データ利用方法はこちらをご覧下さい。

Research ID研究題目公開日データの種類研究方法手法

参加者

(対象集団)

提供者アクセス制限

hum0001.v1

JGAS000002

SCA31罹患患者のゲノム解析データ

v1:2013/12/01

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

SCA31:1症例

(日本人)

森下 真一

制限(Type I)

hum0003.v1

DRA000908

関節リウマチ患者及び健常人における

HLA領域の塩基配列比較解析

v1:2013/07/01

NGS

(Target Capture)

HLA領域

配列決定

Illumina

(MiSeq)

33検体

(細胞株)

井ノ上 逸朗

非制限公開

hum0004.v1

JGAS000001

上皮成長因子受容体遺伝子異変を有する

肺腺癌の体細胞性遺伝子変異プロファイル

解明のための分子疫学的研究

v1:2014/07/11

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(Genome Analyzer IIx)

肺腺癌:97症例

(日本人)

後藤 功一

制限(Type I)

hum0005.v8

DRA001273

JGAS000032

DRA003791

JGAS000093

JGAS000123

JGAS000166

JGAS000191

JGAS000192

JGAS000200

JGAS000201

JGAS000323

JGAS000490

難聴の遺伝子解析と臨床応用に関する研究

v1:2014/01/27

v2:2017/02/24

v3:2017/06/19

v4:2018/02/13

v5:2019/04/18

v6:2021/07/30

v7:2021/11/19

v8:2023/10/02

NGS

(Target Capture)

9遺伝子領域

69遺伝子領域

90遺伝子領域

63遺伝子領域

配列決定

Thermo Fisher Scientific

(Ion PGM、Ion Proton、Ion S5)

Illumina

(HiSeq 2000)

Usher症候群:17症例

非症候群性難聴:3,156症例

(日本人)

宇佐美 真一

非制限公開

制限(Type I)

hum0006.v5

JGAS000004

JGAS000106

JGAS000146

JGAS000325

脳腫瘍のゲノム・遺伝子解析と

その臨床病理学的意義の解明

v1:2014/01/31

v2:2017/06/05

v3:2017/09/01

v4:2019/02/13

v5:2022/08/08

NGS

(Exome、RNA-seq、Target Capture)

メチル化アレイ

配列決定

発現

メチル化

Illumina

(HiSeq 2000/2500、HumanMethylation450)

脳腫瘍:6症例+16症例

グリオーマ(小脳:17症例、視床:14症例、大脳:8症例)

グリオーマ:94症例

脳海綿状血管奇形:12症例

椎体血管腫:1症例

眼窩内海綿状血管奇形:3症例

(日本人)

斉藤 延人

(P-DIRECT)

制限(Type I)

hum0007.v1

JGAS000005

ヒトTh17細胞の活性化前後の遺伝子発現

v1:2015/02/12

NGS

(RNA-seq)

発現

Applied BioSystems

(5500 Genetic Analyzer)

健常者:1名

(日本人)

巌本 三壽

制限(Type I)

hum0008.v1

JGAS000007

ヒルシュスプルング病および

ヒルシュスプルング類縁疾患の

遺伝要因および発症機構解明に関する研究

v1:2018/01/29

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

ヒルシュスプルング:5症例

家族:6例

(日本人)

松藤 凡

制限(Type I)

hum0009.v3

DRA003802

ヒト初期発生にかかわる細胞の

DNAメチル化解析基盤研究

v1:2014/12/24

v2:2015/01/07

v3:2015/08/03

NGS

(PBAT-seq)

メチル化シトシン同定

Illumina

(HiSeq 2000/2500)

11検体

(日本人)

有馬 隆博

非制限公開

hum0010.v1

JGAS000008

脾類上皮嚢腫関連遺伝子の探索

v1:2015/06/23

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

脾類上皮嚢腫:8症例

(日本人)

松藤 凡

制限(Type I)

hum0011.v1

JGAS000015

B型肝炎ウイルスのヒトゲノム内組み込み

によるエピジェネティックな修飾

v1:2015/10/07

NGS

(Target Capture)

HBV組込部位

配列決定

Roche GS FLX Titanium

2検体(セルライン)

HBV感染肝癌:8症例

(日本人)

山本 博幸

制限(Type I)

hum0012.v1

JGAS000012

ながはま0次コホート事業

v1:2015/08/19

SNP-chip

ゲノムワイド関連

健常者遺伝子型

Illumina

(Human610-Quad、HumanOmni2.5-4/2.5-8/2.5S-8、HumanExome-12、HumanCoreExome-12)

健常者:3712名

(日本人)

松田 文彦

制限(Type I)

hum0013.v1

日本PGxデータサイエンスコンソーシアム

PGx研究のための日本人健常者2994名の

SNP遺伝子型データ

v1:2014/10/16

SNP-chip

ゲノムワイド

健常者内頻度

Illumina

(HumanOmni2.5-8)

健常者:2994名

(日本人)

末松 浩嗣

非制限公開

hum0014.v33

JGAS000101

JGAS000114*

JGAS000140

JGAS000203

JGAS000293

JGAS000327

JGAS000346

JGAS000381*

JGAS000414

JGAS000347

JGAS000592

JGAS000647

JGAS000698

JGAS000699

JGAS000700

JGAS000701

JGAS000703

オーダーメイド医療の実現プログラム

v1:2014/09/30

v2:2015/12/28 (JSNP)

v3:2016/01/10

v4:2016/01/27

v5:2017/05/18

v6:2017/09/08

v7:2018/04/04

v8:2018/05/01

v9:2018/08/07

v10:2018/08/13

v11:2018/10/16

v12:2018/12/10

v13:2019/01/25

v14:2019/03/26

v15:2019/09/27

v16:2019/10/07

v17:2019/10/08

v18:2019/11/26

v19:2020/04/20

v20:2020/08/17

v21:2020/08/25

v22:2021/05/21

v23:2021/07/13

v24:2021/11/26

v25:2022/01/25

v26:2022/04/01

v27:2023/01/18

v28:2023/04/05

v29:2023/04/05

v30:2023/04/20

v31:2023/09/01

v32:2024/01/11

v33:2024/05/27

SNP-chip

NGS

(WGS、Target Capture)

ゲノムワイド

関連

配列決定

Illumina

(Human610-Quad, HumanHap550v3, HumanOmniExpress-12, HumanExome, OmniExpressExome, HumanExome-12, Infinium OmniExpress-24, Infinium HumanOmniExpressExome-8, HiSeq 2500/X Five)

Perlegen Sciences

(high-density oligonucleotide array)

Hologic Japan

(Invader)

v1:心筋梗塞1666症例、対照3198名

v2:健常者934名(JSNP)

v2:35疾患各約190症例(JSNP)

v2:食道癌182症例(JSNP)

v2:ALS92症例(JSNP)

v3:T2DM9817症例、対照6763名

v3:T2DM5646症例、対照19,420名

v4:AD1472症例、対照7966名

v5:AF8180症例、対照28,612名

v6:BMI158,284名

v6:Genotypeデータ182,505名

v7:POAG3980症例、対照18,815名

v8:58臨床検査値162,255名

v9:初潮年齢データを有する女性67,029名

v9:閉経年齢データを有する女性43,861名

v10:BBJ第1コホート1,026名

v11:乳癌7,104症例、対照23,731名

v12:2型糖尿病腎症2,809症例、2型糖尿病対照5,592名

v13:T2DM36,614症例、対照155,150名

v14:喫煙習慣データ165,436名

v15:BBJ第1コホート1,037名、1000ゲノムプロジェクト(Phase3v5)2,504名

v15:身長159,095名

v16:遺伝性前立腺癌7,636症例、対照12,366名

v17、v18、v21:42疾患212,453症例

v19:食習慣165,084名

v20:冠動脈疾患25,892症例、対照142,336名

v22:BBJ第1コホート11,234名

v23:BBJ第1コホート768名

v24:膵癌1,005症例、大腸癌12,503症例、対照23,705名

v25:心筋梗塞1,765症例、認知症199症例

v26:腎がん740症例、対照者5,996名

v27:BBJ第1コホート137,693名

v28:BBJ第1コホート4,880名

v29:AF8,180症例、対照28,612名(BBJ第1コホート)

         AF60,620症例、対照970,216名(欧米人)

         AF7,244症例、対照56,378名(FinnGen)

v30:リンパ腫1,982症例、胃がん10,366症例、対照者37,592名(BBJコホート)

v32:BBJ第1コホート1,007名

v33:胃癌256症例

v33:51疾患26.9万名

v33:大腸癌617症例

v33:糖尿病2,162症例

v33:胃癌2,067症例

(日本人、欧米人、フィンランド人)

久保 充明

非制限公開

制限(Type I)

hum0015.v3

JGAS000159

ヒト全ゲノム解析に基づく高精度の

住民ゲノム参照パネルの作成

v1:2014/10/14

v2:2018/12/27

v3:2019/01/11

NGS

(WGS)

ゲノムワイド

健常者内頻度

Illumina

(HiSeq 2500)

健常者:3552名

(日本人)

山本 雅之

非制限公開

hum0016.v1

DRA002604

精巣に発現するタンパク質群の

ヒト精子細胞における発現及び染色体局在解析

v1:2016/09/30

NGS

(RNA-seq、ChIP-seq)

発現

ヒストン修飾

Illumina

(HiSeq 1500)

健常者:1名(4検体)

(日本人)

大川 恭行

非制限公開

hum0017.v1

JGAS000021

中枢神経原発悪性リンパ腫のエクソーム解析

v1:2016/02/22

NGS

(Exome、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 2000)

PCNSL:41症例

(日本人)

間野 博行

制限(Type I)

hum0018.v1

JGAS000009

神経筋変性疾患の遺伝子解析研究

v1:2015/02/03

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

神経筋変性疾患:14症例

対照:7名

(日本人)

辻 省次

制限(Type I)

hum0019.v1

JGAS000011

消化器癌の発癌や進展に

深く関与しうる遺伝子、並びに

非コードRNAの量的・質的な異常の探索

v1:2015/04/01

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(HiSeq 2500)

消化器癌:17症例(32検体)

(日本人)

篠村 恭久

(ゲノム支援)

制限(Type I)

hum0020.v1

JGAS000013

筋萎縮性側索硬化症の遺伝子解析研究

v1:2015/01/08

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

家族性ALS:11症例

(日本人)

田中 章景

(ゲノム支援)

制限(Type I)

hum0021.v3

JGAS000014

JGAS000273

精神神経疾患の原因解明および

診断法・治療法の開発に関する研究

v1:2015/01/26

v2:2021/03/05

v3:2021/04/20

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000/2500)

健常一卵性双生児:3組6名

双極性障害発症者およびその両親(トリオ):66+78家系(198+234名)

(日本人)

加藤 忠史

(ゲノム支援)

制限(Type I)

hum0022.v1

JGAS000017

同種造血幹細胞移植後

ドナー由来白血病発症にかかわる

分子機構の解析

v1:2015/02/02

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

白血病:1症例

ドナー:1名

(日本人)

清井 仁

(P-DIRECT)

制限(Type I)

hum0023.v1

JGAS000016

生活習慣病、動脈硬化性疾患、ならびに

抗加齢に関する遺伝疫学研究

v1:2015/01/28

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

III度以上の本態性

高血圧:30症例

(日本人)

三木 哲郎

(ゲノム支援)

制限(Type I)

hum0024.v1

JGAS000023

造血器腫瘍における

遺伝子異常の網羅的解析

v1:2015/04/16

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(Genome Analyzer IIx、HiSeq 2000/2500)

MDS:13症例

CMML:1症例

(日本人)

小川 誠司

(P-DIRECT)

制限(Type I)

hum0027.v1

JGAS000024

JGAS000040

侵襲性歯周炎のヒト全ゲノム解析と遺伝子多型解析

v1:2016/07/28

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

侵襲性歯周炎:44症例

(日本人)

村上 伸也

制限(Type I)

hum0028.v2

JGAS000018

オーダーメイド医療の実現プログラム

v1:2015/06/02

v2:2018/06/05

SNP-chip

HLA領域

HLAアリルおよび

領域内遺伝子型決定

Illumina

(HumanOmniExpress、HumanExome、Immunochip、HumanHap550v3 Genotyping BeadChip)

健常者:908名

(日本人)

久保 充明

(BBJ)

制限(Type I)

hum0029.v2

Stevens-Johnson症候群に対する

遺伝子多型解析

v1:2016/03/09

v2:2020/12/21

SNP-chip

ゲノムワイド関連

Affymetrix

(Axiom ASI)

Illumina

(HiSeq X Ten)

SJS:117症例

対照:691名

SJS/TEN:133症例

対照:418名

(日本人)

上田 真由美

(ゲノム支援)

非制限公開

hum0030.v3

JGAS000022

JGAS000560

婦人科臓器に発生する悪性腫瘍の発症に関連する分子生物学的異常の検索

v1:2015/04/21

v2:2024/05/10

v3:2024/07/05

SNP-chip

NGS

(Exome、RNA-seq)

メチル化アレイ

ヒト全ゲノム発現アレイ

ゲノムワイド

CNV

配列決定

発現

メチル化

Affymetrix

(Human Mapping 250K Nsp Array、GeneChip® Human Genome U133 Plus 2.0 Array)

Illumina

(HiSeq 2000、Infinium HumanMethylation450)

卵巣癌:57+111+31症例

(日本人)

織田 克利

(P-DIRECT)

制限(Type I)

hum0031.v1

JGAS000042

JGAS000043

JGAS000044

JGAS000045

磁気共鳴画像装置で得られた脳画像の臨床評価尺度データベース構築と多施設による共同運用

v1:2015/11/20

脳画像

臨床情報

脳画像ベースの病態解明

Philips

(Achieva)

統合失調症:37症例

単極うつ病:8症例

双極性障害:2症例

健常者:129名

(日本人)

笠井 清登

非制限公開

制限(Type I)

hum0032.v1

JGAS000026

JGAS000027

JGAS000028

ヒト消化器ならびに泌尿器上皮細胞の

標準エピゲノム解析

(HPCシリーズ)

v1:2016/07/22

NGS

(PBAT-seq、ChIP-seq、RNA-seq)

発現

メチル化

ヒストン修飾

Illumina

(HiSeq 2000/2500)

肝細胞:8種類

(日本人)

金井 弥栄

(IHEC)

制限(Type I)

hum0033.v1

DRA003516

ヒト唾液由来エキソソームの

機能解析に関する研究

v1:2015/05/01

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(Genome Analyzer IIx)

健常者:1名(3検体)

(日本人)

矢ノ下 良平

非制限公開

hum0034.v1

JGAS000037

小細胞肺癌の網羅的ゲノム解析による

新たな治療標的の探索を目指した研究

v1:2015/10/01

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

SCLC:51症例

(日本人)

後藤 功一

(P-DIRECT)

制限(Type I)

hum0035.v5

JGAS000036

JGAS000046

JGAS000088

JGAS000188

JGAS000204

JGAS000246

固形腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析

v1:2015/09/16

v2:2017/12/26

v3:2020/05/29

v4:2020/12/14

v5:2020/12/18

NGS

(Exome、Target Capture、RNA-seq)

SNP-chip

メチル化アレイ

配列決定

発現

ゲノムワイド関連

メチル化

Illumina

(HiSeq 2000/2500、MiSeq、MethylationEPIC)

Affymetrix

(Human Mapping 250K Nsp、CytoScan HD)

