データセット ID
NHA000045
- データの種類
- 2型糖尿病5,646症例および
対照者19,420名のGWAS - アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 74.4 MB
- ファイル形式
- XLSX
- 研究
- hum0014
- 公開日
- 2016-01-28
- 更新日
- 2016-01-28
- Secondary ID
- hum0014.v3.T2DM-2.v1
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0014.v1.freq.v1_ | Dictionary file | 9.7 KB | |
| hum0014.v3.T2DM-2.v1.xlsx | 74.4 MB | ||
| hum0014_ | Dictionary file | 10.2 KB |
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
- 2型糖尿病：5,646症例、
対照者：19,420名 （糖尿病を合併していない大腸-直腸がん、乳がん、前立腺がん、肺がん、胃がん、
閉塞性動脈硬化症、不整脈、脳梗塞、心筋梗塞、胆嚢・胆管がん、膵がん、過敏性症候群（薬疹）、
関節リウマチ、筋萎縮性側索硬化症、肝がん、肝硬変、骨粗鬆症、子宮筋腫の患者） - 試料説明
- 末梢血から抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina Human610-Quad
- 参照ゲノム
- NCBI36
- QC・フィルタリング
- Sample Call rate < 0.98, SNP call rate < 0.99, MAF < 0.01 HWE P < 1 x 10^-6 in control
- 解析方法
- GenCall software（GenomeStudio）
- バリアント数
- 479,088 SNPs