データセット ID
JGAD000217
- データの種類
- グリオーマ
NGS（Exome、RNA-seq）、Methylation array - アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 418 MB
- ファイル形式
- TXT
- 研究
- hum0006
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000217 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000146 (新しいタブで開きます)
解析手法
メチル化アレイ
- 材料と対象者
- グリオーマ（ICD10：C71）：93症例（113検体）
初発時のみ：69症例、再発時のみ：4症例、初発時と再発時ペア：20症例
初発時グレードII/IIIグリオーマとその再発時ペアを含む113検体 - 健康状態罹患
- 対象者数93 (人数)
- 疾患
- グリオーマ
- 試料説明
- 初発時・再発時の腫瘍組織（または同じ腫瘍の別の部位の腫瘍組織）および末梢血（非腫瘍組織）から抽出したDNA
- 組織脳、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Methylation array
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Infinium HumanMethylation450 BeadChip Kit
- プラットフォーム
- Illumina Infinium HumanMethylation450
- QC・フィルタリング
- HumanMethylation450_15017482_v1.1 （bpm）
- 解析方法
- Genome Studio v2010.3
- プローブ数
- 485,577 (メチル化サイト)
- 加工データの種類
- DNA メチル化データ