データセット ID
NHA000044
- データの種類
- 2型糖尿病9,817症例および
対照者6,763名のGWAS - アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 86.1 MB
- ファイル形式
- XLSX
- 研究
- hum0014
- 公開日
- 2016-01-28
- 更新日
- 2016-01-28
- Secondary ID
- hum0014.v3.T2DM-1.v1
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0014.v1.freq.v1_ | Dictionary file | 9.7 KB | |
| hum0014.v3.T2DM-1.v1.xlsx | 86.1 MB | ||
| hum0014_ | Dictionary file | 10.2 KB |
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
- 2型糖尿病：9,817症例、
対照者：6,763名（健常者および糖尿病を合併していない脳動脈瘤、食道がん、子宮体がん、肺気腫、緑内障の患者） - 試料説明
- 末梢血から抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina HumanOmniExpressExome
- 参照ゲノム
- GRCh37
- QC・フィルタリング
- Sample Call rate < 0.98, SNP call rate < 0.99, MAF < 0.01 HWE P < 1 x 10^-6 in control
- 解析方法
- GenCall software（GenomeStudio）
- バリアント数
- 552,915 SNPs