データセット ID
JGAD000359
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 39.1 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0201
- 公開日
- 2020-11-20
- 更新日
- 2020-11-20
- DDBJ Search
- JGAD000359 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000256 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 腫瘍性疾患（ICD10：C16）：1症例（1検体）
（正常十二指腸組織より樹立したオルガノイド） - 健康状態罹患
- 対象者数1 (人数)
- 疾患
- 腫瘍性疾患
- 試料説明
- 正常十二指腸組織より樹立したオルガノイドから抽出したRNA
4日間の培養液ローテーションあり、なし、およびローテーションから0、1、2、4日後（6条件） - 組織Duodenum organoid
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq RNA Library Prep Kit
TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit - 断片化
- 熱処理
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq X
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 250 bp
150 bp