データセット ID
JGAD000004
- データの種類
- アストロサイトーマ
NGS（Exome） - アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 403 GB
- ファイル形式
- BAM
- 研究
- hum0006
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000004 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000004 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 脳腫瘍：
アストロサイトーマ（ICD10：C71）：6症例（23検体）
グリオーマ（ICD10：C71）：12症例（腫瘍組織：25検体、非腫瘍組織：12検体）
初発時と再発時のペア：11症例、初発時のみ1症例 - 健康状態罹患
- 対象者数6 (人数)
- 疾患
- アストロサイトーマ
- グリオーマ
- 試料説明
- 初発時・再発時の腫瘍組織（または同じ腫瘍の別の部位の腫瘍組織）および末梢血（非腫瘍組織）から抽出したDNA
- 組織脳、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V4
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris SS）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37