hum0201 のリリース情報
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hum0201-v9
2026-04-21- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- 大腸がん3症例、十二指腸腺腫3症例、胃がん1症例、健常者1名の腫瘍組織、正常組織より樹立したオルガノイドまたは遺伝子改変オルガノイドから抽出したDNA/RNAを用いたWhole Exome sequencing解析、RNA sequencing解析の結果をfastqファイルにて提供する。
hum0201-v8
2024-08-28- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- 正常膵管を対象とした遺伝子改変オルガノイド、または、膵がん50症例の腫瘍組織より樹立したオルガノイドから抽出したDNA/RNAを用いたWhole Exome sequencing解析、RNA sequencing解析、single cell RNA sequencing解析、ATAC sequencing解析、ChIP sequencing解析の結果をfastqファイルおよびbedファイルにて提供する。
hum0201-v7
2022-12-27- このリリースで追加されたデータセット
追加されたデータセットはありません。
- リリースノート
- The alignment results [CRAM], variant call results per sample [gVCF], and variant call results per dataset [aggregated VCF] processed JGAD000335 in a certain workflow were provided. If you plan to use the data, please indicate both original data (JGAD000335) and processed data (JGAD000687) on the application form for data use.
hum0201-v6
2022-08-05- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- 腫瘍性疾患1症例の正常大腸組織から抽出したRNAを用いたsingle cell RNA sequecing解析結果および腫瘍性疾患2症例の正常大腸組織より樹立したオルガノイドより抽出したDNA、RNAを用いたWhole Exome sequecing解析、RNA sequecing解析の結果をfastqファイルにて提供する。
hum0201-v5
2022-06-06- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- 腫瘍性疾患2症例の大腸腫瘍組織より樹立したオルガノイドに対して、幾つかの条件（抗がん剤投与など）を振って培養した後の細胞、並びに、マーカーを使って分取した細胞集団から抽出したRNAを用いたRNA sequecing解析結果をfastqファイルにて提供する。
hum0201-v4
2021-11-19- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- 腫瘍性疾患4症例の大腸腫瘍組織4検体および非腫瘍組織 （正常大腸上皮）1検体より樹立したオルガノイドから抽出したRNA、DNAを用いたRNA sequecing解析、ChIP sequencing解析結果をfastqファイルにて提供する。
hum0201-v3
2020-11-20- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- 2D培養した腫瘍性疾患1症例の正常十二指腸オルガノイドの培養液のローテーションの有無による遺伝子発現の変化を解析した。4日間の培養液ローテーションあり、なし、およびローテーションから0、1、2、4日後（6条件）のRNAを抽出し、Hiseq X Tenでシーケンスを行った結果をfastqファイルにて提供する。
hum0201-v2
2020-10-06- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- 腫瘍性疾患の腫瘍組織および非腫瘍組織より樹立したオルガノイドおよび末梢血から抽出したDNA、RNAを用いたWhole Genome sequecing解析、RNA sequecing解析結果をfastqファイルにて提供する。
hum0201-v1
2019-12-20- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- 潰瘍性大腸炎、および、腫瘍を併発する潰瘍性大腸炎の疾患組織（腫瘍・炎症部位）並びに正常腸管上皮組織から樹立したオルガノイド、 末梢血、および、患者の疾患組織から抽出したDNAを用いたWhole Exome sequecing解析結果をfastqファイルにて提供する。