データセット ID
NHA000007
- データの種類
- 筋萎縮性側索硬化症92症例の遺伝子型カウント情報
（JSNPのデータ） - アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 3.3 MB
- ファイル形式
- XLSX
- ZIP
- 研究
- hum0014
- 公開日
- 2015-12-28
- 更新日
- 2015-12-28
- Secondary ID
- hum0014.v2.jsnp.92als.v1
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0014.v2.jsnp.92als.v1.zip | 3.3 MB | ||
| hum0014.v2.jsnp.92als_ | Dictionary file | 33.3 KB |
解析手法
Case-control association study (Invader genotyping)
- 材料と対象者
- 筋萎縮性側索硬化症：92症例（JSNP）
- 試料説明
- 末梢血から抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 試料の入手元
- N/A
- 測定対象
- N/A
- プラットフォーム
- Hologic Japan Invader
- QC・フィルタリング
- SNP call rate ≥ 0.95（疾患群、対照群）, HWE P ≥1.0 x 10^-2（対照群）
- 解析方法
- ABI PRISM SDS versions 2.0 - 2.2
- バリアント数
- 48,939 SNPs