データセット ID
JGAD000464
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 46.5 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0201
- 公開日
- 2022-06-06
- 更新日
- 2022-06-06
- DDBJ Search
- JGAD000464 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000350 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 腫瘍性疾患（ICD10：C16）：2症例（11検体）
（大腸腫瘍組織より樹立したオルガノイド） - 健康状態罹患
- 対象者数11 (検体数)
- 疾患
- 腫瘍性疾患
- 試料説明
- 大腸腫瘍組織より樹立したオルガノイドから抽出したRNA
幾つかの条件（抗がん剤投与など）を振って培養した後の細胞、並びに、マーカーを使って分取した細胞集団 - 組織結腸、オルガノイド
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq RNA Library Prep Kit
TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit - 断片化
- 熱処理
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 4000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 250 bp
150 bp