データセット ID
NHA000001
- データの種類
- 心筋梗塞1,666症例および
対照健常者3,198名のGWAS - アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 74.8 MB
- ファイル形式
- XLSX
- 研究
- hum0014
- 公開日
- 2014-09-30
- 更新日
- 2014-09-30
- Secondary ID
- hum0014.v1.freq.v1
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0014.v1.freq.v1_ | Dictionary file | 9.7 KB | |
| hum0014_ | 74.8 MB | ||
| hum0014_ | Dictionary file | 10.2 KB |
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
- 心筋梗塞：1,666症例、対照健常者：3,198名
- 試料説明
- 末梢血から抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina Human610-Quad
Illumina HumanHap550 - 参照ゲノム
- NCBI36
- QC・フィルタリング
- Sample Call rate < 0.98, SNP call rate < 0.99, HWE P < 1 x 10^-6
- 解析方法
- GenCall software（GenomeStudio）
- バリアント数
- 455,781 SNPs