2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
hum0006-v6
このリリースで追加されたデータセット
リリースノート
このバージョンでは、 グリオーマ1症例の左前頭葉の正常部位より抽出したDNA/RNAを用いたFLeCS-seq、SMART-seq、RNA-seq、short-read WGS、ultralong-read WGS解析の結果をfastqもしくはbamファイルにて提供する。
バージョン公開日
2026-06-03hum0006-v5
このリリースで追加されたデータセット
リリースノート
このバージョンでは、脳海綿状血管奇形12症例、椎体血管腫1症例、眼窩内海綿状血管奇形3症例の病変組織および末梢血より抽出したDNAを用いた6110遺伝子領域のTarget Capture Sequencing解析の結果をfastqファイルにて提供する。
バージョン公開日
2022-08-08hum0006-v4
このリリースで追加されたデータセット
リリースノート
このバージョンでは、グリオーマ94症例 (114検体) を対象とした以下の解析結果を追加した (JGAS000146) 。 ・ Exome (JGAD000215、JGAD000218) : グリオーマ: 12症例 (腫瘍組織: 25検体、非腫瘍組織: 12検体) 腫瘍組織および末梢血 (非腫瘍組織) から抽出したDNAを対象としてSureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した (Paired-end) 。 ・ RNA-seq (JGAD000216、JGAD000219) : グリオーマ: 23症例 (31検体) 腫瘍組織から抽出したRNAを対象としてTruSeq Stranded Total RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、Illumina社HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した (Paired-end) 。 ・ Methylation array (JGAD000217) : グリオーマ: 93症例 (113検体) 腫瘍組織から抽出したDNAを対象としてIllumina社HumanMethylation 450 BeadChipにてメチル化解析を行った。
バージョン公開日
2019-02-13hum0006-v3
このリリースで追加されたデータセット
リリースノート
このバージョンでは、グリオーマ (小脳17症例、視床14症例、大脳8症例) を対象とした以下の解析結果を追加した (JGAS000106) 。 ・ Exome: 小脳グリオーマ: 17症例 (34検体) 腫瘍組織および末梢血 (非腫瘍組織) から抽出したDNAを対象としてSureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した (Paired-end) 。 ・ RNA-seq: 小脳グリオーマ17症例 (17検体) および大脳グリオーマ8症例 (8検体) 腫瘍組織から抽出したRNAを対象としてTruSeq Stranded Total RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、Illumina社HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した (Paired-end) 。 ・ Methylation array: 小脳グリオーマ17症例 (17検体) および視床グリオーマ14症例 (14検体) 腫瘍組織から抽出したDNAを対象としてIllumina社HumanMethylation 450 BeadChipにてメチル化解析を行った。
バージョン公開日
2017-09-01hum0006-v2
このリリースで追加されたデータセット
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リリースノート
このバージョンでは、オリゴデンドログリオーマ16症例を対象とした以下の解析結果をJGAS000004に追加した。 ・ Exome: 48検体 腫瘍組織および末梢血 (非腫瘍組織) から抽出したDNAを対象としてSureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した (Paired-end) 。 ・ RNA-seq: 27検体 腫瘍組織から抽出したRNAを対象としてTruSeq Stranded Total RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、Illumina社HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した (Paired-end) ・ Methylation array: 30検体 腫瘍組織から抽出したDNAを対象としてIllumina社HumanMethylation 450 BeadChipにてメチル化解析を行った。
バージョン公開日
2017-06-05hum0006-v1
このリリースで追加されたデータセット
リリースノート
このバージョンでは、アストロサイトーマ6症例の初発時・再発時の腫瘍組織および末梢血 (非腫瘍組織) から抽出したDNAを用いたExome解析の結果をbamファイルにて提供する。SureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した (Paired-end) 。
バージョン公開日
2014-01-31
