データセット ID
NHA000031
- データの種類
- 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報
（JSNPのデータ） - アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 11.8 MB
- ファイル形式
- XLSX
- ZIP
- 研究
- hum0014
- 公開日
- 2015-12-28
- 更新日
- 2015-12-28
- Secondary ID
- hum0014.v2.jsnp.lc.v1
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0014.v2.jsnp.lc.v1.zip | 肺がん | 11.8 MB | |
| hum0014_ | Dictionary file | 10.8 KB |
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
- 悪性腫瘍 （肺がん、乳がん、胃がん、大腸・直腸がん、前立腺がん）
心血管系疾患 （心不全、心筋梗塞，不安定狭心症、安定狭心症、不整脈、閉塞性動脈硬化症）
脳血管障害 （脳梗塞、脳動脈瘤）
呼吸器疾患 （間質性肺炎＆肺線維症、肺気腫、気管支喘息）
慢性肝疾患 （C型慢性肝炎、肝硬変）
眼疾患 （白内障、緑内障）
その他 （てんかん、歯周病、尿路結石、ネフローゼ症候群、子宮筋腫、子宮内膜症、
骨粗鬆症、関節リウマチ、筋萎縮性側索硬化症、花粉症、アトピー性皮膚炎、
過敏性症候群（薬疹）、高脂血症、糖尿病、バセドウ病）
各約190症例 - 健康状態罹患
- 対象者数6650 (人数)
- 試料説明
- 末梢血から抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- N/A
- プラットフォーム
- Perlegen Sciences high-density oligonucleotide arrays
- QC・フィルタリング
- N/A
- 解析方法
- N/A
- バリアント数
- 200,000 SNPs (約 b129)