データセット ID
E-GEAD-414
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 3.2 MB
- ファイル形式
- TXT
- 研究
- hum0257
- 公開日
- 2021-12-27
- 更新日
- 2022-06-10
- DDBJ Search
- E-GEAD-414 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 膵管がん（ICD10：C25.3）：10症例
【JGAD000366/E-GEAD-414】腫瘍組織由来オルガノイド：22検体
膵管内乳頭粘液性腫瘍（ICD10：D13.6）：5症例
【JGAD000366/E-GEAD-414】腫瘍組織由来オルガノイド：4検体、傍腫瘍組織由来オルガノイド1検体 - 健康状態罹患
- 対象者数16 (人数)
- 疾患
- 膵管がん (C253)
膵管内乳頭粘液性腫瘍 (D136) - 試料説明
- 膵腫瘍組織から樹立したオルガノイドより抽出したRNA
- 組織オルガノイド
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq RNA Library Prep Kit
TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit - 断片化
- 熱処理
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
Illumina NovaSeq 6000 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp
150 bp