研究題目
ヒト膵・胆道由来微量検体を用いた培養増幅法の研究開発
研究概要
目的: ヒト膵腫瘍サブタイプの包括的解析
研究方法: 膵腫瘍組織から樹立したオルガノイドのWhole Exome sequencing、RNA sequencing、ATAC sequencing、ChIP sequencing、およびHi-C解析
対象: 膵管がん、膵管内乳頭粘液性腫瘍 (IPMN)
2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
NBDC ヒトデータベース申請業務ならびにJGA関係の業務につきまして、以下の期間休業いたします：2026年8月12日(水) 〜 2026年8月17日(月) 休業期間中にいただいた申請やお問い合わせ等は、休業明けの 8月18日(火) より順次対応させていただきます。 上記休業期間の前後は通常より対応が遅れることがあります。予めご了承ください。 ご迷惑をおかけいたしますが、ご理解とご協力をお願いいたします。
NBDC Research ID:hum0257-v2
リリース情報 データセット一覧
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| JGAD000366 | 制限公開（Type I） | NGS(Exome、RNA-seq) | 2021-12-27 | |
| JGAD000633 | 制限公開（Type I） | NGS(RNA-seq、ChIP-seq、Hi-C) | 2023-01-05 | |
| E-GEAD-414 | 非制限公開 | NGS(RNA-seq) | 2021-12-24 | |
| JGAD000367 | 制限公開（Type I） | NGS(ATAC-seq、ChIP-seq) | 2021-12-24 | |
| E-GEAD-416 | 非制限公開 | NGS(ATAC-seq) | 2021-12-24 | |
| E-GEAD-417 | 非制限公開 | NGS(ChIP-seq) | 2021-12-24 | |
| JGAD000365 | 制限公開（Type I） | NGS(Hi-C) | 2021-12-24 | |
| E-GEAD-415 | 非制限公開 | NGS(Hi-C) | 2021-12-24 | |
提供者情報
- 研究代表者
- 立石 敬介
- 所属機関
- 東京大学医学部 消化器内科
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| データなし | |
助成金情報
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 科学研究費助成事業 基盤研究 (C) | 膵癌の包括的理解を目指した細胞間ネットワーク解析 |
|
| 科学研究費助成事業 基盤研究 (C) | クロマチン動態に基づいた膵癌の治療層別化・最適化 |
|
関連論文
タイトル | DOI | データセット |
|---|---|---|
| MNX1-HNF1B axis is indispensable for intraductal papillary mucinous neoplasm lineages | https://doi.org/10.1053/j.gastro.2021.12.254 | |
| HNF1B-driven three-dimensional chromatin structure for molecular classification in pancreatic cancers | https://doi.org/10.1111/cas.15690 | |
制限公開データの利用者一覧
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | 利用データID |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田道昭 | Waseda University | Japan | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05—2027-10-31 | |
| 山本拓也 | National Institutes of Biomedical Innovation, Health and Nutrition | Japan | 新規がん抗原の同定に基づく消化器がんおよび悪性黒色腫（メラノーマ）に対するワクチン開発基盤研究 | 2024-11-12—2026-05-19 | |