研究 ID
hum0257-v2リリース情報
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研究題目
ヒト膵・胆道由来微量検体を用いた培養増幅法の研究開発
研究概要
- 目的
- ヒト膵腫瘍サブタイプの包括的解析
- 研究方法
- 膵腫瘍組織から樹立したオルガノイドのWhole Exome sequencing、RNA sequencing、ATAC sequencing、ChIP sequencing、およびHi-C解析
- 対象
- 膵管がん、膵管内乳頭粘液性腫瘍（IPMN）
- URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000366 | NGS（Exome、RNA-seq） |
| 制限公開（Type I） | 2021-12-27 | |
| JGAD000633 | NGS（RNA-seq、ChIP-seq、Hi-C） |
| 制限公開（Type I） | 2023-01-05 | |
| E-GEAD-414 | NGS（RNA-seq） |
| 非制限公開 | 2021-12-27 | |
| JGAD000367 | NGS（ATAC-seq、ChIP-seq） |
| 制限公開（Type I） | 2021-12-24 | |
| E-GEAD-416 | NGS（ATAC-seq） |
| 非制限公開 | 2021-12-27 | |
| E-GEAD-417 | NGS（ChIP-seq） |
| 非制限公開 | 2021-12-27 | |
| JGAD000365 | NGS（Hi-C） |
| 制限公開（Type I） | 2021-12-24 | |
| E-GEAD-415 | NGS（Hi-C） |
| 非制限公開 | 2021-12-27 |
提供者
- 研究代表者
- 立石 敬介
- 所属機関
- 東京大学医学部 消化器内科
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト情報はありません。
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
科学研究費助成事業 基盤研究（C） | 膵癌の包括的理解を目指した細胞間ネットワーク解析 |
|
科学研究費助成事業 基盤研究（C） | クロマチン動態に基づいた膵癌の治療層別化・最適化 |
|
関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
MNX1-HNF1B axis is indispensable for intraductal papillary mucinous neoplasm lineages | ||
HNF1B-driven three-dimensional chromatin structure for molecular classification in pancreatic cancers |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田 道昭 | 浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学 | 日本 | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05 – 2027-10-31 | |
| 山本 拓也 | プレシジョン免疫プロジェクト, 国立研究開発法人 医薬基盤・健康・栄養研究所 | 日本 | 新規がん抗原の同定に基づく消化器がんおよび悪性黒色腫（メラノーマ）に対するワクチン開発基盤研究 | 2024-11-12 – 2026-03-31 |