RMS:16症例

PPB:7症例

NB:522症例

NB細胞株:39検体

PBL:10症例

HBL:59症例

HBL細胞株:2検体

小児胚細胞腫瘍:51症例

小児高リスク神経芽腫:30症例

(日本人)

滝田 順子

(P-DIRECT)

制限(Type I)

hum0036.v1

DRA003736

全エクソームキャプチャプラットフォーム間の

性能比較

v1:2015/08/01

NGS

(Exome)

キャプチャ方法の性能比較

Illumina

(HiSeq 2500)

HapMap-JPT:2検体

(日本人)

久保 充明

非制限公開

hum0037.v1

JGAS000035

関節リウマチ感受性遺伝子を用いた

関節リウマチ病態の遺伝診断法の開発研究

v1:2015/09/24

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

RA:39症例

対照:10名(Pooled)

(日本人)

光永 滋樹

(ゲノム支援)

制限(Type I)

hum0038.v1

JGAS000041

家族性致死性不整脈の病因解明

v1:2015/11/18

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

家族性致死性不整脈:11症例

(日本人)

蒔田 直昌

(ゲノム支援)

制限(Type I)

hum0039.v1

JGAS000039

消化管間質腫瘍のチロシンキナーゼ阻害剤に

対する獲得耐性機構の解明

v1:2016/12/27

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 1500)

イマチニブ耐性消化管間質腫瘍:4症例

(日本人)

高橋 剛

制限(Type I)

hum0040.v1

JGAS000038

生殖発生に関わる細胞のエピゲノム解析基盤研究

v1:2016/09/16

NGS

(WGS、Exome、RNA-seq、WGBS)

配列決定

発現

メチル化

Illumina

(HiSeq 2500)

ヒト胎盤:28検体

母体血:26検体

(日本人)

有馬 隆博

(IHEC)

制限(Type I)

hum0041.v1

JGAS000052

肝胆膵癌の早期発見、進行、予後予測、

治療効果予測に関わる因子の研究

v1:2017/01/12

NGS

(Exome、Target Capture)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

原発性肝細胞癌:33症例

(日本人)

田中 真二

(P-DIRECT)

制限(Type I)

hum0042.v1

顎口腔領域の形質(性質や特徴)

に関与する遺伝子の探索

v1:2016/03/02

SNP-chip

ゲノムワイド関連

Illumina

(HumanOmniExpress)

変性顎関節症:146症例

非罹患:374名

第三大臼歯先天性欠如有:149症例

無欠如:338名

(日本人、韓国人)

山口 徹太郎

(ゲノム支援)

制限(Type I)

hum0043.v1

JGAS000051

アルツハイマー病総合診断体系実用化プロジェクト

(J-ADNI全国臨床研究)

v1:2016/01/29

脳画像

臨床情報

脳画像ベースの病態解明

MRIスキャナー(15機種)

PETスキャナー(16機種)

MCI:234名

AD:149名

健常高齢者群:154名

(日本人)

岩坪 威

非制限公開

制限(Type I)

hum0044.v1

DRA004162

ヒトレトロウイルス感染症に関する研究

v1:2016/10/31

NGS

(ChIP-seq)

ヒストン修飾

Illumina

(NextSeq 500)

ATL細胞株:1検体

(細胞株)

佐藤 賢文

非制限公開

hum0045.v1

JGAS000047

思春期・若年成人急性リンパ芽球性白血病におけるトランスクリプトーム解析

v1:2016/03/29

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(HiSeq 2000/2500)

フィラデルフィア染色体陰性ALL:99症例

フィラデルフィア染色体陽性ALL:3症例

セルライン:5検体

正常血球細胞:8検体

(日本人)

間野 博行

(P-DIRECT)

制限(Type I)

hum0048.v1

DRA004251

次世代シークエンサーを用いた十二指腸・ファーター乳頭部腫瘍の全遺伝子のエクソン解析

v1:2016/02/05

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000/2500)

ファーター乳頭部癌:60症例

(日本人、米国人)

谷内田 真一

非制限公開

hum0050.v1

JGAS000053

B型肝炎創薬へ向けてのトランスクリプトーム解析による病態解明と標的同定

v1:2016/09/30

NGS

(CAGE-seq)

転写開始点同定

Illumina

(HiSeq 2000)

HBVキャリア:8症例

(日本人)

松浦 知和

制限(Type I)

hum0053.v2

JGAS000062

JGAS000176

悪性中皮腫のプロファイリングによる新規分子標的の同定

v1:2016/07/20

v2:2020/04/14

NGS

(Exome、WGS)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000/2500)

10x Genomics

(Chromium Controller)

悪性胸膜中皮腫:38症例

(日本人)

中野 孝司

(P-DIRECT)

制限(Type I)

hum0055.v1

JGAS000059

非アルコール性脂肪肝疾患のゲノム・エピゲノム解析

v1:2017/02/20

NGS

(RNA-seq)

メチル化アレイ

発現

メチル化

Illumina

(HiSeq 2500、HumanMethylation450)

NAFLD:64症例

(日本人)

堀田 紀久子

(ゲノム支援)

制限(Type I)

hum0056.v1

ヒト全ゲノム解析に基づく高精度の住民ゲノム参照パネルと3層オミックスパネルの作成

v1:2018/03/30

NGS

(WGS、WGBS、RNA-seq)

配列決定

メチル化

発現

Illumina

(HiSeq 2500/X)

197名

(日本人)

清水 厚志

非制限公開

hum0058.v1

JGAS000091

大腸がんの転移/再発に特徴的な遺伝子変異の同定

v1:2018/04/06

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

大腸癌:89症例

(日本人)

山口 俊晴

(P-DIRECT)

制限(Type I)

hum0059.v1

JGAS000104

卵巣がんの再発に特徴的な遺伝子変異の同定

v1:2018/04/06

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

卵巣癌:65症例

(日本人)

加藤 一喜

(P-DIRECT)

制限(Type I)

hum0060.v1

JGAS000075

乳がんの再発/転移に特徴的な遺伝子変異の同定

v1:2018/04/03

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

再発・転移性乳癌:65症例

(日本人)

三木 義男

(P-DIRECT)

制限(Type I)

hum0061.v1

JGAS000057

全ゲノムあるいは全エクソン解析による家族性腫瘍原因遺伝子の同定

v1:2017/02/20

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

多発性肺癌同胞:2症例

(日本人)

加藤 菊也

制限(Type I)

hum0064.v1

JGAS000061

高齢者がん治療アルゴリズム開発のためのガイドポスト・データベースの構築と必須情報及びその推定モデル

v1:2016/08/26

*サンガー

TaqMan

qRT-PCR

マイクロアレイ

COBRA

治療情報

臨床情報

配列決定

発現

メチル化

Applied BioSystems

(3130 Genetic Analyzer)

Roche

(LightCycler 480II)

Agilent Technologies

(Whole Human Genome DNAマイクロアレイ 4x44K)

【ゲノム】

大腸癌:106症例

胃癌:62症例

肺癌:173症例

【後向き】

大腸癌:313 症例

胃癌:166 症例

肺癌:344 症例

糖尿・腎障害:300 症例

循環器疾患:357 症例

呼吸器疾患:49 症例

(日本人)

西山 正彦

制限(Type I)

hum0065.v1

JGAS000089

患者腫瘍移植モデルとex vivo培養間のシャトルシステムによる革新的な臨床効果評価技術の開発

v1:2018/04/06

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

大腸癌:8症例

肺癌:2症例

子宮頸部小細胞癌:2症例

(日本人)

井上 正宏

(P-DIRECT)

制限(Type I)

hum0066.v1

JGAS000060

癌の再発・転移に関与するnon-coding RNAの同定とその機序の解明

v1:2016/08/01

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

大腸癌:9症例

(日本人)

三森 功士

制限(Type I)

hum0067.v1

JGAS000076

卵巣明細胞腺癌に対する新規バイオマーカーの検索と化学療法感受性に関する後方視的検討

v1:2017/05/18

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

卵巣明細胞腺癌:55症例

(日本人)

杉山 徹

(P-DIRECT)

制限(Type I)

hum0068.v9

JGAS000065*

JGAS000349

JGAS000570

JGAS000677

ゲノム解析に基づく肺がんの発生・進展の分子機構の解明

v1:2017/07/10

v2:2020/10/19

v3:2021/12/14

v4:2022/03/23

v5:2022/12/27

v6:2023/02/10

v7:2023/06/19

v8:2023/09/22

v9:2024/04/10

NGS

(PCR amplicon Seq、WGS、RNA-seq、scDNA-seq、Target Capture、Visium Spatial Gene Expression)

病理画像

Multiplex Fluorescence Immunostaining

Xenium In Situ Gene Expression

配列決定

発現

病理画像

Nanopore

(MinION、PromethION)

Illumina

(NovaSeq 6000、HiSeq 2000)

Akoya Biosciences

(PhenoCycler)

10x Genomics

(Xenium Analyzer)

肺腺癌:8+21+74+20症例

(日本人)

河野 隆志

制限(Type I)

hum0069.v1

JGAS000064

神経筋疾患、ウイルス性疾患におけるRNA発現プロファイル解析

v1:2016/12/09

NGS

(small RNA-seq)

発現

Illumina

(HiSeq 2500)

神経筋疾患:3症例

(日本人)

横田 隆徳

制限(Type I)

hum0070.v1

JGAS000115

バート・ホッグ・デュベ症候群の分子病態解明と新規の診断マーカーおよび治療標的分子の探索研究

v1:2018/05/11

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

バート・ホッグ・デュベ症候群:15症例

(日本人)

矢尾 正祐

(P-DIRECT)

制限(Type I)

hum0072.v1

ナルコレプシーおよび各種睡眠障害の感受性遺伝子の同定と機能解析

v1:2017/12/26

SNP-chip

ゲノムワイド関連

Affymetrix

(SNP Array 6.0)

ナルコレプシー:409症例

対照:1562名

真性過眠症:125症例

対照:562名

(日本人)

徳永 勝士

非制限公開

hum0074.v2

テーラーメイド治療を目指した肝炎ウイルスデータベース構築に関する研究

v1:2018/02/27

v2:2018/09/25

SNP-chip

ゲノムワイド関連

Affymetrix

(SNP Array 6.0、Axiom ASI)

NVR:78症例

VR:64症例

SVR:51症例

Plt減少-:196症例

Plt減少+:107症例

Hb減少-:209症例

Hb減少+:94症例

SVR後肝癌を発症した群:123症例

SVR後肝癌を発症していない群:333症例

(日本人)

田中 靖人

非制限公開

hum0075.v3

B型肝炎ウイルス感染の病態別における宿主遺伝因子の探索研究

v1:2017/09/25

v2:2019/02/19

v3:2022/05/27

SNP-chip

ゲノムワイド関連

Affymetrix

(SNP Array 6.0、Axiom ASI)

HBV保有:181症例

HBV排除:185症例

対照:184名

HBV陽性肝癌:473症例

HBV保有(慢性肝炎患者および無症候キャリア):516症例

(日本人)

B型肝炎:329症例

健常対照者:318名

(タイ人)

溝上 雅史

非制限公開

hum0076.v1

日本人原発性胆汁性肝硬変の発症・進展に関わる遺伝因子の網羅的遺伝子解析

v1:2016/10/05

SNP-chip

ゲノムワイド関連

Affymetrix

(Axiom ASI)

PBC:487症例

対照:476名

(日本人)

中村 稔

非制限公開

hum0079.v1

JGAS000068

神経筋変性疾患の遺伝子解析研究

v1:2022/02/18

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(HiSeq 2500)

封入体筋炎:53症例

多発筋炎:6症例

対照者:9名

(日本人)

後藤 順

(ゲノム支援)

制限(Type I)

hum0082.v2

JGAS000120

日本人健常者におけるゲノム全域のSNP解析

v1:2017/09/26

v2:2017/10/03

SNP-chip

ゲノムワイド

健常者遺伝子型

Affymetrix

(SNP Array 6.0、Axiom ASI)

419名

(日本人)

徳永 勝士

非制限公開

制限(Type I)

hum0083.v2

JGAS000070

JGAS000488

バイオマーカー探索に資する網羅的遺伝子解析研究(肺がん)

v1:2016/10/28

v2:2022/01/24

NGS

(CAGE-seq)

転写開始点同定

Illumina

(HiSeq 2500)

肺癌:97+38症例

胸膜中皮腫:10症例

(日本人)

林崎 良英

制限(Type I)

hum0085.v2

JGAS000108

胸腹部腫瘍の長期治療成績に関する分子生物学的研究

環境因子が関与する腫瘍のゲノム解析

v1:2017/10/16

v2:2018/09/25

アレイCGH

NGS(WGS、Target Capture、Exome)

配列決定

Illumina

(MiSeq、HiSeq 4000/X Ten)

悪性中皮腫患:72症例

(日本人、米国人)

大村谷 昌樹

制限(Type I)

hum0086.v3

JGAS000073
(JGA000074)

JGAS000107
(JGA000117)

生殖発生にかかわる細胞のエピゲノム解析基盤研究

v1:2017/09/25

v2:2017/12/26

v3:2018/06/26

NGS(PBAT-seq、ChIP-seq、RNA-seq、small RNA-seq)

発現

メチル化

ヒストン修飾

Illumina

(HiSeq 1500/2500)

胎盤もしくは子宮の細胞、ヒト胎盤幹細胞:計39検体

(日本人)

佐々木 裕之

(IHEC)

制限(Type I)

hum0088.v2

JGAS000077

JGAS000096

腫瘍細胞におけるTGF-βファミリーシグナルの網羅的解析

v1:2019/02/08

v2:2019/09/10

NGS

(RNA-seq、WGS)

発現

配列決定

Illumina

(Genome Analyzer IIx)

Thermo Fisher Scientific

(Ion Proton)

脳腫瘍:2症例

(日本人)

宮園 浩平

制限(Type I)

hum0090.v1

JGAS000078

JGAS000079

JGAS000080

ヒト消化器ならびに泌尿器上皮細胞の

標準エピゲノム解析

(COCシリーズ)

v1:2016/11/18

NGS

(PBAT-seq、ChIP-seq、RNA-seq)

発現

メチル化

ヒストン修飾

Illumina

(HiSeq 2000/2500)

大腸粘膜吸収上皮細胞:12種類

(日本人)

金井 弥栄

(IHEC)

制限(Type I)

hum0091.v1

JGAS000082

JGAS000165

JGAS000081

ヒト消化器ならびに泌尿器上皮細胞の

標準エピゲノム解析

(GACシリーズ)

v1:2021/03/12

NGS

(PBAT-seq、ChIP-seq、RNA-seq)

発現

メチル化

ヒストン修飾

Illumina

(HiSeq 2000/2500)

胃粘膜表層粘液細胞:14種類

(日本人)

金井 弥栄

(IHEC)

制限(Type I)

hum0094.v11

JGAS000095

JGAS000105

JGAS000113

JGAS000128

JGAS000215

JGAS000270

JGAS000297

JGAS000335

JGAS000360

JGAS000534

悪性腫瘍のゲノム・エピゲノム解析による病態解明

v1:2017/09/04

v2:2018/01/22

v3:2019/02/12

v4:2020/08/14

v5:2020/10/26

v6:2021/01/29

v7:2021/07/02

v8:2021/10/22

v9:2021/10/26

v10:2022/05/23

v11:2022/11/08

NGS

(WGS、Exome、RNA-seq、Target Capture、Iso-seq)、メチル化アレイ、SNP-chip

配列決定

発現

メチル化

CNV

Illumina

(HiSeq 2000/2500、MethylationEPIC、HumanOmni2.5-8)

10x Genomics

(Chromium Controller)

PacBio

(Sequel)

乳癌:68症例

肺腺癌:43+126症例

大腸癌:150症例+173症例

肝転移を有する大腸癌12症例、肝転移を有さない大腸癌16症例

デスモイド腫瘍:64症例

肺多形癌:35症例

唾液腺導管癌:67症例

(日本人)

間野 博行

制限(Type I)

hum0095.v1

JGAS000092

大腸前がん病変および早期大腸がんにおける遺伝子解析および発がん機序の解明

v1:2018/07/30

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

大腸腺腫、大腸癌早期病変:計10症例

(日本人)

三森 功士

制限(Type I)

hum0096.v2

JGAS000090

JGAS000138

造血器腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析(小児T細胞性急性リンパ性白血病)

v1:2017/05/25

v2:2019/11/18

NGS

(RNA-seq)

メチル化アレイ

発現

メチル化

Illumina

(HiSeq 2500、MethylationEPIC)

小児T-ALL:123症例

(日本人)

滝田 順子

制限(Type I)

hum0097.v1

JGAS000094

骨髄不全症候群における血球の質に関する検討

v1:2018/05/25

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

第6染色体短腕の片親性ダイソミー陽性再生不良性貧血:5症例

(日本人)

中尾 眞二

(ゲノム支援)

制限(Type I)

hum0099.v1

JGAS000085

ヒト免疫細胞における遺伝子多型と遺伝子発現の関連解析

v1:2017/04/24

NGS

(RNA-seq)

SNP-chip

eQTL

発現

ゲノムワイド関連

Illumina

(HiSeq 2500、Infinium OmniExpressExome)

健常者:105名

(日本人)

山本 一彦

非制限公開

制限(Type I)

hum0101.v1

JGAS000098

EBウイルス関連リンパ腫を発症した原発性免疫不全症候群の原因遺伝子探索に関する研究

v1:2018/05/11

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(MiSeq)

原発性免疫不全症:2症例

(日本人)

岩谷 靖雅

制限(Type I)

hum0103.v4

JGAS000109

JGAS000389

シークエンス解析によるがんゲノム研究:胆道がん

v1:2018/02/27

v2:2019/06/21

v3:2021/07/13

v4:2022/01/18

NGS

(WGS、Exome、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 2000/2500、NovaSeq 6000)

胆道癌:98+121症例

正常胆嚢:4名

(日本人)

中川 英刀

制限(Type I)

hum0106.v1

JGAS000139

ヒト大腸がん培養組織を用いたがん予防・治療法の開発

v1:2022/09/05

NGS

(scRNA-seq)

発現

Illumina

(HiSeq 2500)

大腸癌:3症例

(患者由来3次元培養細胞)

(日本人)

八尾 良司

(ゲノム支援)

制限(Type I)

hum0107.v2

JGAS000099

JGAS000218

基底細胞母斑症候群患者からのinduced pluripotent stem (iPS)細胞の樹立および病態の解明、骨移植への臨床応用

v1:2017/10/02

v2:2020/06/01

NGS

(Exome、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 2500/4000)

基底細胞母斑症候群:4症例

(日本人)

東 俊文

制限(Type I)

hum0108.v1

JGAS000111

精神疾患発症にかかわる関連遺伝子の探索および解析

v1:2017/06/26

メチル化アレイ

メチル化

Illumina

(HumanMethylation450)

パニック症:48症例

対照健常者:48名

(日本人)

徳永 勝士

制限(Type I)

hum0111.v3

JGAS000103

JGAS000141

JGAS000242

胃腫瘍のゲノム・遺伝子解析とその臨床病理学的意義の解明

v1:2017/07/31

v2:2019/05/31

v3:2021/02/19

NGS

(RNA-seq、Amplicon-seq)

発現

Illumina

(HiSeq 2000、MiSeq)

びまん性胃癌:30症例

胃癌:60+15症例

(日本人)

石川 俊平

制限(Type I)

hum0112.v1

JGAS000112

(JGA000122)

ヒト胎盤幹細胞の樹立と細胞特性に関する基礎的研究

v1:2017/12/14

NGS(PBAT-seq、ChIP-seq、RNA-seq、miRNA-seq)

発現

メチル化

ヒストン修飾

Illumina

(HiSeq 1500/2500)

ヒト胎盤幹細胞:2系統

(日本人)

有馬 隆博

制限(Type I)

hum0113.v3

JGAS000119

JGAS000142

JGAS000318

パーキンソン病の代謝産物バイオマーカー創出およびその分子標的機構に基づく創薬シーズ同定

v1:2020/04/24

v1:2021/07/30

v3:2022/07/29

NGS

(CAGE-seq)

転写開始点同定

Illumina

(HiSeq 2500)

パーキンソン病:39症例、対照健常者:20名

iPS細胞由来神経細胞(パーキンソン病:3検体、対照健常者:3検体から樹立)

(日本人)

Piero Carninci

制限(Type I)

hum0114.v3

DRA007411

JGAS000314

日本人由来B細胞株DNAのゲノムデータを用いた遺伝統計解析手法の研究

v1:2017/12/18

v2:2019/04/12

v3:2021/08/10

SNP-chip

NGS

(Target Capture)

ゲノムワイド関連

配列決定

Illumina

(HumanCoreExome、MiSeq、HiSeq X Ten、NovaSeq)

乾癬:282症例

対照:426名

細胞株:1,173検体

(日本人)

岡田 随象

非制限公開

制限(Type I)

hum0115.v1

JGAS000121

DRA006296

動的遺伝子ネットワークの多次元構造解析による高精度な細胞分化制御技術の開発

v1:2020/05/15

NGS

(RNA-seq)

マイクロアレイ

発現

Illumina

(HiSeq 2000/2500)

Agilent Technologies

(SurePrint G3 Human GE 8x60K v2 Microarray、SureScan G4900DA)

SEES3にTFを導入して樹立したES細胞株(TF-hESC)

(細胞株)

洪 実

非制限公開

制限(Type I)

hum0116.v1

JGAS000122

ヒト化マウス(humanized mouse)の作製と免疫学研究への応用

v1:2020/11/20

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(HiSeq 1500/2500)

急性骨髄性白血病:118症例

(日本人)

石川 文彦

制限(Type I)

hum0117.v1

JGAS000125

神経変性疾患のエピジェネティクス解析

v1:2017/12/11

メチル化アレイ

メチル化

Illumina

(HumanMethylation450)

アルツハイマー病:30症例

対照健常者:30名

(日本人)

岩田 淳

制限(Type I)

hum0118.v1

JGAS000124

バイオマーカー探索に資する網羅的遺伝子解析研究(子宮体がん)

v1:2017/12/11

NGS

(CAGE-seq)

Sanger-seq

転写開始点同定

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

Thermo Fisher Scientific(3500 Genetic Analyzer)

子宮体癌:17症例

(日本人)

林崎 良英

制限(Type I)

hum0119.v1

JGAS000126

NASHの発症、進展を規定するメカニズム解析

v1:2019/01/31

SNP-chip

ゲノムワイド関連

Illumina

(Human610-Quad、HumanCoreExome、HumanOmni2.5-Quad BeadChip)

NAFLD患者:902症例

対照健常者:7672名

(日本人)

松田 文彦

制限(Type I)

hum0120.v4

JGAS000221

DRA011183

DRA011184

DRA011185

E-GEAD-396

DRA010902

JGAS000549

消化器癌患者の末梢血液中における転移再発の予測因子候補に関する臨床的意義の確立

v1:2020/04/03

v2:2020/10/30

v3:2021/12/06

v4:2022/07/29

NGS

(Exome、RNA-seq、Target Capture、WGBS)

メチル化アレイ

配列決定

発現

メチル化

Illumina

(HiSeq 2500、iScan、HiSeq X Ten)

大腸癌:10+25+10症例

胃癌:16症例

乳癌:16症例

(日本人)

三森 功士

非制限公開

制限(Type I)

hum0122.v1

DRA006622

DRA007336

DRA008459

E-GEAD-311

市販ヒト初代細胞由来iPS 細胞のゲノム変異解析

v1:2020/01/14

NGS

(WGS)

SNP-chip

配列決定

ゲノムワイド

Illumina

(HiSeq X Ten、Infinium Omni2.5-8)

市販のヒト培養細胞、およびそれから誘導したiPS細胞株:計27検体

(細胞株)

荒木 良子

非制限公開

hum0124.v1

JGAS000129

ヒト上皮成長因子受容体(EGFR)遺伝子変異をもつ肺癌家系における肺癌発癌関連遺伝子同定に関する研究

v1:2018/04/06

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

EGFR遺伝子変異をもつ肺癌:3症例(1家系)

(日本人)

菊地 利明

制限(Type I)

hum0125.v1

JGAS000127

制御性T細胞特異的エピゲノム誘導による免疫制御の研究

v1:2018/11/05

NGS

(RNA-seq)

発現

Thermo Fisher Scientific

(Ion S5)

クローン病:3症例

大腸癌:4症例(非腫瘍組織)

(日本人)

坂口 志文

制限(Type I)

hum0126.v2

小児ネフローゼ症候群の疾患感受性遺伝子及び薬剤感受性遺伝子同定研究

v1:2018/04/27

v2:2020/09/01

SNP-chip

ゲノムワイド関連

Affymetrix

(Japonica Array v1/v2)

小児ネフローゼ症候群:224+3,206症例

対照健常者:419+987名

(日本人)

飯島 一誠

非制限公開

hum0127.v4

JGAS000130

JGAS000274

JGAS000604

JGAS000715

マルチオーミクス解析を用いたがん患者評価に基づく個別化治療と新技術開発に関する研究ープロジェクトHOPE(High-tech Omics-based Patients Evaluation)for Cancer Therapyー

v1:2020/04/14

v2:2021/03/08

v3:2024/01/22

v4:2024/07/10

NGS

(Exome、DNA Amplicon-seq、RNA Amplicon-seq、WGS)

マイクロアレイ

メチル化アレイ

配列決定

発現

Thermo Fisher Scientific

(Ion Proton)

Agilent Technologies

(SurePrint G3 Human Gene Expression 8 × 60 K v2 Microarray、 DNA Microarray Scanner)

Illumina

(NovaSeq 6000、Infinium MethylationEPIC array、iScan System)

POLE変異および高変異症例の癌:91症例

癌:5143+7症例

(日本人)

山口 建

制限(Type I)

hum0128.v1

JGAS000153

慢性好酸球性炎症疾患の網羅的遺伝子解析と網羅的蛋白質解析に関する研究

v1:2018/10/29

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(HiSeq 2000)

慢性副鼻腔炎:6症例

(日本人)

藤枝 重治

制限(Type I)

hum0129.v1

JGAS000131

神経疾患患者からのiPS細胞の樹立とそれを用いた疾患解析に関する研究

v1:2018/04/06

NGS

(ChIP-seq)

ヒストン修飾

Illumina

(HiSeq 2500)

CHARGE症候群:2症例

(日本人)

岡野 栄之

制限(Type I)

hum0130.v3

JGAS000150

JGAS000289

POEMS症候群の骨髄細胞における遺伝子異常の網羅的解析

造血器腫瘍と骨髄ニッチ細胞の遺伝子異常解析による分子病態の解明と新規治療薬開発の基盤構築

v1:2019/01/18

v2:2022/09/27

v3:2024/06/17

NGS

(Exome、Target Capture、RNA-seq、scRNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 1500/2000/2500/3000、MiSeq)

POEMS症候群:20+14症例

多発性骨髄腫:4+5症例

MGUS:5+2症例

骨髄浸潤のない悪性リンパ腫:4+3症例

(日本人)

堺田 恵美子

制限(Type I)

hum0131.v1

JGAS000132

発達障害のエピゲノム解析

v1:2018/11/20

NGS

(RNA-seq)

発現

Thermo Fisher Scientific

(Ion Proton)

Williams症候群:6症例

対照健常者:8名

(日本人)

木村 亮

制限(Type I)

hum0132.v1

JGAS000137

ベトナムにおけるダイオキシン関連疾患のゲノムシークエンス解析

v1:2018/09/07

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

ダイオキシン暴露者(退役軍人)とその妻と知的障害を持つ子の9トリオ(計27名)

(ベトナム人)

中川 英刀

制限(Type I)

hum0133.v1

JGAS000086

胃がんの転移/再発に特徴的な遺伝子変異の同定

v1:2018/04/06

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

胃癌:75症例

(日本人)

山口 俊晴

(P-DIRECT)

制限(Type I)

hum0134.v1

JGAS000087

Bリンパ腫の転移/再発に特徴的な遺伝子変異の同定

v1:2018/04/06

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

Bリンパ腫:60症例

(日本人)

山口 俊晴

(P-DIRECT)

制限(Type I)

hum0136.v3

JGAS000341

B型肝炎に関する統合的臨床ゲノムデータベースの構築を目指す研究

v1:2018/05/22

v2:2021/03/05

v3:2021/10/01

SNP-chip

ゲノムワイド関連

Affymetrix

(Axiom ASI)

B型肝炎ワクチン接種者(ビームゲン):1,193名

B型肝炎ワクチン接種者(ヘプタバックス):555名

(日本人)

溝上 雅史

非制限公開

制限(Type I)

hum0137.v1

JGAS000144

1型糖尿病関連遺伝子群の多施設共同研究

v1:2018/12/21

NGS

(Target Capture)

配列決定

Thermo Fisher Scientific

(Ion Proton)

1型糖尿病:32症例

(日本人)

池上 博司

制限(Type I)

hum0138.v2

JGAS000134

固形腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析

v1:2020/07/31

v2:2021/03/26

NGS

(Exome、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(Hiseq 2500/4000)

肝硬変:10症例

肝癌:4症例

健常者:7名

(日本人)

高井 淳

制限(Type I)

hum0139.v1

JGAS000136

疾患特異的iPS細胞を用いた創薬・疾患研究

v1:2018/07/10

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 1500)

RALD患者:1症例

(日本人)

大津 真

制限(Type I)

hum0140.v1

JGAS000158

microRNA/mRNA網羅的発現解析及び全エクソンシークエンス解析に基づく直腸癌術前治療効果予測法の開発

v1:2019/11/19

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

術前放射線化学療法施行直腸癌:74症例

(日本人)

秋吉 高志

制限(Type I)

hum0141.v1

JGAS000135

制御性T細胞特異的エピゲノム誘導による免疫制御の研究

v1:2019/05/09

NGS

(RNA-seq)

発現

Thermo Fisher Scientific

(Ion S5)

頭頸部癌:4症例

(日本人)

坂口 志文

制限(Type I)

hum0144.v1

JGAS000147

造血器腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析(ダウン症候群患者におけるB前駆細胞性急性リンパ性白血病)

v1:2020/01/10

NGS

(RNA-seq)

メチル化アレイ

SNP-chip

発現

メチル化

ゲノムワイド

Illumina

(HiSeq 2000/2500、Infinium MethylationEPIC BeadChip、Infinium HumanMethylation450 BeadChip)

Affymetrix

(Human Mapping 250K Nsp、CytoScan HD)

ダウン症候群患者のB前駆細胞性急性リンパ性白血病:43症例

(日本人)

滝田 順子

制限(Type I)

hum0145.v1

JGAS000222

消化器癌患者の末梢血液中における転移再発の予測因子候補に関する臨床的意義の確立

v1:2020/04/03

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

大腸癌:10症例

(日本人)

三森 功士

制限(Type I)

hum0146.v1

DRA007187

先天性インプリント異常症の診断と生殖医療の安全性評価

v1:2019/02/19

NGS

(RRBS)

メチル化

Illumina

(HiSeq 2500)

生殖補助医療を受けたSRS患者:5症例

生殖補助医療を受けていないSRS患者:5症例

対照健常児:10名

(日本人)

有馬 隆博

非制限公開

hum0147.v3

JGAS000145

JGAS000312

JGAS000454

制御性T細胞特異的エピゲノム誘導による免疫制御の研究

v1:2020/05/25

v2:2022/02/18

v3:2023/05/08

NGS

(RNA-seq、ChIP-seq、PBAT-seq、ATAC-seq、scRNA-seq)

発現

メチル化

ヒストン修飾

クロマチン構造

Thermo Fisher Scientific

(Ion S5)

Illumina

(HiSeq 2500/3000/4000、NovaSeq 6000)

健常人:4+1名

がん患者:7+3症例

(日本人)

坂口 志文

制限(Type I)

hum0148.v1

JGAS000149

泌尿器科腫瘍組織での遺伝子異常と発現解析

v1:2019/06/20

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(Genome Analyzer IIx)

腎癌:67症例

(日本人)

湯浅 健

制限(Type I)

hum0152.v2

JGAS000182

JGAS000529

ゲノム・プロテオーム解析に基づく骨軟部腫瘍の分子病態把握とその臨床応用を目指す多施設共同研究

v1:2019/09/20

v2:2022/11/15

NGS

(WGS、Exome、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 2500、NovaSeq 6000)

脱分化型脂肪肉腫:37症例

lipoblastoma-like tumor of the vulva:1症例

(日本人)

市川 仁

制限(Type I)

hum0153.v1

JGAS000177

希少腫瘍の発症・予後に関する遺伝子の網羅的解析研究

v1:2019/09/20

NGS

(Exome、RNA-seq、Target Capture)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 2500、MiSeq)

脱分化型脂肪肉腫:28症例

腱鞘巨細胞種:36症例

(日本人)

松田 浩一

制限(Type I)

hum0156.v1

JGAS000227

次世代シークエンサーを用いた遺伝子統合解析による食道癌化学放射線療法耐性の解明

v1:2021/07/30

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

食道癌:33症例

(日本人)

三森 功士

制限(Type I)

hum0157.v1

JGAS000164

がんのクリニカルシークエンスと付随研究としての網羅的ゲノム・エピゲノム解析

v1:2019/08/19

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(NextSeq)

癌:183症例

(日本人)

宮園 浩平

制限(Type I)

hum0158.v3

JGAS000151

シークエンス解析によるがんゲノム研究:肝臓がん

v1:2018/10/22

v2:2019/06/21

v3:2021/07/13

NGS

(WGS、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 2000、Genome Analyzer IIx、NovaSeq 6000)

肝臓癌:263症例

(日本人)

中川 英刀

制限(Type I)

hum0159.v2

JGAS000157*

シークエンス解析によるがんゲノム研究:大腸がん

v1:2021/06/01

v2:2022/12/27

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

大腸癌:10症例

(日本人)

中川 英刀

制限(Type I)

hum0160.v2

JGAS000155

シークエンス解析によるがんゲノム研究:食道がん

v1:2019/05/28

v2:2021/07/13

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000/2500/X Five)

食道癌:20症例

(日本人)

中川 英刀

制限(Type I)

hum0161.v2

JGAS000156*

シークエンス解析によるがんゲノム研究:肝芽腫

v1:2021/06/04

v2:2022/12/27

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

肝芽腫:33症例

(日本人)

中川 英刀

制限(Type I)

hum0163.v3

精神・神経疾患治療薬及びがん治療薬におけるファーマコゲノミクス研究

v1:2018/12/14

v2:2021/02/09

v3:2023/04/21

NGS

(Target Capture)

SNP-chip

配列決定

ゲノムワイド関連

Illumina

(MiSeq、Infinium OmniExpressExome)

精神・神経疾患及び癌:計990症例

水疱性類天疱瘡:90症例

対照健常者(日本人由来B細胞株):737検体

(日本人)

莚田 泰誠

非制限公開

hum0164.v1

JGAS000160

東北メディカル・メガバンク事業地域住民コホート調査

v1:2018/12/14

SNP-chip

ゲノムワイド関連

Illumina

(Infinium OmniExpressExome-8)

住民コホートに参加した9,187名

(日本人)

長﨑 正朗

制限(Type I)

hum0165.v1

JGAS000162

家族性骨髄異形成症候群の遺伝子解析研究

v1:2019/05/07

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

家族性骨髄異形成症候群:2症例(1家系)

(日本人)

古屋 淳史

制限(Type I)

hum0166.v2

炎症性腸疾患患者におけるチオプリン関連副作用とNUDT15遺伝子多型との相関性に関する多施設共同研究(MENDEL Study)

v1:2019/07/30

v2:2024/01/25

SNP-chip

ゲノムワイド関連

Affymetrix

(Japonica Array v1)

炎症性腸疾患:1221+2680症例

(日本人)

角田 洋一

非制限公開

制限(Type I)

hum0167.v1

痛風・高尿酸血症及び尿酸関連疾患の病態解明に関する研究

v1:2019/07/23

SNP-chip

ゲノムワイド関連

Illumina

(HumanOmniExpressExome-8、Human660W-Quad、HumanOmni2.5-8、HumanOmniExpress-12、HumanOmniExpress-24、HumanOmniExpressExome、HumanOmniExpress、HumanExome)

日本人コホート(J-MICC study、KING study、BBJ):計121,745名

(日本人)

松尾 洋孝

非制限公開

hum0168.v1

JGAS000169

悪性腫瘍のゲノム・エピゲノム解析による病態解明

v1:2019/11/08

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

子宮腺筋症:51症例

(日本人)

河津 正人

制限(Type I)

hum0169.v2

JGAS000178

脳脊髄腫瘍のバイオマーカーの探索と標的治療開発に向けた遺伝子解析及びヒト由来脳脊髄腫瘍細胞株を用いた前臨床研究

v1:2019/06/01

v2:2020/07/17

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

中枢神経原発悪性リンパ腫:9症例

(日本人)

山本 哲哉

制限(Type I)

hum0173.v1

JGAS000171

胎児期に始まる子どもの健康と発達に関する調査

v1:2019/04/23

NGS

(RRBS)

メチル化

Illumina

(NextSeq)

臍帯組織(正常出産):30検体

(日本人)

森 千里

制限(Type I)

hum0174.v6

JGAS000173

JGAS000580

JGAS000286

JGAS000505

JGAS000596

日本人ゲノム構造変異データベースの作成

v1:2020/10/06

v2:2020/11/27

v3:2023/06/29

v4:2023/07/06

v5:2023/07/10

v6:2023/12/28

NGS

(WGS)

配列決定

PacBio

(Sequel、Sequel II)

10x Genomics

(Chromium Controller)

Nanopore

(PromethION)

日本人由来B細胞株・DNAバンクから分譲されたDNAサンプル:10+11+177+141+30検体

森下 真一

制限(Type I)

hum0175.v2

JGAS000174

JGAS000642

治療抵抗性・再発予測バイオマーカーならびに新規分子標的治療法開発のための婦人科腫瘍検体の収集、保管ならびにゲノム・エピゲノム解析

v1:2019/10/02

v2:2024/03/01

NGS

(Exome、Target Capture)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

子宮類内膜腺癌:69症例

子宮内膜増殖症:30症例

(日本人)

竹島 信宏

制限(Type I)

hum0176.v1

JGAS000172

子宮及び卵巣がん肉腫におけるドライバー変異の体系的探索

v1:2019/10/02

NGS

(Exome、Target Capture)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

子宮癌肉腫:92症例

卵巣癌肉腫:17症例

(日本人)

森 誠一

制限(Type I)

hum0177.v1

JGAS000197

脳腫瘍の悪性化に関与する遺伝子の解析

v1:2020/04/27

NGS

(PBAT-seq、RNA-seq、ChIP-seq)

発現

メチル化

ヒストン修飾

Illumina

(HiSeq X Ten、NovaSeq 6000)

悪性神経膠腫:14症例

(日本人)

伊藤 隆司

制限(Type I)

hum0179.v1

JGAS000186

DRA009794

薬剤関連顎骨壊死における口腔内微生物叢メタゲノム解析

v1:2020/04/03

メタゲノム

メタゲノム

Nanopore

(PromethION)

Illumina

(HiSeq)

健常者:4名

(日本人)

矢原 耕史

(ゲノム支援)

非制限公開

制限(Type I)

hum0180.v1

JGAS000170

RNAスプライシングの異常によって生じる先天異常症候群および先天代謝異常症等の遺伝子解析と低分子化合物によるその治療法の開発研究

v1:2021/03/12

NGS

(RNA-seq)

発現

Thermo Fisher Scientific

(Ion Proton)

家族性自律神経異常症:2症例

網代 将彦

制限(Type I)

hum0181.v1

副腎皮質におけるアルドステロン産生の老化の解明

v1:2019/09/25

病理スライドガラス画像

病理画像

Dako

(Autostainer Link 48)

病理解剖を施行された50歳以上の症例:85症例

(日本人)

西本 紘嗣郎

非制限公開

hum0182.v5

JGAS000180

DRA008482

JGAS000516

全ゲノムシークエンスデータの解析による変異と遺伝的多様性の包括的解析

v1:2019/06/20

v2:2020/05/12

v3:2021/01/06

v4:2021/11/12

v5:2022/05/27

NGS

(WGS、RNA-seq)

配列決定

発現

Nanopore

(MinION)

Illumina

(HiSeq 2000、Genome Analyzer IIx)

肝臓癌(正常細胞):174+42症例

肝臓癌(腫瘍組織):11+42症例

HapMap:1検体

(日本人)

乳癌細胞株:1検体

(細胞株)

藤本 明洋

非制限公開

制限(Type I)

hum0184.v2

JGAS000239

日本人全ゲノムデータベースの構築

v1:2020/09/01

v2:2022/02/18

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500、NovaSeq 6000)

一般住民:4,566名

(日本人)

山本 雅之

制限(Type II)

hum0187.v2

JGAS000194

JGAS000233

消化器癌のゲノム・遺伝子解析とその臨床病理学的意義の解明

v1:2020/05/12

v2:2021/05/31

NGS

(Target Capture、Exome、RNA-seq)

メチル化アレイ

配列決定

発現

メチル化

Illumina

(MiSeq、HiSeq 2500、HumanMethylation450)

肝癌:243+160症例

(日本人)

油谷 浩幸

制限(Type I)

hum0188.v1

JGAS000179

胃がん細胞株のゲノム解析による治療標的同定

v1:2019/06/28

NGS

(Exome、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 2500)

胃癌細胞株:2検体

(細胞株)

間野 博行

制限(Type I)

hum0191.v1

DRA008575

個々のがんの遺伝子変異に基づく固有抗原の同定と腫瘍内微小環境の解析に基づく免疫制御法を組み合わせた個別化がんワクチン治療の開発

v1:2020/06/05

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(HiSeq 1500/4000)

膵癌:17症例

(日本人)

垣見 和宏

非制限公開

hum0192.v1

JGAS000196

大腸・直腸癌患者のオリゴメタスタシスに対する放射線・陽子線治療後予後予測バイオマーカーとしてcell free DNAの有用性を検証する研究

v1:2021/04/23

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(NovaSeq 6000)

大腸・直腸癌:20症例

(日本人)

中村 匡希

制限(Type I)

hum0194.v1

JGAS000189

分子プロファイリングによる薬剤抵抗性機構の研究

v1:2020/05/11

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(MiSeq)

肺癌:2症例

(日本人)

片山 量平

制限(Type I)

hum0195.v3

JGAS000190

JGAS000234

JGAS000269

消化器癌における遺伝子異常についての網羅的解析

v1:2021/03/26

v2:2022/03/02

v3:2022/03/18

NGS

(WGS、Exome、RNA-seq、Target Capture)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 4000、NovaSeq 6000)

Thermo Fisher Scientific

(Ion Proton)

結節内結節型肝癌:5症例

C型肝炎ウイルス排除後に肝癌を発症した慢性肝炎/肝硬変:20症例

C型肝炎ウイルス陽性肝硬変/肝癌:3症例

C型肝炎ウイルス陰性肝癌:2症例

胃癌:42 + 1症例、胃粘膜下腫瘍:3症例

(日本人)

髙井 淳

制限(Type I)

hum0196.v1

自殺者血液および死後脳標本を用いた自殺に関連した生物学的マーカーの同定と自殺予防への応用に関する研究

v1:2019/12/20

SNP-chip

ゲノムワイド関連

Illumina

(HumanOmniExpress-24、HumanOmniExpressExome-8)

自殺者:746名

非自殺者:14,049名

(日本人)

菱本 明豊

非制限公開

hum0197.v20

JGAS000205

JGAS000260

JGAS000316

JGAS000415

JGAS000504

JGAS000530

JGAS000531

JGAS000543

DRA014184

DRA014186

DRA014188

DRA014191

DRA014192

JGAS000593

JGAS000600

多層的オミクス解析による疾患病態の解明

v1:2019/11/15

v2:2020/11/27

v3:2021/03/22

v4:2021/12/10

v5:2021/12/21

v6:2022/02/08

v7:2022/05/23

v8:2022/06/03

v9:2022/06/10

v10:2022/06/16

v11:2022/07/21

v12:2022/12/01

v13:2023/02/14

v14:2023/02/16

v15:2023/03/29

v16:2023/06/06

v17:2023/06/27

v18:2023/10/02

v19:2024/05/29

v20:2024/05/30

メタゲノム

SNP-chip

NGS

(WGS、RNA-seq、scRNA-seq)

メタゲノム

ゲノムワイド関連

発現

eQTL

Illumina

(HiSeq 2500/3000/X Ten、NovaSeq 6000、Asian Screening Array、HumanOmniExpressExome、HumanOmniExpress、HumanExome、iCOGS OncoArray)

Applied Biosystems

(UK BiLEVE Axiom Array、UK Biobank Axiom Array)

Thermo Fisher Scientific

(FinnGen1 ThermoFisher Arrayなど)

日本人集団:95+103+227+30+141+136+88+5+524名

BBJ:180,215名

UKバイオバンク:377,583名

FinnGen:136,000+224,352名

BCAC:247,173名

PRACTICAL:140,254名

肺胞蛋白症:198症例

対照者:395名

潰瘍性大腸炎:35症例

クローン病:39症例

健常対照者:40名

頭蓋内胚細胞腫瘍:133症例

対照者:762名

COVID-19:30+43症例

健常対照者:31+44名

健常者:73名

間質性膀胱炎ハンナ型:144症例

2型糖尿病:27,642症例(BBJ)

対照者:70,242名(BBJ)

2型糖尿病:27,642症例(UKバイオバンク)

対照者:70,242名(UKバイオバンク)

不育症:1,728症例

(日本人、イギリス人、フィンランド人)

岡田 随象

非制限公開

制限(Type I)

hum0199.v1

JGAS000198

次世代シーケンサーを用いた泌尿器悪性腫瘍の治療標的分子の同定

v1:2020/06/29

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(HiSeq 2500)

前立腺癌:25症例

(日本人)

