データセット ID
JGAD000400
- データの種類
- 2003年から2007年度にバイオバンク・ジャパンに登録されたサンプル（約20万例）から抽出された11,234名の23遺伝子における全てのエクソン領域のTarget Capture Sequencingn解析より得られた体細胞変異データおよびSNPアレイにより得られた染色体変異データ
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 687 KB
- ファイル形式
- CSV
- 研究
- hum0014
- 公開日
- 2021-05-21
- 更新日
- 2022-12-20
- DDBJ Search
- JGAD000400 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000293 (新しいタブで開きます)
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
- 2003年から2007年度にバイオバンク・ジャパンに登録されたサンプル（約20万例）から抽出された11,234名
- 対象者数11,234 (人数)
- コホートBioBank Japan
- 対象集団日本人
- 試料説明
- 末梢血から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- HumanOmniExpress BeadChip Kit
HumanOmniExpressExome BeadChip Kit - プラットフォーム
- Illumina HumanOmniExpress
Illumina HumanOmniExpressExome - QC・フィルタリング
- 上記の3バージョンのアレイの全てでカバーされているSNPsを使用した
- 解析方法
- GenCall software（GenomeStudio）
- バリアント数
- 515,355
- 加工データの種類
- Somatic CNV