データセット ID
JGAD000108
- データの種類
- オリゴデンドログリオーマ
NGS（Exome、RNA-seq）、Methylation array - アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 146 MB
- ファイル形式
- TXT
- 研究
- hum0006
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000108 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000004 (新しいタブで開きます)
解析手法
メチル化アレイ
- 材料と対象者
- オリゴデンドログリオーマ（ICD10：C71）：16症例（30検体）
- 健康状態罹患
- 対象者数16 (人数)
- 疾患
- オリゴデンドログリオーマ
- 試料説明
- 初発時・再発時の腫瘍組織（または同じ腫瘍の別の部位の腫瘍組織）および末梢血（非腫瘍組織）から抽出したDNA
- 組織脳、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Methylation array
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Infinium HumanMethylation450 BeadChip Kit
- プラットフォーム
- Illumina Infinium HumanMethylation450
- QC・フィルタリング
- HumanMethylation450_15017482_v1.1 （bpm）
- 解析方法
- Genome Studio v2010.3
- プローブ数
- 485,577 (メチル化サイト)