データセット ID
JGAD000218
- データの種類
- グリオーマ
NGS（Exome、RNA-seq）、Methylation array - アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 593 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- BAM
- 研究
- hum0006
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000218 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000146 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 脳腫瘍：
初発時グレードIVグリオーマとその再発時腫瘍16検体、ペア正常血液8検体 - 健康状態罹患
- 対象者数8 (人数)
- 疾患
- アストロサイトーマ
- オリゴデンドログリオーマ
- 小脳グリオーマ
- グリオーマ
- 試料説明
- 初発時・再発時の腫瘍組織（または同じ腫瘍の別の部位の腫瘍組織）および末梢血（非腫瘍組織）から抽出したDNA
- 組織脳、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V4
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris SS）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37