データセット ID
JGAD000436
- データの種類
- NGS(Target Capture)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 194 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0006
- 公開日
- 2022-08-09
- 更新日
- 2022-08-09
- DDBJ Search
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- JGA Study
- JGAS000325 (新しいタブで開きます)
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| 6110_ | 6110遺伝子領域 | 80.3 KB |
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- 脳海綿状血管奇形(ICD10:D180):12症例
椎体血管腫(ICD10:D180):1症例
眼窩内海綿状血管奇形(ICD10:D180):3症例
各症例の病変組織および末梢血、計32検体 - 健康状態罹患
- 疾患
- 脳海綿状血管奇形
- 椎体血管腫
- 眼窩内海綿状血管奇形
- 試料説明
- 病変組織および末梢血より抽出したDNA
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- 6110遺伝子領域
- 試薬キット
- SureSelect Focused Exome
- 断片化
- 超音波断片化(Covaris E220)
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp