所 | 日本 | AYA(Adolescence and Young Adult)世代がんの個別化予防に資する遺伝要因の同定を目指す研究 | 2025-05-02 – 2026-04-07 | |
| 三宅 正裕 | 医学研究科眼科学教室, 京都大学 | 日本 | 眼科領域疾患の遺伝子研究 | 2025-06-02 – 2027-03-31 | |
| 加藤 規弘 | 遺伝子診断治療開発研究部, 国立国際医療研究センター | 日本 | 緑内障に関する日本人でのポリジェニックリスクスコアの臨床活用に向けた研究 | 2025-11-17 – 2030-03-31 | |
| 中島 拓 | 分子内科学, 広島大学 | 日本 | 肺の線維化とクローン性造血の関連についての検討 | 2025-12-11 – 2028-03-31 | |
| Jian Huang | Institute for Human Development and Potential (IHDP), Agency for Science, Technology and Research (A*STAR) | シンガポール | Multi-omic causal inference strategy for drug repurposing and pharmacovigilance across the lifespan | 2026-04-13 – 2028-03-31 | |
| 中岡 博史 | データサイエンス分野, 鹿児島大学大学院医歯学総合研究科 | 日本 | 大規模シーケンスデータを用いた乳がん関連遺伝子における活性低下型変異の研究 | 2026-04-13 – 2030-03-31 | |
| 石川 泰輔 | 共同獣医学部, 鹿児島大学 | 日本 | 不整脈症候群の遺伝子基盤に関する研究 | 2026-08-05 – 2029-03-31 | |
| 橋本 亮太 | 精神保健研究所 精神疾患病態研究部, 国立精神・神経医療研究センター | 日本 | 生物学的なデータに基づく精神神経疾患の新たな診断分類と病態解明に関する探索的研究 | 2026-09-10 – 2028-07-31 | |
| 寺尾 知可史 | 研究推進本部 ゲノミクス医学センター, 藤田医科大学 | 日本 | 統合ゲノミクス情報を基盤とした個別化医療の研究 | 2026-09-03 – 2036-03-31 | |
| 菊地 正隆 | 脳研究所, 新潟大学 | 日本 | 日本人リファレンスパネルを用いたゲノムデータ補完解析 | 2026-09-10 – 2028-03-31 |