本文へ
NBDC ヒトデータベース

カートに入れたデータセットはありません。

システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間:2026年10月5日(月) 9:00 ~ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

研究 ID

hum0005-v6リリース情報

このページは過去のバージョン (v6) です。最新のバージョンは v8 です。
最新バージョン (v8)

研究題目

難聴の遺伝子解析と臨床応用に関する研究

研究概要

目的
様々な難聴および外耳・中耳・内耳奇形の原因遺伝子変異の解明と臨床診断への応用
研究方法
既知の難聴関連遺伝子領域の塩基配列を、Ion PGM、Ion Proton、HiSeq 2000、IonS5を用いて決定する
対象
症候群性難聴(Usher症候群):17症例
非症候群性難聴:39症例(制限公開)+5症例(非制限公開)+19症例(制限公開)+19症例(制限公開)+39症例(制限公開)+1症例(制限公開)+28症例(制限公開)+7症例(制限公開)+26症例(制限公開)+15症例(制限公開)+2969症例(制限公開)

データセット

データセットの一覧はこのバージョンのものですが、各データセットの内容は現在のものを表示しています。

カートデータセット IDデータの種類解析手法アクセス制限公開日
DRA001273NGS (Target Capture)
  • Targeted DNA sequencing
非制限公開2014-01-06
JGAD000032NGS (Target Capture)
  • Targeted DNA sequencing
制限公開(Type I)2020-09-28
JGAD000093NGS (Target Capture)
  • Targeted DNA sequencing
制限公開(Type I)2020-09-28
JGAD000134NGS (Target Capture)
69遺伝子領域・90遺伝子領域
  • Targeted DNA sequencing
制限公開(Type I)2020-09-28
JGAD000244NGS (Target Capture)
69遺伝子領域・90遺伝子領域
  • Targeted DNA sequencing
制限公開(Type I)2020-09-28
JGAD000274NGS (Target Capture)
  • Targeted DNA sequencing
制限公開(Type I)2020-09-28
JGAD000275NGS (Target Capture)
69遺伝子領域・63遺伝子領域・90遺伝子領域
  • Targeted DNA sequencing
制限公開(Type I)2020-09-28
JGAD000286NGS (Target Capture)
69遺伝子領域・63遺伝子領域・90遺伝子領域
  • Targeted DNA sequencing
制限公開(Type I)2021-12-24
DRA003791NGS (Target Capture)
  • Targeted DNA sequencing
非制限公開2015-10-01
JGAD000285NGS (Target Capture)
  • Targeted DNA sequencing
制限公開(Type I)2021-12-24

提供者

研究代表者
宇佐美 真一
所属機関
信州大学 医学部 人工聴覚器学講座

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト情報はありません。

助成金情報

科研費・助成金名研究課題名研究課題番号
日本医療研究開発機構(AMED) 難治性疾患実用化研究事業
科学的エビデンスに基づいた遺伝性難聴の治療法確立に関する調査研究
  • JP16ek0109114
日本医療研究開発機構(AMED) 臨床ゲノム情報統合データベース整備事業
感覚器障害領域を対象とした統合型臨床ゲノム情報データストレージの構築に関する研究
  • JP16kk0205010
日本医療研究開発機構(AMED) 難治性疾患実用化研究事業
遺伝性難聴の診療ガイドライン改定に向けた診断・治療エビデンスの創出
  • JP18ek0109363
厚生労働科学研究費補助金 難治性疾患政策研究事業
難治性聴覚障害に関する調査研究
  • 20FC1048
日本医療研究開発機構(AMED) 障害者対策総合研究開発事業
原因診断に基づく小児難聴の治療・療育システム構築に関する研究
  • JP16dk0310067
日本医療研究開発機構(AMED) 難治性疾患実用化研究事業
症候群性難聴の診療ガイドライン改定に向けた診断・治療エビデンスの創出
  • JP21ek0109542
厚生労働科学研究費補助金 難治性疾患克服研究事業
Usher症候群に関する調査研究
  • H22-難治-一般-058
厚生労働科学研究費補助金 難治性疾患等克服研究事業
遺伝性難聴および外耳、中耳、内耳奇形に関する調査研究
  • H24-難治(難)-一般-032
厚生労働科学研究費補助金 障害者対策総合研究事業 障害者対策総合研究開発事業(感覚器障害分野)
新しい難聴遺伝子診断システムの開発および臨床応用に関する研究
  • H25-感覚-一般-002
厚生労働科学研究費補助金 難治性疾患等政策研究事業
難治性聴覚障害に関する調査研究
  • H26-難治等(難)-一般-032
厚生労働科学研究費補助金 難治性疾患等克服研究事業
難治性聴覚障害に関する調査研究
  • H29-難治等(難)-一般-031

関連論文

タイトルDOIデータセット ID
Massively parallel DNA sequencing facilitates diagnosis of patients with Usher syndrome type 1.
An effective screening strategy for deafness in combination with a next-generation sequencing platform: a consecutive analysis.
Frequency of Usher syndrome type 1 in deaf children by massively parallel DNA sequencing.
POU4F3 mutation screening in Japanese hearing loss patients: Massively parallel DNA sequencing-based analysis identified novel variants associated with autosomal dominant hearing loss
WFS1 mutation screening in a large series of Japanese hearing loss patients: Massively parallel DNA sequencing-based analysis.
OTOF mutation analysis with massively parallel DNA sequencing in 2,265 Japanese sensorineural hearing loss patients.
Detailed Clinical Features of Deafness Caused by a Claudin-14 Variant.
Mutational Spectrum and Clinical Features of Patients with LOXHD1 Variants Identified in an 8074 Hearing Loss Patient Cohort.
Mid-Frequency Hearing Loss Is Characteristic Clinical Feature of OTOA-Associated Hearing Loss.
The Prevalence and Clinical Characteristics of TECTA-Associated Autosomal Dominant Hearing Loss.
Prevalence and Clinical Characteristics of Hearing Loss Caused by MYH14 Variants.
Simple and efficient germline copy number variant visualization method for the Ion AmpliSeq™ custom panel.
The Clinical Next-Generation Sequencing Database: A Tool for the Unified Management of Clinical Information and Genetic Variants to Accelerate Variant Pathogenicity Classification.
Frequency and clinical features of hearing loss caused by STRC deletions.
Diagnostic pitfalls for GJB2-related hearing loss: A novel deletion detected by Array-CGH analysis in a Japanese patient with congenital profound hearing loss.
Sensorineural hearing loss and mild cardiac phenotype caused by an EYA4 mutation.
Frequency of the STRC-CATSPER2 deletion in STRC-associated hearing loss patients.
Variants in CDH23 cause a broad spectrum of hearing loss: from non-syndromic to syndromic hearing loss as well as from congenital to age-related hearing loss.
Genetic background in late-onset sensorineural hearing loss patients.
The genetic etiology of hearing loss in Japan revealed by the social health insurance-based genetic testing of 10K.
Detailed clinical features and genotype-phenotype correlation in an OTOF-related hearing loss cohort in Japan.
Prevalence and clinical features of autosomal dominant and recessive TMC1-associated hearing loss.
Human deafness-associated variants alter the dynamics of key molecules in hair cell stereocilia F-actin cores.
Identification of a Novel Copy Number Variation of EYA4 Causing Autosomal Dominant Non-syndromic Hearing Loss.
Novel ACTG1 mutations in patients identified by massively parallel DNA sequencing cause progressive hearing loss.
Clinical Characteristics and In Vitro Analysis of MYO6 Variants Causing Late-Onset Progressive Hearing Loss.
Prevalence and clinical features of hearing loss caused by EYA4 variants.
Cochlear Implantation From the Perspective of Genetic Background.

制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関国・州名研究題目データ利用期間データセット ID
湯原 悟志研究開発本部 試験開発部 バイオインフォマティクス課, 株式会社エスアールエル日本希少疾患クリニカルレポーティングシステムの検証2024-07-01 – 2026-07-01