データセット ID
JGAD000365
- データの種類
- NGS（Hi-C）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 728 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- HIC
- 研究
- hum0257
- 公開日
- 2021-12-24
- 更新日
- 2021-12-24
- DDBJ Search
- JGAD000365 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000262 (新しいタブで開きます)
解析手法
Hi-C
- 材料と対象者
- 膵管がん（ICD10：C25.3）：2症例
腫瘍組織由来オルガノイド：2検体 - 健康状態罹患
- 対象者数2 (人数)
- 疾患
- 膵管がん (C253)
- 試料説明
- 膵腫瘍組織から樹立したオルガノイドより抽出したクロスリンク済みDNA
- 組織オルガノイド
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Hi-C
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Arima Hi-C Kit
- 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp