2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
NBDC ヒトデータベース申請業務ならびにJGA関係の業務につきまして、以下の期間休業いたします：2026年8月12日(水) 〜 2026年8月17日(月) 休業期間中にいただいた申請やお問い合わせ等は、休業明けの 8月18日(火) より順次対応させていただきます。 上記休業期間の前後は通常より対応が遅れることがあります。予めご了承ください。 ご迷惑をおかけいたしますが、ご理解とご協力をお願いいたします。
- 公開日
- 2026-06-04
- 更新日
- 2026-06-04
- 研究
- hum0006
- データの種類
- NGS(FLeCS-seq, SMART-seq, RNA-seq, short-read WGS, ultralong-read WGS)
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- JGA Study
- JGAS000877
解析手法
FLeCS-seq
- 材料と対象者
グリオーマ(ICD10: C71): 1症例(2検体)
- 実験方法
FLeCS-seq
- プラットフォーム
Nanopore [PromethION]
- 試料説明
左前頭葉の正常部位より抽出したRNA
- ライブラリ構築
Ligation Sequencing Kit V14
- リードタイプ
Single-end
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
752.5 GB (fastq)
- 利用ポリシー
SMART-seq
- 材料と対象者
グリオーマ(ICD10: C71): 1症例(1検体)
- 実験方法
SMART-seq
- プラットフォーム
Nanopore [PromethION]
- 試料説明
左前頭葉の正常部位より抽出したRNA
- ライブラリ構築
SMART-Seq mRNA Long Read、Ligation Sequencing Kit V14
- リードタイプ
Single-end
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
752.5 GB (fastq)
- 利用ポリシー
RNA-seq
- 材料と対象者
グリオーマ(ICD10: C71): 1症例(2検体)
- 実験方法
RNA-seq
- プラットフォーム
Element [AVITI]
- 試料説明
左前頭葉の正常部位より抽出したRNA
- ライブラリ構築
SMART-seq stranded Kit
- 断片化
マグネシウムイオン存在下での熱処理
- リードタイプ
Paired-end
- リード長
300 bp
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
752.5 GB (fastq)
- 利用ポリシー
Short-read WGS
- 材料と対象者
グリオーマ(ICD10: C71): 1症例(1検体)
- 実験方法
short-read WGS
- プラットフォーム
Illumina [NovaSeq 6000]
- 試料説明
左前頭葉の正常部位より抽出したDNA
- ライブラリ構築
TruSeq Nano DNA Library Prep Kit
- 断片化
超音波断片化
- リードタイプ
Paired-end
- リード長
300 bp
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
752.5 GB (fastq)
- 利用ポリシー
Ultralong-read WGS
- 材料と対象者
グリオーマ(ICD10: C71): 1症例(1検体)
- 実験方法
ultralong-read WGS
- プラットフォーム
Nanopore [PromethION]
- 試料説明
左前頭葉の正常部位より抽出したDNA
- ライブラリ構築
Monarch HMW DNA Extraction Kit for Tissue、Ultra-Long DNA Sequencing Kit V14
- リードタイプ
Single-end
- マッピング
minimap2(Dorado)
- マッピング品質
マッピング率 98.6％
- リファレンス配列
hg38(reference_accession: GCF_000001405.26)
- カバレッジ
44x
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
752.5 GB (bam)
- 利用ポリシー