データセット ID
JGAD000288
- データの種類
- 遺伝性前立腺がん7,636症例と対照者12,366名の遺伝性前立腺がん原因8遺伝子翻訳領域のTarget Capture Sequencingデータ
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 2.4 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0014
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000288 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000203 (新しいタブで開きます)
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- 遺伝性前立腺がん（ICD10：C61）：7,636症例
対照者：12,366名 - 健康状態混在
- 対象者数20,002 (人数)
- 疾患
- 遺伝性前立腺がん
- 試料説明
- 末梢血から抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- 遺伝性前立腺がんの原因8遺伝子（ATM, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CHEK2, HOXB13, NBN, PALB2）の翻訳領域
- 試薬キット
- KAPA HiFi DNA Polymerase
2X Platinum Multiplex PCR Master Mix - 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp