データセット ID
JGAD000209
- データの種類
- 乳がん7,104症例と対照者23,731名の遺伝性乳がん原因11遺伝子翻訳領域のTarget Capture Sequencingデータ
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 1.6 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0014
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000209 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000140 (新しいタブで開きます)
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- 乳がん（ICD10：C509）：7,104症例
対照者：23,731名 - 健康状態混在
- 対象者数30,835 (人数)
- 疾患
- 乳がん
- 試料説明
- 末梢血から抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- 遺伝性乳がんの原因11遺伝子（ATM, BRCA1, BRCA2, CDH1, CHEK2, NBN, NF1, PALB2, PTEN, STK11, TP53）の翻訳領域
- 試薬キット
- KAPA HiFi DNA Polymerase
2X Platinum Multiplex PCR Master Mix - 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp