hum0005 のリリース情報
hum0005-v8
2023-10-02- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- このバージョンでは、非症候群性難聴1410症例の69遺伝子領域(354 kb)および1559症例の63遺伝子領域(295 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom PanelおよびIon AmpliSeq Library Kit ver 2.0を用いてターゲット領域にしぼり、Thermo Fisher Scientific [Ion PGM/Ion Proton]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp)。
hum0005-v7
2021-11-19- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- このバージョンでは、非症候群性難聴3症例の69遺伝子領域(354 kb)、11症例の63遺伝子領域(295 kb)、および1症例の90遺伝子領域(568 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0、およびAgilent Sure Select XTを用いてターゲット領域にしぼり、Thermo Fisher Scientific [Ion PGM/Ion Proton/IonS5]またはIllumina [HiSeq 2000]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp、Paired-end: 100 bp)。
hum0005-v6
2021-07-30- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- このバージョンでは、非症候群性難聴17症例(JGAS000191:1症例、JGAS000192:9症例、JGAS000201:7症例)の69遺伝子領域(354 kb)、39症例(JGAS000192:17症例、JGAS000200:7症例、JGAS000201:15症例)の63遺伝子領域(295 kb)、および6症例(JGAS000192:2症例、JGAS000201:4症例)の90遺伝子領域(568 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0、およびAgilent Sure Select XTを用いてターゲット領域にしぼり、Thermo Fisher Scientific [Ion PGM/Ion Proton]またはIllumina [HiSeq 2000]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp、Paired-end: 100 bp)。
hum0005-v5
2019-04-18- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- このバージョンでは、非症候群性難聴37症例の69遺伝子領域(354 kb)および2症例の90遺伝子領域(568 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0、およびAgilent Sure Select XTを用いてターゲット領域にしぼり、Thermo Fisher Scientific [Ion PGM/Ion Proton]またはIllumina [HiSeq 2000]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp、Paired-end: 100 bp)。
hum0005-v4
2018-02-13- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- このバージョンでは、非症候群性難聴16症例の69遺伝子領域(354 kb)および3症例の90遺伝子領域(568 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0、およびAgilent Sure Select XTを用いてターゲット領域にしぼり、Thermo Fisher Scientific [Ion PGM/Ion Proton]またはIllumina [HiSeq 2000]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp、Paired-end: 100 bp)。
hum0005-v3
2017-06-19- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- このバージョンでは、非症候群性難聴19症例の69遺伝子領域(354 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0を用いて領域をしぼり、Thermo Fisher Scientific [Ion PGM]または[Ion Proton]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp)。
hum0005-v2
2017-02-24- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- このバージョンでは、非症候群性難聴44症例(JGAS000032:39症例、DRA003791:5症例)の69遺伝子領域(354 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0を用いて領域をしぼり、Thermo Fisher Scientific [Ion PGM]または[Ion Proton]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp)。
hum0005-v1
2014-01-27- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- このバージョンでは、症候群性難聴(Usher症候群)17症例の9遺伝子領域(109 kb)のシーケンスデータfastqファイルを提供する。Ion AmpliSeq Custom kitを用いて領域をしぼり、Thermo Fisher Scientific [Ion PGM]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp)。