2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
JGAD000464
- 公開日
- 2022-06-06
- 更新日
- 2026-04-21
- 研究
- hum0201
- データの種類
- NGS(RNA-seq)
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- JGA Study
- JGAS000350
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
腫瘍性疾患(ICD10: C16): 2症例(11検体) (大腸腫瘍組織より樹立したオルガノイド)
- 実験方法
RNA-seq
- プラットフォーム
Illumina [HiSeq 4000]
- 試料説明
大腸腫瘍組織より樹立したオルガノイドから抽出したRNA 幾つかの条件(抗がん剤投与など)を振って培養した後の細胞、並びに、マーカーを使って分取した細胞集団
- ライブラリ構築
TruSeq RNA Library Prep Kit v2 TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit
- 断片化
熱処理
- リードタイプ
Paired-end
- リード長
250 bp/150 bp
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
108.9 GB (fastq)
- 利用ポリシー