藤村 哲也

制限(Type I)

hum0200.v5

JGAS000202

JGAS000265

JGAS000290

JGAS000387

乳腺腫瘍の表現型にかかわる体細胞変異および遺伝子発現異常の解析

v1:2021/03/29

v2:2021/05/07

v3:2021/10/01

v4:2022/03/02

v5:2022/08/29

NGS

(Exome、WGS、Target Capture、Visium Spatial Gene Expression、semibulk RNA-seq、scRNA-seq)

CNV

メチル化解析

病理画像

配列決定

CNV

メチル化

発現

病理画像

Illumina

(HiSeq 3000、NovaSeq 6000)

10x Genomics

(Chromium Controller)

Nanopore

(PromethION)

非浸潤性乳管癌:96症例

浸潤性乳管癌:4症例

(日本人)

永澤 慧

(ゲノム支援)

制限(Type I)

hum0201.v7

JGAS000199

JGAS000237*

JGAS000256

JGAS000378

JGAS000350

JGAS000550

ヒト腫瘍試料の収集・分譲とゲノム情報を利用した研究

既存試料の分譲とゲノム情報を利用した研究

消化器慢性炎症性疾患における遺伝子変異の検索

v1:2019/12/20

v2:2020/10/06

v3:2020/11/20

v4:2021/11/19

v5:2022/06/06

v6:2022/08/05

v7:2022/12/27

NGS

(Exome、WGS、RNA-seq、ChIP-seq、scRNA-seq)

配列決定

発現

ヒストン修飾

Illumina

(HiSeq 2500/4000/X Ten、NovaSeq 6000)

潰瘍性大腸炎:29症例

腫瘍を併発する潰瘍性大腸炎:26症例

下部消化管内視鏡検査を受けた患者(対照者):16名

腫瘍性疾患:23+1+4+2+3症例

(日本人)

佐藤 俊朗

制限(Type I)

hum0202.v1

JGAS000379

言語聴覚リハビリテーションの向上を目的とした先天性難聴の遺伝的原因と生後早期の経過の解明

v1:2022/09/09

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500/4000)

先天性難聴:3症例とその両親

(日本人)

松永 達雄

制限(Type I)

hum0203.v1

JGAS000206

造血器腫瘍における臨床ゲノム情報統合データベースの構築に関する研究

v1:2020/06/01

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

多発性骨髄腫:154症例

(日本人)

堀部 敬三

制限(Type I)

hum0206.v1

JGAS000207

妊娠関連疾患の胎盤栄養膜細胞株の樹立と細胞特性に関する研究

v1:2019/11/26

NGS

(PBAT-seq、RNA-seq)

発現

メチル化

Illumina

(HiSeq 1500/2500)

全胞状奇胎:3症例

(日本人)

有馬 隆博

制限(Type I)

hum0207.v1

ヒト免疫細胞における遺伝子多型と遺伝子発現の関連解析

v1:2020/01/06

NGS

(RNA-seq、ChIP-seq、Hi-C)

eQTL

発現

ヒストン修飾

クロマチン構造

eQTL

Illumina

(HiSeq 2500、HiSeq series、Infinium OmniExpressExome)

関節リウマチ:30症例

変形性関節症:30症例

(日本人)

藤尾 圭志

非制限公開

hum0208.v1

JGAS000214

頭頚部悪性腫瘍に対する網羅的遺伝子解析およびデータベースの構築

v1:2020/01/20

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq X Ten)

外耳道癌:10症例

(日本人)

中川 尚志

制限(Type I)

hum0209.v1

関節リウマチ治療におけるメトトレキサートの効果と副作用予測のための多施設研究

v1:2019/12/13

SNP-chip

ダイレクトシークエンス

配列決定

Thermo Fisher Scientific

(GeneChip® Scanner 3000 7G)

Applied Biosystems

(Veriti 96-Well Thermal Cycler and 3730XL DNA Analyzer)

関節リウマチ:166症例

(日本人)

熊谷 俊一

非制限公開

hum0210.v1

JGAS000211

造血器腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析

v1:2020/04/06

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(NextSeq 500)

急性骨髄性白血病と縦隔胚細胞腫瘍の合併症例:1症例

(日本人)

下田 和哉

制限(Type I)

hum0213.v1

JGAS000238

Demographic History and Local Adaptation in Asian Population

v1:2022/07/15

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(HiSeq X Ten)

バルチ人:60名

Min-Sheng Peng

制限(Type I)

hum0214.v9

JGAS000220

JGAS000296

E-GEAD-397

E-GEAD-398

E-GEAD-420

JGAS000486

JGAS000598

JGAS000485

JGAS000626

JGAS000627

JGAS000648

ヒト免疫系の機能ゲノム学による統合的理解とこれを用いた免疫疾患の発症予防のためのインターベンション戦略の構築

v1:2020/10/09

v2:2021/03/05

v3:2021/04/28

v4:2022/01/21

v5:2022/03/09

v6:2022/08/25

v7:2023/03/28

v8:2023/07/06

v9:2024/02/08

NGS

(RNA-seq、scRNA-seq)

eQTL

B細胞受容体レパトア解析

発現

eQTL

Illumina

(HiSeq 2500、NovaSeq 6000)

10免疫疾患:544症例

健常者:185名

(日本人)

藤尾 圭志

非制限公開

制限(Type I)

hum0215.v1

JGAS000532

日本人の全ゲノム、RNA解析を基盤とした老年病関連分子の同定と解析

v1:2022/09/28

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

アルツハイマー病:317症例

軽度認知障害:432症例

認知機能正常:107名

(日本人)

尾崎 浩一

制限(Type I)

hum0216.v4

JGAS000216

JGAS000244

JGAS000279

消化管癌を含む固形癌患者における免疫状態の解明と臨床的意義に関する研究

新規免疫療法や併用療法開発を目指した固形癌患者の免疫状態の解析

v1:2020/02/07

v2:2020/09/25

v3:2021/03/29

v4:2021/04/13

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500、NovaSeq 6000)

肺腺癌:17症例

胃癌:26+23症例

肺癌:9症例

悪性黒色腫:5症例

大腸癌:7症例

(日本人)

西川 博嘉

制限(Type I)

hum0217.v1

JGAS000217

大腸ポリープから癌への進展を予測する遺伝子変化の同定

v1:2020/03/02

NGS

(Target Capture)

配列決定

Thermo Fisher Scientific

(Ion Torrent)

大腸鋸歯状病変(鋸歯状ポリープ):50症例

(日本人)

澤田 武

制限(Type I)

hum0218.v1

E-GEAD-344

全身性強皮症患者の遺伝子発現解析

v1:2020/10/09

NGS

(scRNA-seq)

発現

Illumina

(HiSeq)

全身性強皮症:3症例

(日本人)

藤尾 圭志

非制限公開

hum0220.v1

JGAS000223

採血後の試験管保存状態が試験管内の化合物濃度に与える影響の研究

v1:2020/06/02

LC-MS/MS

質量分析

Sciex

(TripleTOF 5600)

健常人:3名

(日本人)

大槻 純男

(AMED疾患代謝)

制限(Type I)

hum0221.v1

JGAS000225

ヒト疾患特異的iPS細胞を用いた遺伝子解析研究

v1:2023/07/28

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

ファブリー病患者由来iPS細胞株:3検体

(細胞株)

粟屋 智就

制限(Type I)

hum0222.v1

JGAS000224

NGS技術を駆使した遺伝学的解析による家族性乳がんの原因遺伝子同定と標準化医療構築

v1:2020/03/13

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

乳癌:115症例

(日本人)

大野 真司

制限(Type I)

hum0223.v1

JGAS000232

血液がんにおける遺伝子変異の解析

v1:2020/09/01

NGS

(Target Capture)

配列決定

Thermo Fisher Scientific

(Ion Proton)

多発性骨髄腫:7症例

(日本人)

照井 康仁

制限(Type I)

hum0225.v1

JGAS000226

HTLV-1関連脊髄症(HAM)におけるゲノム異常及びエピゲノム異常の解析

v1:2020/05/08

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500/3000)

HTLV-1関連脊髄症(HAM):21症例

(日本人)

山岸 誠

制限(Type I)

hum0226.v1

JGAS000229

上部消化管腫瘍のゲノム・遺伝子解析とその臨床病理学的意義の解明

v1:2021/06/04

NGS

(Exome、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 2500)

胃癌:141症例

(日本人)

油谷 浩幸

制限(Type I)

hum0227.v1

JGAS000228

胃腫瘍のゲノム・遺伝子解析とその臨床病理学的意義の解明

v1:2021/06/04

NGS

(Exome、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 2500)

胃癌:102症例

(日本人)

油谷 浩幸

制限(Type I)

hum0229.v1

JGAS000230

老化・神経疾患における分子マーカーの探索と分子基盤の解明

v1:2020/05/15

NGS

(scRNA-seq)

発現

Illumina

(HiSeq 2500)

スーパーセンチナリアン(110歳以上):7名

家族:2名

血縁関係のない対照群:2名

(日本人)

Piero Carninci

制限(Type I)

hum0231.v1

JGAS000287

ヒト疾患特異的iPS細胞樹立に関する研究

v1:2024/07/22

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

健常人:120名

(日本人)

齋藤 潤

制限(Type I)

hum0232.v1

JGAS000231

胃癌由来循環腫瘍DNAモニタリングによる転移・再発の検証

v1:2020/06/01

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

胃癌:10症例

(日本人)

西塚 哲

制限(Type I)

hum0233.v1

JGAS000236

小児肝癌に対する国際共同臨床試験(PHITT, JPLT4)付随研究

v1:2021/05/31

NGS

(Exome、RNA-seq、WGBS)

SNP-chip

メチル化アレイ

配列決定

発現

メチル化

ヒストン修飾

Illumina

(HiSeq 2500、HumanMethylation450)

Affymetrix

(SNP Array 6.0)

小児肝腫瘍:165症例

(日本人)

檜山 英三

制限(Type I)

hum0235.v1

JGAS000272

プレクリニカル期におけるアルツハイマー病に対する客観的画像診断・評価法の確立を目指す臨床研究

v1:2021/04/06

脳画像

臨床情報

脳画像ベースの病態解明

MRIスキャナー(9機種)

PETスキャナー(11機種)

健常高齢者群:25名

プレクリニカルAD:3名

早期MCI:7名

後期MCI:5名

(日本人)

嶋田 裕之

非制限公開

制限(Type I)

hum0236.v1

JGAS000245

肺がんの複雑な遺伝子変異を利用した腫瘍浸潤リンパ球療法の開発を目指した基礎的検討

v1:2020/12/14

NGS

(Exome、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 2500)

Nanopore

(MinION)

非小細胞肺癌:7症例

(日本人)

中面 哲也

制限(Type I)

hum0237.v1

日本人の全ゲノム、RNA解析を基盤とした老年病関連分子の同定と解析

v1:2021/03/05

SNP-chip

ゲノムワイド関連

Affymetrix

(Japonica Array、SNP Array 6.0)

アルツハイマー病:3,962症例

非アルツハイマー病:4,074名

(日本人)

尾崎 浩一

非制限公開

hum0238.v1

JGAS000240

オーダーメイド医療開発プロジェクト

v1:2020/07/28

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

BBJ:10名

(日本人)

桃沢 幸秀

制限(Type I)

hum0239.v1

JGAS000241

がん、感染症、難病、生活習慣病等に関する遺伝子とタンパク質などの網羅的解析

v1:2020/07/27

NGS

(Target Capture)

配列決定

Thermo Fisher Scientific

(Ion Proton)

膀胱癌:19症例

(日本人)

弘津 陽介

制限(Type I)

hum0240.v1

JGAS000258

中枢神経原発悪性リンパ腫の全ゲノムシーケンス解析

v1:2020/10/30

NGS

(Target Capture)

配列決定

Thermo Fisher Scientific

(Ion Torrent)

中枢神経原発悪性リンパ腫:28症例

(日本人)

山中 龍也

制限(Type I)

hum0242.v1

JGAS000243

変異遺伝子のモニタリングによる大腸癌術後の微少転移及び再発の新たな評価法の検証

v1:2021/01/05

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

大腸癌:12症例

(日本人)

西塚 哲

制限(Type I)

hum0243.v1

JGAS000253

ヒト化マウス(humanized mouse)の作製と免疫学研究への応用/ヒト・造血免疫系由来iPS細胞を用いた疾患と治療モデルの構築

v1:2020/11/20

NGS

(RNA-seq、CAGE-seq)

発現

Illumina

(HiSeq 2500)

臍帯血:24名

急性骨髄性白血病:116症例

(日本人)

石川 文彦

制限(Type I)

hum0245.v1

JGAS000276

思春期・若年成人急性リンパ芽球性白血病における網羅的ゲノム解析(JALSG ALL202U-GWS)

v1:2022/10/25

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

フィラデルフィア染色体陰性ALL:46症例

(日本人)

早川 文彦

制限(Type I)

hum0247.v1

JGAS000249

DRA010773

がん患者免疫状態を反映するがん遺伝子変異の探索

v1:2021/01/04

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 1500)

悪性黒色腫:3症例

(日本人)

岩田 卓

非制限公開

制限(Type I)

hum0248.v2

JGAS000259

高精度長鎖解読による日本人基準ゲノム配列策定

v1:2020/10/30

v2:2020/11/06

NGS

(WGS)

配列決定

PacBio(RS II)

Bionano(Irys、Saphyr)

Illumina(HiSeq 2500)

日本人健常男性:3名

(日本人)

山本 雅之

非制限公開

制限(Type II)

hum0249.v1

JGAS000248

硬組織・結合組織関連疾患患者由来iPS細胞を用いた病態解明と治療法開発

v1:2020/09/01

NGS

(CAGE-seq)

転写開始点同定

Illumina

(NextSeq 500)

鎖骨頭蓋骨異形成症:3症例

(日本人)

東 俊文

制限(Type I)

hum0250.v1

JGAS000277

革新脳脳老化ヒト画像研究

v1:2021/03/29

脳画像

臨床情報

脳画像

MRIスキャナー(1機種)

PETスキャナー(1機種)

MCI:11名

健常高齢者群:28名

(日本人)

岩坪 威

制限(Type I)

hum0251.v1

JGAS000278

成人フィラデルフィア染色体陰性precursor B細胞性急性リンパ性白血病に対する多剤併用化学療法による第Ⅱ相臨床試験

v1:2022/10/25

NGS

(RNA-seq、Target Capture)

発現

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

フィラデルフィア染色体陰性B-ALL:153症例

(日本人)

八田 善弘

制限(Type I)

hum0252.v3

JGAS000301

JGAS000553

ATL、HTLV-1感染症の分子基盤創出のための研究

v1:2021/07/12

v2:2023/12/06

v3:2024/03/04

NGS

(Target Capture、RNA-seq、scRNA-seq、WGS、scATAC-seq、ChIP-seq)

配列決定

発現

クロマチン構造

ヒストン修飾

Illumina

(HiSeq 2500/3000、NovaSeq 6000、NextSeq 500)

MGI

(DNBSEQ-G400)

ATL:6+4+6症例(日本人)

HTLV-1感染者:10症例(日本人)

健常者3+1名のCD4+T細胞(セルライン)

山岸 誠

制限(Type I)

hum0254.v1

JGAS000257

血中セルフリーDNAからの配列決定ライブラリー調製法の開発

v1:2021/09/24

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(MiSeq、HiSeq X Ten)

健常人:5名

(日本人)

