データセット ID
DRA001273
- データの種類
- NGS (Target Capture)
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 828 MB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0005
- 公開日
- 2014-01-06
- 更新日
- 2014-05-13
- DDBJ Search
- DRA001273 (新しいタブで開きます)
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- 症候群性難聴(Usher症候群):17症例
- 健康状態罹患
- 対象者数17 (人数)
- 試料説明
- 末梢血から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- 9遺伝子領域
(MYO7A, USH1C, CDH23, PCDH15, SANS[USH1G],
USH2A, GPR98[USH2C], DFNB31[USH2D], CLRN[USH3A]) - 試薬キット
- Ion AmpliSeq Custom Panel
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Thermo Fisher Scientific Ion PGM
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 200 bp