研究 ID

hum0257-v2リリース情報

Name: ヒト膵・胆道由来微量検体を用いた培養増幅法の研究開発
Published: 2023-01-10

研究題目

ヒト膵・胆道由来微量検体を用いた培養増幅法の研究開発

目的: ヒト膵腫瘍サブタイプの包括的解析
研究方法: 膵腫瘍組織から樹立したオルガノイドのWhole Exome sequencing、RNA sequencing、ATAC sequencing、ChIP sequencing、およびHi-C解析
対象: 膵管がん、膵管内乳頭粘液性腫瘍（IPMN）
URL: N/A

データセット ID	データの種類	解析手法	アクセス制限	公開日
JGAD000366	NGS（Exome、RNA-seq）	WES RNA-seq	制限公開（Type I）	2021-12-27
JGAD000633	NGS（RNA-seq、ChIP-seq、Hi-C）	RNA-seq ChIP-seq Hi-C	制限公開（Type I）	2023-01-05
E-GEAD-414	NGS（RNA-seq）	RNA-seq	非制限公開	2021-12-27
JGAD000367	NGS（ATAC-seq、ChIP-seq）	ATAC-seq ChIP-seq	制限公開（Type I）	2021-12-24
E-GEAD-416	NGS（ATAC-seq）	ATAC-seq	非制限公開	2021-12-27
E-GEAD-417	NGS（ChIP-seq）	ChIP-seq	非制限公開	2021-12-27
JGAD000365	NGS（Hi-C）	Hi-C	制限公開（Type I）	2021-12-24
E-GEAD-415	NGS（Hi-C）	Hi-C	非制限公開	2021-12-27

研究プロジェクト情報はありません。

科研費・助成金名	研究課題名	研究課題番号
科学研究費助成事業基盤研究（C）	膵癌の包括的理解を目指した細胞間ネットワーク解析	19K08435
科学研究費助成事業基盤研究（C）	クロマチン動態に基づいた膵癌の治療層別化・最適化	21K15966

研究代表者	所属機関	国・州名	研究題目	データ利用期間	データセット ID
浜田道昭	浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学	日本	RNA標的創薬データベースの構築	2023-01-05 – 2027-10-31	JGAD000366
山本拓也	プレシジョン免疫プロジェクト, 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所	日本	新規がん抗原の同定に基づく消化器がんおよび悪性黒色腫（メラノーマ）に対するワクチン開発基盤研究	2024-11-12 – 2026-03-31	JGAD000366

タイトル	DOI	データセット ID
MNX1-HNF1B axis is indispensable for intraductal papillary mucinous neoplasm lineages	https://doi.org/10.1053/j.gastro.2021.12.254 (新しいタブで開きます)	JGAD000365 JGAD000366 JGAD000367
HNF1B-driven three-dimensional chromatin structure for molecular classification in pancreatic cancers	https://doi.org/10.1111/cas.15690 (新しいタブで開きます)	JGAD000365 JGAD000366 JGAD000367 JGAD000633