データセット ID
JGAD000438
- データの種類
- 膵がん1,005症例の遺伝性腫瘍関連27遺伝子翻訳領域のTarget Capture Sequencingデータ
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 83.6 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0014
- 公開日
- 2021-12-24
- 更新日
- 2021-12-24
- DDBJ Search
- JGAD000438 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000327 (新しいタブで開きます)
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 試料 / 対象者
- 膵がん（ICD10：C25）：1,005症例
対照者：23,705名＋5,996名＋37,592名 - 健康状態混在
- 対象者数1005 (人数)
- 疾患
- 膵がん
- 試料説明
- 末梢血から抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 購入試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 対象領域
- 遺伝性腫瘍関連27遺伝子（APC, ATM, BARD1, BMPR1A, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDK4, CDKN2A, CDH1, CHEK2, EPCAM, HOXB13, NBN, NF1, MLH1, MSH2, MSH6, MUTYH, PALB2, PMS2, PTEN, RAD51C, RAD51D, SMAD4, STK11, TP53）の翻訳領域
- 試薬キット
- KAPA HiFi DNA Polymerase
2X Platinum Multiplex PCR Master Mix - 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp