2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
NBDC ヒトデータベース申請業務ならびにJGA関係の業務につきまして、以下の期間休業いたします：2026年8月12日(水) 〜 2026年8月17日(月) 休業期間中にいただいた申請やお問い合わせ等は、休業明けの 8月18日(火) より順次対応させていただきます。 上記休業期間の前後は通常より対応が遅れることがあります。予めご了承ください。 ご迷惑をおかけいたしますが、ご理解とご協力をお願いいたします。
目的: 新型コロナウイルス感染症患者、無症候性感染者及び新型コロナウイルス感染症が疑われる患者の全ゲノムシーケンス、RNAシーケンス、超高精度HLA解析などを通して、重症化予測法システムの構築を行うことを目的とする。匿名化データを使用してCOVID-19の重症度予測などを数理モデルで解析するとともに、ウイルスと自己免疫性疾患およびCOVID-19の関連を解明する。
研究方法: ゲノムワイド関連解析、RNA-seq、タンパク質発現解析、eQTL/sQTL/pQTL解析、全ゲノムシーケンス
対象: ゲノムワイド関連解析: 日本人5,682名 (COVID-19感染症患者: 2,393名、対照者: 3,289名) RNA-seq: 日本人COVID-19感染症患者1,019名 タンパク質発現量解析: 日本人COVID-19感染症患者1,384名 全ゲノムシーケンス: 日本人COVID-19感染症患者1,164名
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| hum0343.v1.covid19.v1 | 非制限公開 | COVID19感染者のGWAS集計情報 | 2022-05-26 | |
| hum0343.v1.count.v1 | 非制限公開 | COVID19感染者末梢血のNGS(RNA-seq)から得られたリードカウントデータ | 2022-05-26 | |
| hum0343.v2.qtl.v1 | 非制限公開 | COVID19感染者末梢血のRNA-seq解析データ・SNPアレイデータより算出したeQTL/sQTLサマリーデータ | 2022-06-14 | |
| E-GEAD-759 | 非制限公開 | COVID19感染者末梢血のNGS(RNA-seq)から得られたリードカウントデータ COVID19感染者末梢血のタンパク質発現量 | 2024-06-24 | |
| hum0343.v3.qtl.v1 | 非制限公開 | COVID19感染者末梢血のRNA-seq解析データ・SNPアレイデータ・タンパク質発現量データより算出したeQTL/pQTLサマリーデータ | 2024-06-24 | |
| JGAD000874 | 制限公開（Type I） | COVID19感染者末梢血のNGS(WGS)より算出した内在性ヘルペスウイルス6(eHHV-6)の有無およびアネロウイルス量 | 2024-10-04 | |
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| データなし | |
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 国立研究開発法人日本医療研究開発機構 (AMED) 創薬支援推進事業 | 新型コロナウイルス感染症の遺伝学的知見に基づいた分子ニードルCOVID-19粘膜免疫ワクチンの開発 |
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| 新興・再興感染症に対する革新的医薬品等開発推進研究事業 | 新型コロナウイルス感染症の重症化阻止を目指した医薬品・次世代型ワクチン開発に必要な遺伝学・免疫学・代謝学的基盤研究の推進 |
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| 新興・再興感染症に対する革新的医薬品等開発推進研究事業 | 新型コロナ変異ウイルスに対する遺伝学的、免疫学的、代謝学的病態解明および治療戦略の策定 |
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| 新興・再興感染症研究基盤創生事業 (多分野融合研究領域) | 新型コロナウイルス感染症後遺症の病態生理の多分野融合による解明 |
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| 国立研究開発法人科学技術振興機構 (JST) 戦略的創造研究推進事業CREST | 先端ゲノム解析と人工知能によるコロナ制圧研究 |
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| 国立研究開発法人日本医療研究開発機構 (AMED) 免疫アレルギー疾患実用化研究事業 | 免疫オミクス情報の横断的統合による関節リウマチのゲノム個別化医療の実現 |
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| 科学研究費補助金 基盤研究 (Ａ) | 横断的オミクス解析と全ゲノムシークエンスを駆使した疾患病態と組織特異性 の解明 |
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| 国立研究開発法人日本医療研究開発機構 (AMED) ゲノム創薬基盤推進研究事業 | 大規模集団ゲノムデータを利用した遺伝子発現制御文法の機械学習による、VUS 病原性の網羅的評価と実験検証 |
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| 国立研究開発法人科学技術振興機構 (JST) 創発的研究支援事業 | ゲノム制御機構を解明する、解釈可能な汎用予測モデルの構築 |
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| 国立研究開発法人科学技術振興機構 (JST) 戦略的創造研究推進事業さきがけ | パンデミックに対してレジリエントな研究体制構築のための基盤研究 |
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タイトル | DOI | データセット |
|---|---|---|
| DOCK2 is involved in the host genetics and biology of severe COVID-19 | https://doi.org/10.1038/s41586-022-05163-5 | |
| The whole blood transcriptional regulation landscape in 465 COVID-19 infected samples from Japan COVID-19 Task Force | https://doi.org/10.1038/s41467-022-32276-2 | |
| Statistically and functionally fine-mapped blood eQTLs and pQTLs from 1,405 humans reveal their distinct regulation patterns and disease relevance | https://doi.org/10.1038/s41588-024-01896-3 | |
| Blood DNA virome associates with autoimmune diseases and COVID-19. | ||
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | 利用データID |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田道昭 | Waseda University | Japan | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05—2027-10-31 | |