2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
JGAD000400
- 公開日
- 2021-05-21
- 更新日
- 2021-05-21
- 研究
- hum0014
- データの種類
- 2003年から2007年度にバイオバンク・ジャパンに登録されたサンプル(約20万例)から抽出された11,234名の23遺伝子における全てのエクソン領域のTarget Capture Sequencingn解析より得られた体細胞変異データおよびSNPアレイにより得られた染色体変異データ
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- JGA Study
- JGAS000293
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
2003年から2007年度にバイオバンク・ジャパンに登録されたサンプル(約20万例)から抽出された11,234名
- 実験方法
genome wide SNVs
- プラットフォーム
Illumina [HumanOmniExpress、OmniExpressExome]
- 試料説明
末梢血から抽出したDNA
- 試薬
Illumina Infinium OmniExpress, Infinium OmniExpressExome v.1.0, or v.1.2
- 解析方法
GenCall software(GenomeStudio)
- フィルタリング
上記の３バージョンのアレイの全てでカバーされているSNPsを使用した
- バリアント数
515,355
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
5.3 MB(csv)
- 利用ポリシー