データセット ID
JGAD001103
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 441 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0257
- 公開日
- 2026-11-05
- 更新日
- 2026-11-05
- DDBJ Search
- JGAD001103 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000957 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 試料 / 対象者
- 膵がん：11症例
- 腫瘍組織から樹立したオルガノイド：11検体
膵管内乳頭粘液性腫瘍 （IPMN）由来の膵がん：2症例
- 腫瘍組織から樹立したオルガノイド：2検体
IPMN：3症例
- IPMN病変から樹立したオルガノイド：3検体
非腫瘍性疾患：1症例
- 非腫瘍性膵臓（非がん、非IPMN）由来のオルガノイド：1検体 - 健康状態罹患
- 対象者数17 (人数)
- 対象集団日本人
- 疾患
- 膵がん
- 膵管内乳頭粘液性腫瘍
- 試料説明
- 腫瘍組織および非腫瘍組織から樹立したオルガノイドより抽出したRNA
- 組織オルガノイド、膵臓
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 購入試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Long read RNA-seq
- 対象領域
- N/A
- 試薬キット
- Ligation Sequencing Kit (SQK-LSK110)
- 断片化
- g-TUBE（Covaris）
- プラットフォーム
- Oxford Nanopore Technologies MinION
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 830 bp（平均）