hum0006 のリリース情報
hum0006-v6
2026-06-03- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- このバージョンでは、 グリオーマ1症例の左前頭葉の正常部位より抽出したDNA/RNAを用いたFLeCS-seq、SMART-seq、RNA-seq、short-read WGS、ultralong-read WGS解析の結果をfastqもしくはbamファイルにて提供する。
hum0006-v5
2022-08-08- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- このバージョンでは、脳海綿状血管奇形12症例、椎体血管腫1症例、眼窩内海綿状血管奇形3症例の病変組織および末梢血より抽出したDNAを用いた6110遺伝子領域のTarget Capture Sequencing解析の結果をfastqファイルにて提供する。
hum0006-v4
2019-02-13- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- このバージョンでは、グリオーマ94症例（114検体）を対象とした以下の解析結果を追加した（JGAS000146）。
・ Exome（JGAD000215、JGAD000218）： グリオーマ：12症例（腫瘍組織：25検体、非腫瘍組織：12検体）
腫瘍組織および末梢血（非腫瘍組織）から抽出したDNAを対象としてSureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した（Paired-end）。
・ RNA-seq（JGAD000216、JGAD000219）： グリオーマ：23症例（31検体）
腫瘍組織から抽出したRNAを対象としてTruSeq Stranded Total RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、Illumina社HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した（Paired-end）。
・ Methylation array（JGAD000217）： グリオーマ：93症例（113検体）
腫瘍組織から抽出したDNAを対象としてIllumina社HumanMethylation 450 BeadChipにてメチル化解析を行った。
hum0006-v3
2017-09-01- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- このバージョンでは、グリオーマ（小脳17症例、視床14症例、大脳8症例）を対象とした以下の解析結果を追加した（JGAS000106）。
・ Exome： 小脳グリオーマ：17症例（34検体）
腫瘍組織および末梢血（非腫瘍組織）から抽出したDNAを対象としてSureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した（Paired-end）。
・ RNA-seq： 小脳グリオーマ17症例（17検体）および大脳グリオーマ8症例（8検体）
腫瘍組織から抽出したRNAを対象としてTruSeq Stranded Total RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、Illumina社HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した（Paired-end）。
・ Methylation array： 小脳グリオーマ17症例（17検体）および視床グリオーマ14症例（14検体）
腫瘍組織から抽出したDNAを対象としてIllumina社HumanMethylation 450 BeadChipにてメチル化解析を行った。
hum0006-v2
2017-06-05- このリリースで追加されたデータセット
追加されたデータセットはありません。
- リリースノート
- このバージョンでは、オリゴデンドログリオーマ16症例を対象とした以下の解析結果をJGAS000004に追加した。
・ Exome： 48検体
腫瘍組織および末梢血（非腫瘍組織）から抽出したDNAを対象としてSureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した（Paired-end）。
・ RNA-seq： 27検体
腫瘍組織から抽出したRNAを対象としてTruSeq Stranded Total RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、Illumina社HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した（Paired-end）
・ Methylation array： 30検体
腫瘍組織から抽出したDNAを対象としてIllumina社HumanMethylation 450 BeadChipにてメチル化解析を行った。
hum0006-v1
2014-01-31- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- このバージョンでは、アストロサイトーマ6症例の初発時・再発時の腫瘍組織および末梢血（非腫瘍組織）から抽出したDNAを用いたExome解析の結果をbamファイルにて提供する。SureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した（Paired-end）。