データセット ID
JGAD000216
- データの種類
- グリオーマ
NGS（Exome、RNA-seq）、Methylation array - アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 325 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- BAM
- 研究
- hum0006
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000216 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000146 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- グリオーマ（ICD10：C71）：23症例（31検体）
初発時のみ：8症例、再発時のみ：7症例、初発時と再発時ペア：8症例
初発時グレードII/IIIグリオーマとその再発時ペアを含む31検体 - 健康状態罹患
- 対象者数31 (検体数)
- 疾患
- グリオーマ
- 試料説明
- 初発時・再発時の腫瘍組織（または同じ腫瘍の別の部位の腫瘍組織）および末梢血（非腫瘍組織）から抽出したRNA
- 組織脳、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit
- 断片化
- アルカリ法
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp