Human Data Logo
NBDC ヒトデータベース
NBDC Research ID:hum0006
  • hum0006-v6

    このリリースで追加されたデータセット

    リリースノート

    このバージョンでは、 グリオーマ1症例の左前頭葉の正常部位より抽出したDNA/RNAを用いたFLeCS-seq、SMART-seq、RNA-seq、short-read WGS、ultralong-read WGS解析の結果をfastqもしくはbamファイルにて提供する。

    バージョン公開日

    2026-06-03
  • hum0006-v5

    このリリースで追加されたデータセット

    リリースノート

    このバージョンでは、脳海綿状血管奇形12症例、椎体血管腫1症例、眼窩内海綿状血管奇形3症例の病変組織および末梢血より抽出したDNAを用いた6110遺伝子領域のTarget Capture Sequencing解析の結果をfastqファイルにて提供する。

    バージョン公開日

    2022-08-08
  • hum0006-v4

    このリリースで追加されたデータセット

    リリースノート

    このバージョンでは、グリオーマ94症例 (114検体) を対象とした以下の解析結果を追加した (JGAS000146) 。 ・ Exome (JGAD000215、JGAD000218) : グリオーマ: 12症例 (腫瘍組織: 25検体、非腫瘍組織: 12検体) 腫瘍組織および末梢血 (非腫瘍組織) から抽出したDNAを対象としてSureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した (Paired-end) 。 ・ RNA-seq (JGAD000216、JGAD000219) : グリオーマ: 23症例 (31検体) 腫瘍組織から抽出したRNAを対象としてTruSeq Stranded Total RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、Illumina社HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した (Paired-end) 。 ・ Methylation array (JGAD000217) : グリオーマ: 93症例 (113検体) 腫瘍組織から抽出したDNAを対象としてIllumina社HumanMethylation 450 BeadChipにてメチル化解析を行った。

    バージョン公開日

    2019-02-13
  • hum0006-v3

    このリリースで追加されたデータセット

    リリースノート

    このバージョンでは、グリオーマ (小脳17症例、視床14症例、大脳8症例) を対象とした以下の解析結果を追加した (JGAS000106) 。 ・ Exome: 小脳グリオーマ: 17症例 (34検体) 腫瘍組織および末梢血 (非腫瘍組織) から抽出したDNAを対象としてSureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した (Paired-end) 。 ・ RNA-seq: 小脳グリオーマ17症例 (17検体) および大脳グリオーマ8症例 (8検体) 腫瘍組織から抽出したRNAを対象としてTruSeq Stranded Total RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、Illumina社HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した (Paired-end) 。 ・ Methylation array: 小脳グリオーマ17症例 (17検体) および視床グリオーマ14症例 (14検体) 腫瘍組織から抽出したDNAを対象としてIllumina社HumanMethylation 450 BeadChipにてメチル化解析を行った。

    バージョン公開日

    2017-09-01
  • hum0006-v2

    このリリースで追加されたデータセット

    このリリースで追加されたデータセットはありません。

    リリースノート

    このバージョンでは、オリゴデンドログリオーマ16症例を対象とした以下の解析結果をJGAS000004に追加した。 ・ Exome: 48検体 腫瘍組織および末梢血 (非腫瘍組織) から抽出したDNAを対象としてSureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した (Paired-end) 。 ・ RNA-seq: 27検体 腫瘍組織から抽出したRNAを対象としてTruSeq Stranded Total RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、Illumina社HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した (Paired-end) ・ Methylation array: 30検体 腫瘍組織から抽出したDNAを対象としてIllumina社HumanMethylation 450 BeadChipにてメチル化解析を行った。

    バージョン公開日

    2017-06-05
  • hum0006-v1

    このリリースで追加されたデータセット

    リリースノート

    このバージョンでは、アストロサイトーマ6症例の初発時・再発時の腫瘍組織および末梢血 (非腫瘍組織) から抽出したDNAを用いたExome解析の結果をbamファイルにて提供する。SureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した (Paired-end) 。

    バージョン公開日

    2014-01-31