三浦 史仁

制限(Type I)

hum0257.v2

JGAS000262

JGAS000263

JGAS000264

JGAS000514

E-GEAD-414

E-GEAD-415

E-GEAD-416

E-GEAD-417

GSE202023

ヒト膵・胆道由来微量検体を用いた培養増幅法の研究開発

v1:2021/12/24

v2:2023/01/10

NGS

(Exome、RNA-seq、ATAC-seq、ChIP-seq、Hi-C)

配列決定

発現

クロマチン構造

ヒストン修飾

Illumina

(NovaSeq6000、HiSeq 2500、NextSeq 500)

膵管癌:17症例

膵管内乳頭粘液性腫瘍:6症例

(日本人)

立石 敬介

(ゲノム支援)

非制限公開

制限(Type I)

hum0261.v2

原発性胆汁性胆管炎の病態解明のためのゲノムワイド関連解析

― 1,000 症例の追加解析 ―

v1:2021/01/08

v2:2021/01/19

SNP-chip

領域内遺伝率推定

ゲノムワイド関連

Affymetrix

(Axiom ASI、Japonica Array v1)

原発性胆汁性胆管炎:1,953症例

健常対照者:3,690名

(日本人)

中村 稔

非制限公開

hum0262.v1

JGAS000267

非小細胞肺癌における微小管阻害薬および葉酸代謝阻害薬感受性のバイオマーカー研究

v1:2021/05/11

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(HiSeq 1500/2500)

肺腺癌:24症例

(日本人)

土原 一哉

制限(Type I)

hum0263.v1

JGAS000292

若年性骨髄単球性白血病における遺伝子異常の網羅的解析

v1:2023/07/24

NGS

(DREAM-seq)

メチル化

Illumina

(HiSeq 2500)

若年性骨髄単球性白血病:149症例

(日本人)

髙橋 義行

制限(Type I)

hum0264.v2

JGAS000508

過眠を呈する睡眠障害 (各種過眠症・概日リズム睡眠障害・睡眠時無呼吸症候群・睡眠関連運動障害・睡眠時随伴症など) の病態に関与する遺伝子の探索とその機能および末梢血リンパ球の自己抗原特異的増殖反応の研究

v1:2022/02/07

v2:2022/02/28

SNP-chip

ゲノムワイド関連

Affymetrix

(SNP Array 6.0)

特発性過眠症:129症例

(日本人)

本多 真

非制限公開

制限(Type I)

hum0266.v1

JGAS000281

患者検体を用いた自己免疫性皮膚疾患発症機序の解明

v1:2022/12/27

NGS

(scRNA-seq)

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

天疱瘡:3症例

健常人:3名

(日本人)

江上 将平

制限(Type I)

hum0268.v1

JGAS000280

がん組織を用いたネオアンチゲンスクリーニング

v1:2021/04/09

NGS

(Iso-seq、CAGE-seq、RNA-seq)

発現

Illumina

(NextSeq 500、NovaSeq 6000)

PacBio

(Sequel)

ヒト大腸癌細胞株:1検体

(細胞株)

大腸癌:6症例

(日本人)

金関 貴幸

制限(Type I)

hum0269.v2

JGAS000295

JGAS000565

JGAS000566

JGAS000567

遺伝性心血管疾患の感受性遺伝子解析研究

v1:2021/05/25

v2:2024/03/18

NGS

(Exome、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 2500/3000)

遺伝性心血管疾患:13+20症例

(日本人)

朝野 仁裕

制限(Type I)

hum0270.v1

JGAS000282

ゲノムおよび遺伝子解析に基づく骨軟部腫瘍に特異的な分子病理学的異常の解明と、新規診断および治療法の開発を目指したトランスレーショナル研究

v1:2022/05/19

NGS

(Target Capture)

配列決定

Thermo Fisher Scientific

(Ion Proton)

小児骨肉腫:16症例

(日本人)

米本 司

制限(Type I)

hum0271.v1

JGAS000288

ハプロ不全により発症する常染色体優性遺伝性疾患における表現型発現の個体差に関する包括的ゲノム解析研究

v1:2021/05/11

NGS

(Target Capture、Target RNA-seq)

配列決定

Illumina

(MiSeq)

神経線維腫症1型:20症例

(日本人)

新井田 要

制限(Type I)

hum0272.v2

JGAS000285

メラノーマ等、皮膚腫瘍病変の免疫状態の解析

v1:2021/12/20

v2:2022/02/07

NGS

(Exome、RNA-seq、scRNA-seq、scTCR-seq)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 2500)

メラノーマ:4症例

(日本人)

猪爪 隆史

制限(Type I)

hum0273.v1

JGAS000300

乳癌の発生、進展に関する分子病理学的研究

v1:2021/08/27

NGS

(Amplicon-seq)

配列決定

Thermo Fisher Scientific

(Ion Proton)

小葉癌乳管癌併存症例:2症例

(日本人)

増田 しのぶ

制限(Type I)

hum0274.v1

JGAS000294

mRNA輸送因子UAP56とURH49による選択的mRNA輸送基盤の統合的解析

v1:2022/04/22

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

目的遺伝子をノックダウンしたHeLa細胞:20検体

(細胞株)

藤田 賢一

制限(Type I)

hum0275.v1

JGAS000313

固形腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析

v1:2021/08/16

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(NovaSeq 6000)

胃癌既往の無いヘリコバクターピロリ未感染者(健常集団):9名

(日本人)

小川 誠司

制限(Type I)

hum0276.v1

JGAS000308

Gorlin症候群に対する汎用型遺伝子診断パネルの開発とリキッドバイオプシーへの応用

v1:2021/10/01

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(MiSeq)

Gorlin症候群:12症例

血縁者:3名

(日本人)

東 俊文

制限(Type I)

hum0277.v3

JGAS000303

JGAS000564

泌尿器科領域の腫瘍性疾患の発症、進展、及び薬剤の治療効果に関わる遺伝子の解析

v1:2022/09/09

v2:2023/04/18

v3:2023/05/10

NGS

(scRNA-seq、Exome、RNA-seq、WGS)

配列決定

発現

Illumina

(NextSeq 500、HiSeq 2500、NovaSeq 6000/PE150)

腎癌:15+30症例

腎オンコサイトーマ:7症例

(日本人)

蓮見 壽史

制限(Type I)

hum0278.v1

JGAS000304

JGAS000305

乳癌幹細胞のゲノム解析

v1:2022/07/07

NGS

(Exome、scRNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 3000、NovaSeq 6000)

乳癌:5症例

(日本人)

後藤 典子

制限(Type I)

hum0279.v1

JGAS000307

ゲノム・エピゲノム解析と免疫組織染色による難治性悪性リンパ腫の層別化と新規治療法の開発

v1:2022/09/05

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(NextSeq 550)

びまん性大細胞型B細胞リンパ腫:177症例

(日本人)

堺田 恵美子

制限(Type I)

hum0280.v1

DRA012560

肺癌患者における標的抗原の同定とがん微小環境の解析

v1:2022/01/07

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

肺癌:113症例

(日本人)

松下 博和

非制限公開

hum0284.v1

JGAS000309

生体維持機能の破綻による前がん病変から浸潤がんへの移行を制御する分子機序の解明

v1:2023/01/19

NGS

(scRNA-seq)

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

乳癌:4症例

中山 淳

制限(Type I)

hum0286.v2

JGAS000311

JGAS000523

非アルコール性脂肪性肝疾患患者における肝癌発症・進展機序の解明

v1:2022/09/12

v2:2022/11/15

NGS

(Visium Spatial Gene Expression、Target Capture)

病理画像

発現

病理画像

配列決定

Illumina

(NovaSeq 6000)

Thermo Fisher Scientific

(Ion Proton)

肝細胞癌:55症例

(日本人)

小玉 尚宏

(ゲノム支援)

制限(Type I)

hum0287.v3

JGAS000310

JGAS000573

JGAS000690

ヒトiPS細胞株のゲノム配列比較

v1:2021/11/02

v2:2023/03/29

v3:2024/05/01

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(HiSeq X)

Nanopore

(PromethION)

ヒトiPS細胞株:5+1+1株

(細胞株)

横林 しほり

制限(Type I)

hum0289.v1

JGAS000317

慢性骨髄単球性白血病(CMML)における同種移植後再発メカニズムの探索

v1:2022/09/09

NGS

(RNA-seq、Exome)

メチル化アレイ

配列決定

発現

メチル化

Illumina

(NovaSeq 6000、MethylationEPIC)

慢性骨髄単球性白血病(CMML):1症例

(日本人)

赤星 佑

制限(Type I)

hum0290.v1

JGAS000321

ヒトゲノム・遺伝子発現および細菌叢の環境因子との相互作用に関する網羅的解析(2)

v1:2022/03/07

NGS

(WGS、scRNA-seq、TCR-seq、BCR-seq、CyTOF)

配列決定

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

10x Genomics

(Chromium Controller)

健常者:7名

(日本人)

鈴木 穣

制限(Type I)

hum0291.v2

JGAS000359

網羅的ゲノム解析による膵腫瘍ならびに十二指腸腫瘍、胆道腫瘍の本態解明と新規診断・治療法の開発

v1:2021/12/10

v2:2023/09/08

NGS

(WGS、Exome、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 2000/2500)

膵腫瘍:57+6症例

十二指腸腫瘍:6+1症例

胆道腫瘍:11症例

(日本人)

谷内田 真一

制限(Type I)

hum0292.v1

JGAS000330

去勢抵抗性前立腺癌の最適医療の実現に向けた血液ゲノムマーカーの開発

v1:2021/09/24

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(NovaSeq 6000)

去勢抵抗性前立腺癌:100症例

(日本人)

赤松 秀輔

制限(Type I)

hum0293.v1

JGAS000320

造血器腫瘍・難治性腫瘍の治療感受性を規定する遺伝学的宿主側因子、腫瘍側因子の探索研究

v1:2022/07/25

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(HiSeq X Ten)

BGI

(BGISEQ-500)

成人T細胞性白血病リンパ腫(ATL):7症例

ATL細胞株(TL-om1):1検体

(日本人)

三田 貴臣

制限(Type I)

hum0294.v1

JGAS000708

腫瘍浸潤T細胞サブセットのシングルセル解析

v1:2024/05/29

NGS

(Exome、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq X)

食道癌:28症例

(日本人)

熊谷 尚悟

制限(Type I)

hum0297.v1

JGAS000348

色覚多様性の総合的研究

v1:2022/09/15

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(NovaSeq 6000)

Nanopore

(PromethION)

健常者:1名

平松 千尋

制限(Type I)

hum0299.v1

DRA012759

ロングリードシークエンサーを用いたがん突然変異の染色体背景の解析

v1:2022/09/15

NGS

(WGS)

配列決定

Nanopore

(PromethION)

健常白人由来B細胞株HG002(NA24385):1検体

(細胞株)

鈴木 穣

非制限公開

hum0300.v1

JGAS000367

がんの全ゲノム・全エキソンシークエンス解析

v1:2021/11/12

NGS

(Exome、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 2000/2500)

食道扁平上皮癌:89症例

(日本人)

稲澤 譲治

制限(Type I)

hum0301.v1

JGAS000368

乳がん患者および高リスク者におけるゲノム異常と免疫状態との統合的解析研究(免疫ゲノムアトラスプロジェクト)

v1:2021/11/29

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500、NovaSeq 6000)

MGI

(DNBSEQ-G400)

乳癌:26症例

(日本人)

間野 博行

制限(Type I)

hum0302.v2

JGAS000382

JGAS000683

iPS細胞の高次特性解析と加工iPS細胞の作製

v1:2022/09/05

v2:2024/03/18

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

ウイルソン病患者由来iPS細胞株:6検体

若年性ネフロン癆(NPH1)患者由来iPS細胞株:12検体

健常人由来iPS細胞株:6+6検体

(細胞株)

林 洋平

制限(Type I)

hum0304.v1

JGAS000370

乳がんにおけるタキサン作用機序の解明に関する研究

v1:2022/04/08

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000/2500)

乳がん:6症例

(日本人)

鰐渕 友美

制限(Type I)

hum0305.v1

JGAS000377

造血細胞移植後二次がんの細胞遺伝学的特徴に関する多施設後方視的研究

v1:2021/11/29

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(NovaSeq 6000)

MGI

(DNBSEQ-G400)

固形癌:14症例

(日本人)

稲本 賢弘

制限(Type I)

hum0306.v1

JGAS000361

国際連携によるがんゲノムシークエンス解析

(シークエンス解析によるがんゲノム研究)

v1:2021/10/15

NGS

(WGS)

配列決定

Nanopore

(MinION)

肝臓癌:9症例

(日本人)

中川 英刀

制限(Type I)

hum0307.v1

JGAS000416

アトピー性皮膚炎患者における皮膚成分の解析(2)

v1:2022/03/11

NGS

(RNA-seq)

発現

Thermo Fisher Scientific

(Ion S5)

健常男性:29名

男性のアトピー性皮膚炎:30症例

(日本人)

井上 高良

制限(Type I)

hum0308.v1

JGAS000417

皮膚成分の日間、日内変動解析試験

v1:2022/03/11

NGS

(RNA-seq)

発現

Thermo Fisher Scientific

(Ion S5)

健常女性:10名

(日本人)

井上 高良

制限(Type I)

hum0309.v1

JGAS000418

皮脂及び角層由来成分のプロファイル比較試験

v1:2022/03/11

NGS

(RNA-seq)

発現

Thermo Fisher Scientific

(Ion S5)

健常男性:10名

(日本人)

井上 高良

制限(Type I)

hum0311.v6

JGAS000412

JGAS000541

JGAS000561

バイオバンク・ジャパンの運営・管理と個別化医療の実現に向けた疾患バイオマーカー探索

疾患コホート研究ネットワークによる疾患マーカー探索研究

v1:2021/11/30

v2:2022/07/28

v3:2022/09/08

v4:2023/04/24

v5:2023/07/27

v6:2024/05/22

SNP-chip

メタボローム

配列決定

メタボローム

ゲノムワイド関連

Illumina

(Asian Screening Array、HumanOmniExpressExome、HumanOmniExpress、HumanExome)

Bruker

(AVANCE IIIHD)

BBJ第一コホート:11,716名+180,882+1,285+2,570+40,907 名

BBJ第二コホート:42,689名

ToMMo:49,621名

UKバイオバンク:456,327名

FinnGen:230,635名

(日本人、イギリス人、フィンランド人)

松田 浩一

制限(Type I)

hum0312.v2

DRA016285

DRA016393

DRA016394

DRA016395

DRA018714

機能性遺伝子多型の網羅的解析を介した多因子疾患の病態解明

v1:2024/06/17

v2:2024/06/20

NGS

(RNA-seq、Iso-seq)

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

Nanopore

(MinION)

PacBio

(Sequel II/IIe)

日本人健常者不死化B細胞株:95検体

(細胞株)

健常人:1名

(日本人)

高地 雄太

非制限公開

hum0314.v1

JGAS000383

アルツハイマー型認知症患者を対象とした疾患表現型と遺伝型の関連性解析

v1:2021/11/19

SNP-chip

配列決定

Illumina

(Infinium OmniExpressExome-8)

孤発性アルツハイマー病:102症例

(日本人)

井上 治久

制限(Type I)

hum0315.v2

JGAS000385

造血器腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析

v1:2022/01/14

v2:2022/07/28

NGS

(Exome、RNA-seq、scRNA-seq、ChIP-seq、Target Capture)

