データセット ID
JGAD000274
- データの種類
- NGS (Target Capture)
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 307 MB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0005
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000274 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000191 (新しいタブで開きます)
解析手法
Targeted DNA sequencing
- 材料と対象者
- 非症候群性難聴(ICD10: H90): 1症例
- 健康状態罹患
- 対象者数1 (人数)
- 疾患
- 非症候群性難聴 (H90)
- 試料説明
- 末梢血から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- Targeted DNA sequencing
- 測定対象
- 69遺伝子領域
（ACTG1, CABP2, CCDC50, CDH23, CEACAM16, CIB2, CLDN14,
COCH, COL11A2, COL4A6, CRYM, DFNA5, DFNB59, DIAPH1,
ESPN, ESRRB, EYA4, GIPC3, GJB2, GJB3, GJB6, GPSM2, GRHL2,
GRXCR1, HGF, ILDR1, KARS, KCNQ4, LHFPL5, LOXHD1, LRTOMT,
MARVELD2, MIRN96, MSRB3, MYH14, MYH9, MYO15A, MYO1A,
MYO3A, MYO6, MYO7A, OTOA, OTOF, PCDH15, PNPT1, POU3F4,
POU4F3, PRPS1, PTPRQ, RDX, SERPINB6, SLC17A8, SLC26A4,
SLC26A5, SMAC, SMPX, STRC, TECTA, TJP2, TMC1, TMIE,
TMPRSS3, TPRN, TRIOBP, USH1C, USH2A, WFS1, WHRN） - 試薬キット
- Ion AmpliSeq Custom Panel
Ion AmpliSeq Library Kit 2.0 - 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Thermo Fisher Scientific Ion PGM
Thermo Fisher Scientific Ion Proton - リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 200 bp