メチル化アレイ

配列決定

発現

ヒストン修飾

メチル化

Illumina

(HiSeq 2500/X Ten、MethylationEPIC、HumanMethylation450)

乳児期発症のKMT2A遺伝子再構成陽性急性リンパ性白血病:84症例

乳児KMT2A遺伝子再構成陽性急性リンパ性白血病由来細胞株:3検体

(日本人)

滝田 順子

制限(Type I)

hum0316.v1

JGAS000535

食道がんの全ゲノムシークエンス解析による病態解明と治療感受性マーカーの探索に関する研究

v1:2022/05/26

NGS

(WGS、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 2000/2500)

食道扁平上皮癌:110症例

(日本人)

中川 英刀

制限(Type I)

hum0317.v2

JGAS000413

JGAS000707

創薬研究に有用な患者検体移植モデルの構築に関する研究

v1:2021/12/06

v2:2024/06/20

NGS

(Exome、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

非小細胞肺癌:4症例

癌:52症例

(日本人)

濱田 哲暢

制限(Type I)

hum0318.v1

JGAS000483

血液疾患のゲノム解析研究

v1:2022/03/09

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(MiSeq)

B細胞性急性リンパ芽球性白血病(B-ALL):1症例

(日本人)

東條 有伸

制限(Type I)

hum0319.v1

JGAS000487

遺伝子多型を用いた前立腺癌診断マーカーの開発

日本人の前立腺がん発症に関わるレアバリアントの同定

v1:2022/01/21

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

前立腺癌の確定診断のために前立腺生検を行う患者:1,336症例

(日本人)

赤松 秀輔

制限(Type I)

hum0320.v1

JGAS000480

悪性腫瘍を有する患者を対象とした免疫モニタリング研究

v1:2022/01/25

NGS

(scRNA-seq、TCR-seq)

発現

MGI

(DNBSEQ-G400)

肺腺癌:2症例

頭頸部癌:3症例

(日本人)

冨樫 庸介

制限(Type I)

hum0321.v1

JGAS000482

胸腺組織を介した免疫系構築の遺伝子制御に関する研究

v1:2022/06/17

NGS

(scRNA-seq)

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

重症筋無力症:4症例

奥野 龍禎

制限(Type I)

hum0323.v1

JGAS000489

大腸癌の診断マーカーの探索研究

v1:2022/01/24

NGS

(CAGE-seq)

転写開始点同定

Illumina

(HiSeq 2500)

大腸癌:45症例

(日本人)

向後 泰司

制限(Type I)

hum0324.v1

JGAS000515

脳血管障害及び神経筋難病の遺伝子解析研究

v1:2022/04/11

NGS

(WGBS)

メチル化

Illumina

(NovaSeq 6000)

AQP4抗体陽性の視神経脊髄炎(NMOSD):10症例

健常者(非発症血縁者):8名

(日本人)

奥野 龍禎

制限(Type I)

hum0327.v1

JGAS000507

個別化T細胞受容体遺伝子導入T細胞療法の臨床応用を目指した肝胆膵領域がんにおけるネオアンチゲンおよびそれを認識するT細胞受容体のスクリーニング

v1:2022/02/25

NGS

(Exome、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(NextSeq 550)

肝細胞癌:28症例

転移性肝癌:18症例

(日本人)

鈴木 利宙

制限(Type I)

hum0328.v1

JGAS000509

日本人の進行性前立腺癌におけるDNA修復遺伝子異常の頻度に関する研究

v1:2023/05/11

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

前立腺癌:129症例

(日本人)

赤松 秀輔

制限(Type I)

hum0329.v1

JGAS000522

未診断疾患の網羅的遺伝子解析による診断システムの構築

v1:2022/06/17

NGS

(Exome)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 2500)

未診断疾患の患者およびその両親(一部trioでない家系を含む):177家系(522検体)

(日本人)

村松 秀城

制限(Type I)

hum0331.v1

がんや難病に関するゲノム医療の推進に必要な健常群 ・疾患コントロール群データの構築

v1:2023/02/01

NGS

(WGS)

配列決定

頻度情報

Illumina

(NovaSeq 6000)

健常者(難病やがんを罹患していない生活習慣病を持つ人を含む):9290名

(日本人)

徳永 勝士

非制限公開

hum0332.v1

JGAS000510

遺伝子マーカーを用いた尿路性器癌の個別化治療法に関する研究

v1:2022/05/30

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(NovaSeq 6000)

去勢抵抗性前立腺癌:1症例

(日本人)

赤松 秀輔

制限(Type I)

hum0335.v1

DRA014819

遺伝子解析と免疫形質を組み合わせたリンパ増殖性疾患の新たな診断と臨床像の調査研究

v1:2022/09/14

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(NextSeq 500)

原発性マクログロブリン血症:10症例

non IgM-type リンパ形質細胞性リンパ腫:10症例

(日本人)

横濱 章彦

非制限公開

hum0337.v1

JGAS000521

難治性婦人科悪性腫瘍の包括的オミックス解析に基づく新規テーラーメード治療の創出を目指した基盤的研究

v1:2024/07/19

NGS

(scRNA-seq)

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

悪性転化を伴う卵巣成熟奇形腫:5症例

(日本人)

吉田 康将

制限(Type I)

hum0338.v1

JGAS000575

加齢またはピロリ感染の影響がない胃がんに対する包括的がんゲノム・エピゲノム・免疫ゲノム解析

v1:2022/11/22

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2000)

ピロリ菌未感染胃がん:27症例

ピロリ菌感染胃がん:36症例

(日本人)

森 誠一

制限(Type I)

hum0340.v1

JGAS000520

小児固形腫瘍症例の次世代シークエンサーを用いた網羅的ゲノム解析

v1:2022/08/04

NGS

(WGS、Target Capture)

配列決定

Illumina

(Hiseq X Ten)

大腸癌:24症例 (成人)

網膜芽腫:1症例 (小児)

膠芽腫:2症例 (成人)

(日本人)

大場 詩子

制限(Type I)

hum0342.v1

JGAS000538

消化器腫瘍の免疫組織化学的・分子病理学的検索

v1:2022/06/27

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(NovaSeq 6000)

大腸癌:29症例

(日本人)

関根 茂樹

制限(Type I)

hum0343.v3

E-GEAD-759

新型コロナウイルス感染症の遺伝学的知見に基づいたCOVID19ワクチンの開発と評価系の構築

v1:2022/05/26

v2:2022/06/14

v3:2024/06/24

NGS

(RNA-seq)

SNP-chip

タンパク質発現量

eQTL/sQTL/pQTL

配列決定

ゲノムワイド関連

発現

Illumina

(Infinium Asian Screening Array、NovaSeq 6000)

Olink

(Olink Explore 3072)

COVID-19感染者:2393症例

対照者:3289名

(日本人)

福永 興壱

非制限公開

hum0344.v2

JGAS000533

JGAS000611

シークエンス解析によるがんゲノム研究:腎臓がん

v1:2022/08/04

v2:2023/05/16

NGS

(WGS、RNA-seq、Amplicon-seq)

配列決定

発現

Illumina

(HiSeq 2500)

MGI

(MGISEQ-2000RS)

腎臓癌:38症例

慢性腎臓病:77症例

(日本人)

HEK293細胞株:1検体

(細胞株)

中川 英刀

制限(Type I)

hum0345.v1

JGAS000528

JGAS000551

臍帯血を用いた再生医療に向けた基礎的研究

v1:2022/08/05

NGS

(scRNA-seq、ATAC-seq)

発現

クロマチン構造

Illumina

(NovaSeq 6000)

健常者:30名

(日本人)

大石 晃嗣

(ゲノム支援)

制限(Type I)

hum0347.v2

急性脳症の包括的遺伝子解析

v1:2022/05/23

v2:2022/07/15

サンガー法

SNP-chip

配列決定

ゲノムワイド関連

Life Technologies

(310 Genetic Analyzer、3100 Genetic Analyzer、3130xl Genetic Analyzer)

Affymetrix

(Japonica Array v2)

けいれん重積型急性脳症:283症例

対照健常者:799名

(日本人)

水口 雅

非制限公開

hum0348.v1

JGAS000537

CD30陽性HTLV-1感染細胞のゲノム異常によるATL発症バイオマーカーの同定

v1:2023/05/15

NGS

(Exome)

アレイCGH

配列決定

Illumina

(NovaSeq 6000)

Agilent Technologies

(GenetiSure Cancer Research CGH+SNP Microarray 2 x 400K)

ATL:8症例

(日本人)

中島 誠

制限(Type I)

hum0350.v1

JGAS000689

ヒト遺伝子多型とオミックスデータの統合解析のための基盤構築研究

v1:2024/06/13

NGS

(5' single-cell RNA-seq、3' single-cell RNA-seq、Micro-C and Region Capture Micro-C、CITE-seq、Multimodal assay(single-nucleus ATAC-seq、 3' and 5’ single-nucleus RNA-seq、 5' single-cell RNA-seq)、MAS-seq、CAGE-seq、NET-CAGE-seq)

発現

転写開始点同定

Illumina

(NovaSeq 6000、NextSeq 500)

PacBio

(Sequel Ⅱ)

健常者:3名

(男性:1名、女性:2名)

(日本人)

山本 一彦

制限(Type I)

hum0351.v1

JGAS000540

画像検査と RNF213 遺伝子検査の融合による閉塞性血管障害の新評価体系の確立

v1:2022/09/08

メタゲノム

メタゲノム

Illumina

(MiSeq)

もやもや病:27症例

非もやもや脳血管障害:7症例

対照健常者:15名

(日本人)

峰晴 陽平

制限(Type I)

hum0352.v1

JGAS000545

肺癌放射線治療の治療効果および有害事象発症の予測に関与するタンパク機能、RNA発現の解析研究

v1:2022/09/20

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

原発性肺癌:5症例

(日本人)

染谷 正則

制限(Type I)

hum0354.v2

泌尿器がんにおける血中循環がん細胞(CTC)の変化

v1:2022/06/30

v2:2023/04/18

qRT-PCR

発現

BioRad

(T100 Thermal cycler)

進行転移性去勢抵抗性前立腺癌:127症例

(日本人)

永田 政義

非制限公開

hum0355.v1

JGAS000544

次世代シークエンスによる泌尿器科腫瘍のゲノム解析

v1:2023/06/19

NGS

(WGS、Exome、RNA-seq)、マイクロアレイ

配列決定

発現

Illumina

(NovaSeq 6000、NextSeq 500、HiSeq X Ten)

NanoString Technologies

(nCounter Digital Analyzer)

VHL病に伴う遺伝性淡明細胞型腎細胞癌:10症例

(日本人)

片岡 圭亮

制限(Type I)

hum0356.v2

DRA015288

E-GEAD-579

DRA016520

E-GEAD-619

大腸発がんにおける遺伝子変化の解明と間質の臨床的意義の確立

v1:2022/12/20

v2:2024/05/31

NGS

(Visium Spatial Gene Expression)

病理画像

発現

病理画像

Illumina

(NovaSeq 6000)

大腸癌:1+2症例

(日本人)

三森 功士

非制限公開

hum0357.v5

JGAS000557

JGAS000609

JGAS000610

肺癌の遺伝子発現解析の生物学的特性ならびに診断・治療におけるバイオマーカーの研究

v1:2022/11/30

v2:2023/01/11

v3:2023/02/15

v4:2023/08/09

v5:2024/06/05

NGS

(WGS、Exome、RNA-seq、ATAC-seq)

メチル化アレイ

配列決定

発現

メチル化

Illumina

(HiSeq 2000/X Ten、NovaSeq 6000、MethylationEPIC)

肺癌:105症例

(日本人)

安田 浩之

制限(Type I)

hum0358.v2

JGAS000582

JGAS000586

JGAS000640

子宮頸部腺癌・扁平上皮癌、腟・外陰癌の発生及び予後決定に関わる遺伝子異常の検索

v1:2022/12/20

v2:2023/10/19

NGS

(Exome、RNA-seq、scRNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(NovaSeq 6000、MiSeq)

子宮頸癌:19+4症例

(日本人)

NIKS18細胞株:5検体

(細胞株)

曾根 献文

制限(Type I)

hum0359.v1

JGAS000548

T/NK細胞リンパ腫におけるゲノム・エピゲノム異常の解明

v1:2022/08/01

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(NovaSeq 6000)

節外性NK/T細胞リンパ腫(鼻型):67症例

(日本人)

大石 直輝

制限(Type I)

hum0360.v1

JGAS000546

COVID-19 発病・重症化機構の探索的研究

v1:2022/12/21

NGS

(scRNA-seq、scVDJ-seq)

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

COVID-19:6症例

(日本人)

立川 愛

制限(Type I)

hum0364.v1

ヒトのマイクロサテライト多型の包括的解析

v1:2022/08/29

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(公開済みbamファイルを使用した解析)

Simons Genome Diversity Project(SGDP):276名

Human Genome Diversity Project(HGDP):693名

縄文人:1名

藤本 明洋

非制限公開

hum0365.v1

JGAS000569

生活習慣病における腸内細菌の役割について

v1:2023/06/09

NGS

(CAGE-seq)

転写開始点同定

Illumina

(HiSeq 2500)

健常者:103名

肥満症:98症例

耐糖能異常:97症例

(日本人)

大野 博司

制限(Type I)

hum0366.v1

E-GEAD-551

E-GEAD-552

新型コロナウイルス感染症(COVID-19)の病態解明

v1:2023/03/16

NGS

(scRNA-seq、RNA-seq、ATAC-seq)

発現

クロマチン構造

Illumina

(NovaSeq 6000)

COVID-19:16症例

健常者:10症例

(日本人)

加藤 保宏

非制限公開

hum0367.v1

JGAS000558

血液疾患のゲノム解析研究

v1:2022/09/21

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(MiSeq)

ランゲルハンス細胞組織球症:1症例

(日本人)

東條 有伸

制限(Type I)

hum0368.v1

JGAS000559

全ゲノム配列決定によるICF症候群の新規原因遺伝子の探索および機能解析

v1:2022/11/29

NGS

(PBAT-seq)

メチル化

Illumina

(NovaSeq 6000)

ICF症候群:1症例

(日本人)

鵜木 元香

制限(Type I)

hum0369.v1

JGAS000562

医療従事者の新型コロナウィルス感染抵抗性についての検討

v1:2022/09/28

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(NextSeq 500)

健常者:139名

(日本人)

川口 敦史

制限(Type I)

hum0371.v1

JGAS000574

肝臓疾患に関与する遺伝子とタンパク質の探索に関する研究

v1:2022/12/22

メタゲノム

メタゲノム

Illumina

(MiSeq)

非アルコール性脂肪性肝炎:20症例

(日本人)

建石 良介

制限(Type I)

hum0372.v1

JGAS000572

MTBKS213

MTBKS214

多層的オミクス解析による疾患病態の解明

メタボリック・シンドローム関連疾患における個別化医療の実現

v1:2022/11/22

メタボローム

メタボローム

Agilent Technologies

(Agilent CE system、Agilent LC System)

2型糖尿病:300症例

(日本人)

山内 敏正

非制限公開

制限(Type I)

hum0376.v2

JGAS000585

臨床検体からのゼノグラフト株・培養細胞株の樹立

v1:2022/12/27

v2:2023/03/28

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(NextSeq 500)

子宮内膜癌:2+4症例

(日本人)

今井 俊夫

制限(Type I)

hum0377.v1

JGAS000579

不整脈症候群の遺伝子基盤に関する研究

v1:2022/12/13

NGS

(Amplicon-seq)

配列決定

Thermo Fisher Scientific

(Ion Proton)

QT延長症候群:556症例

(日本人)

田中 敏博

制限(Type I)

hum0379.v1

JGAS000578

制御性T細胞特異的エピゲノム誘導による免疫制御の研究

v1:2023/11/20

NGS

(scRNA-seq、scVDJ-seq)

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

重症筋無力症:2症例

多発性硬化症:4症例

全身性エリテマトーデス:3症例

健常者:3名

(日本人)

坂口 志文

制限(Type I)

hum0381.v1

JGAS000588

切除不能または再発胸腺癌に対するニボルマブの多施設共同第II相試験(NCCH1505)附随研究

v1:2023/01/05

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(NextSeq 500)

胸腺癌:15症例

(日本人)

堀之内 秀仁

制限(Type I)

hum0382.v1

JGAS000587

造血器疾患における遺伝子異常・エピジェネティクス異常の解析

v1:2023/01/19

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(NovaSeq 6000)

FUS-ERGを伴う急性骨髄性白血病:1症例

(日本人)

河原 真大

制限(Type I)

hum0383.v1

JGAS000602

生物学的製剤投与前後のリンパ球の遺伝子発現修飾の解析

v1:2023/03/28

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

関節リウマチ:5症例

(日本人)

藤尾 圭志

制限(Type I)

hum0384.v1

JGAS000603

JGAS000718

造血器腫瘍の分子病態の解明と新規治療薬開発の基盤構築

v1:2024/06/19

NGS

(RNA-seq、Target Capture、ATAC-seq)

発現

配列決定

Illumina

(HiSeq 1500/2500、MiSeq)

急性骨髄芽球性白血病:4症例

骨髄異形成症候群:30症例

(日本人)

正常細胞:6検体

(細胞株)

岩間 厚志

制限(Type I)

hum0385.v2

JGAS000597

JGAS000599

混合型肝癌、細胆管細胞癌、Cytokeratin19陽性肝細胞癌、SOX9陽性肝細胞癌の網羅的DNA変異解析

v1:2023/12/14

v2:2024/01/09

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(NovaSeq 6000)

細胆管細胞癌:8症例

混合型肝癌:13症例

(日本人)

石井 隆道

制限(Type I)

hum0386.v1

DRA015813

長鎖リードの局所アセンブリによる一塩基解像度でのヒト反復配列のゲノムワイド解析

v1:2023/04/11

NGS

(WGS)

配列決定

Nanopore

(MinION)

HapMap:1検体

(細胞株)

藤本 明洋

非制限公開

hum0389.v1

JGAS000605

胎児発育異常の遺伝子・ゲノム解析

v1:2023/04/04

NGS

(Capture Methyl-seq)

メチル化

Illumina

(HiSeq X)

健常女性:4名

(日本人)

中林 一彦

制限(Type I)

hum0390.v1

JGAS000621

ゲノム・エピゲノム解析による慢性子宮内膜炎の関連遺伝子の解明とその診断法および治療法の検討

v1:2023/06/30

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(HiSeq X Ten)

慢性子宮内膜炎:24症例

対照者:33名

(日本人)

黒田 恵司

制限(Type I)

hum0394.v1

JGAS000613

非小細胞肺癌における空間トランスクリプトーム解析に関する多施設共同研究

v1:2024/04/08

NGS

(Visium Spatial Gene Expression)

病理画像

Xenium In Situ Gene Expression

Multiplex Fluorescence Immunostaining

発現

病理画像

Illumina

(NovaSeq 6000)

10x Genomics

(Xenium Analyzer)

Akoya Biosciences

(PhenoCycler)

非小細胞肺癌:8症例

(日本人)

鈴木 絢子

制限(Type I)

hum0395.v1

JGAS000678

食・腸内マイクロバイオーム・健康情報統合データベース構築に向けた網羅的研究調査(愛称:すこやか健康調査):北海道情報大学

食と健康の関係性と遺伝的背景に関する検討:北海道情報大学

v1:2024/04/01

血液・尿検査

計測データ

アンケート調査

問診結果

被験者属性

睡眠日誌、睡眠時心拍・脳波

微生物組成

食事調査、食物摂取頻度調査

メタボロミクス

SNP-chip

健康調査

配列決定

Affymetrix

(Japonica Array v2)

健常成人:963名

(日本人)

西平 順

制限(Type I)

hum0396.v1

JGAS000679

食・腸内マイクロバイオーム・健康情報統合データベース構築に向けた網羅的研究調査(愛称:すこやか健康調査):宮崎大学

食と健康の関係性と遺伝的背景に関する検討:宮崎大学

v1:2024/04/01

血液・尿検査

計測データ

アンケート調査

問診結果

被験者属性

睡眠日誌、睡眠時心拍・脳波

微生物組成

食事調査、食物摂取頻度調査

メタボロミクス

SNP-chip

健康調査

配列決定

Affymetrix

(Japonica Array v2)

健常成人:50名

(日本人)

吉村 学

制限(Type I)

hum0397.v1

JGAS000680

食・腸内マイクロバイオーム・健康情報統合データベース構築に向けた網羅的研究調査(愛称:すこやか健康調査):京都大学

食と健康の関係性と遺伝的背景に関する検討:京都大学

v1:2024/04/01

血液・尿検査

計測データ

アンケート調査

問診結果

被験者属性

睡眠日誌、睡眠時心拍・脳波

微生物組成

食事調査、食物摂取頻度調査

SNP-chip

健康調査

配列決定

Affymetrix

(Japonica Array v2)

健常成人:50名

(日本人)

稲垣 暢也

制限(Type I)

hum0398.v1

JGAS000681

食・腸内マイクロバイオーム・健康情報統合データベース構築に向けた網羅的研究調査(愛称:すこやか健康調査):長崎県立大学

v1:2024/04/01

血液・尿検査

計測データ

アンケート調査

問診結果

被験者属性

睡眠日誌、睡眠時心拍・脳波

微生物組成

食事調査、食物摂取頻度調査

健康調査

-

健常成人:59名

(日本人)

田中 一成

制限(Type I)

hum0399.v1

JGAS000616

乳がん微小環境形成に関わる分子生物学的機序の生体試料を用いた探索研究

v1:2024/06/12

NGS

(Visium Spatial Gene Expression)

病理画像

発現

病理画像

Illumina

(NovaSeq 6000)

乳癌:2症例

(日本人)

河岡 慎平

(ゲノム支援)

制限(Type I)

hum0401.v1

JGAS000618

創薬をめざした新規骨・軟部肉腫細胞株および疾患モデル動物の開発

v1:2023/06/29

NGS

(Exome、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

MGI

(DNBSEQ-G400)

悪性骨巨細胞腫:1症例

(日本人)

若松 透

制限(Type I)

hum0402.v1

DRA016537

E-GEAD-622

大腸多段階発がん進化の過程においてドライバー変異を生じる機序の解明

v1:2024/04/12

NGS

(Visium Spatial Gene Expression)

病理画像

発現

病理画像

MGI

(DNBSEQ-G400)

大腸癌:4症例

(日本人)

三森 功士

非制限公開

hum0403.v1

JGAS000622

泌尿器癌におけるリキッドバイオプシーの有用性の検討

v1:2023/07/27

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(NextSeq 500)

転移性尿路上皮癌:16症例

(日本人)

濱田 和希

制限(Type I)

hum0405.v1

JGAS000623

小児・成人悪性腫瘍がん幹細胞の同定に関する研究

v1:2023/12/25

NGS

(Exome、RNA-seq、small RNA-seq)

発現

Illumina

(HiSeq X、NextSeq 550)

MGI

(DNBSEQ-G400RS)

小児B前駆細胞性急性リンパ性白血病:69症例

(日本人)

滝田 順子

制限(Type I)

hum0406.v1

JGAS000617

E-GEAD-623

ヒト疾患特異的iPS細胞の作成とそれを用いた疾患解析に関する研究

v1:2023/08/29

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(NextSeq 2000)

SFTPCバリアントにおける家族性間質性肺炎:1症例

(日本人)

後藤 慎平

非制限公開

制限(Type I)

hum0409.v1

JGAS000619

抗がん剤治療におけるExceptional Responseをもたらす遺伝子の研究

v1:2023/06/27

NGS

(Exome、RNA-seq、Target Capture)

配列決定

発現

Illumina

(NextSeq 550、NovaSeq 6000)

MDM2増幅内膜肉腫:11症例

(日本人)

小山 隆文

制限(Type I)

hum0411.v1

JGAS000625

対応可能(actionable)な内分泌疾患(腫瘍性のものを含む)の次世代シーケンサーを用いた分子生物学的解析による分子診断の検討

v1:2023/07/18

NGS

(Exome)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

FBPase欠損症:1症例

家族:3名

(日本人)

田中 知明

制限(Type I)

hum0413.v1

JGAS000628

アトピー性皮膚炎患者の網羅的データ解析研究

v1:2023/07/20

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(HiSeq 1500/2500)

アトピー性皮膚炎:161症例

健常者:41名

(日本人)

古関 明彦

制限(Type I)

hum0414.v1

DRA016800

ゲノム解析に基づく肺がんの発生・進展の分子機構の解明

v1:2023/07/25

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(NovaSeq 6000)

小気道上皮細胞株(SAEC)と派生細胞株:計5株

(細胞株)

塩谷 文章

非制限公開

hum0416.v1

E-GEAD-635

経時的な多層的オミックス解析を通した免疫難病及びがんにおける生体反応の解明と新規治療法の開発

v1:2023/08/10

NGS

(CITE-seq)

発現

Illumina

(HiSeq 2500、NovaSeq 6000)

顕微鏡的多発血管炎:8症例

健常者:7名

(日本人)

北沢 剛久

非制限公開

hum0419.v3

JGAS000641

JGAS000653

JGAS000664

ヒト消化器癌、胸部悪性腫瘍オルガノイド培養系のゲノム医療への応用

v1:2024/04/24

v2:2024/05/08

v3:2024/06/17

NGS

(Exome、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

肺大細胞神経内分泌癌:3症例

粘液産生能を有する充実型肺腺癌:1症例

EML4-ALK variant 3(v3)をドライバー遺伝子にもつ肺腺癌:1症例

(日本人)

深澤 拓也

制限(Type I)

hum0427.v1

JGAS000645

頭頸部悪性腫瘍細胞株の樹立

頭頸部悪性腫瘍に対する網羅的遺伝子解析およびデータベースの構築

v1:2023/11/02

NGS

(Exome)

配列決定

MGI

(DNBSEQ-G400)

外耳道扁平上皮癌:1症例

(日本人)

中川 尚志

制限(Type I)

hum0429.v1

JGAS000643

CRISPR screening identifies mechanisms of resistance to KRASG12C and SHP2 inhibitor combinations in non-small cell lung cancer

v1:2023/11/13

NGS

(WGS、RNA-seq)

配列決定

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

ヒト肺がん細胞株LU99を移植したマウスの腫瘍組織:計16検体

(細胞株)

Saskia Brachmann

制限(Type I)

hum0431.v1

JGAS000651

精神神経疾患における病態生理・発症脆弱性・治療反応性等の解明、および新規治療法・診断予防法の開発を目指した遺伝子解析

v1:2024/01/25

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

自閉スペクトラム症患者で同定された変異を導入した遺伝子改変ヒトiPS細胞株:5検体

コントロール遺伝子改変ヒトiPS細胞株:4検体

(細胞株)

髙田 篤

制限(Type I)

hum0435.v1

JGAS000665

iPS細胞由来心筋細胞における網羅的核酸解析を用いた再生医療用細胞作製方法の検討

v1:2024/03/18

NGS

(scRNA-seq)

発現

Illumina

(HiSeq 3000)

HLAホモ健常ドナー1名の細胞から樹立されたヒトiPS細胞から分化誘導した心筋細胞:1検体

(細胞株)

宮川 繁

制限(Type I)

hum0436.v1

JGAS000668

自閉症の発症原因解明のための遺伝子多形及び遺伝子転写についての研究

v1:2024/02/06

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(HiSeq 2000)

自閉症:16症例

対照者:17名

(細胞株)

丸井 徹也

制限(Type I)

hum0437.v1

JGAS000671

悪性脳腫瘍の新たなバイオマーカー及び分子標的の探索とそれらの臨床応用に向けた多施設共同研究による遺伝子解析

v1:2024/03/05

NGS

(RNA-seq)

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

グリオーマ:124症例

(日本人)

高阪 真路

制限(Type I)

hum0439.v1

DRA017996

脂質異常症に関わる遺伝子と病態との関連の検討

v1:2024/02/27

NGS

(Target Capture)

配列決定

Nanopore

(MinION)

家族性高コレステロール血症:5症例

対照者:1名

(日本人)

尾野 亘

非制限公開

hum0440.v1

JGAS000672

E-GEAD-747

神経・筋組織を用いた難治性神経筋疾患の臨床経過に関連する蛋白の解明

v1:2024/05/17

NGS

(Visium Spatial Gene Expression)

病理画像

発現

病理画像

MGI

(DNBSEQ-G400RS)

胸腺腫:7症例

胸腺過形成:2症例

(日本人)

奥野 龍禎

非制限公開

制限(Type I)

hum0443.v1

DRA017833

E-GEAD-674

妊娠前後での制御性T細胞のT細胞受容体レパートリーの変化と妊娠予後との関係

v1:2024/05/10

NGS

(Target RNA-seq、TCR-seq)

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

正常妊娠:7名

妊娠高血圧腎症:3症例

(日本人)

中島 彰俊

非制限公開

hum0444.v1

JGAS000684

遺伝学的変化を要因とする皮膚疾患のマルチオミックス解析による病態解明の研究

v1:2024/04/03

NGS

(WGS、Exome、ロングリードWGS、Amplicon-seq、RNA-seq)

SNPアレイ

メチル化アレイ

配列決定

発現

メチル化

MGI

(DNBSEQ-T7)

Illumina

(NovaSeq 6000、MiSeq、Infinium Asian Screening Array、Infinium MethylationEPIC)

PacBio

(Sequel II)

汗孔角化症:8症例

(日本人)

久保 亮治

制限(Type I)

hum0456.v1

JGAS000722

傍鞍部頭蓋底腫瘍及び、悪性神経膠腫組織を用いた分子生物学的解析による腫瘍の形成と機能的分化における分子病態の検討

v1:2024/07/17

NGS

(scRNA-seq)

発現

Illumina

(NovaSeq 6000)

頭蓋咽頭腫:10症例

(日本人)

松田 達磨

制限(Type I)

hum0461.v1

JGAS000712

食道扁平上皮癌、大腸癌に対する放射線治療後のがん免疫応答の解析

v1:2024/05/31

NGS

(scRNA-seq、Visium Spatial Gene Expression)

病理画像

発現

病理画像

Illumina

(HiSeq 3000、NovaSeq 6000)

食道扁平上皮癌:7症例

(日本人)

影山 俊一郎

制限(Type I)

DDBJ Searchにおいて、the DDBJ Sequence Read Archive(DRA)、the European Sequence Read Archive(ERA)およびthe Sequence Read Archive(SRA)に登録済みデータを検索できます。

*データ利用申請が承認されたデータ利用者が閲覧・利用できる、NBDCおよび生命情報・DDBJ センターが加工したデータ(例:特定の解析パイプラインにより加工したアライメントデータ・バリアントコールデータ・統計データ)を含む。加工データに関する詳細はこちら