対象データセット

JGAデータセット研究タイトルサンプル数データ加工日備考
JGAD000252 ゲノム解析に基づく肺がんの発生・進展の分子機構の解明（hum0068） 21 Per-sample：2021-12-27
QC：2022-01-06
Joint-call：2022-01-26

腫瘍組織由来の検体と非腫瘍組織由来の検体（matched control）ペアの全ゲノムシークエンス解析データ。非腫瘍組織由来検体（Germline）を対象にデータ加工を実施した。

加工データのDataset ID：JGAD000670
JGAD000235 シークエンス解析によるがんゲノム研究：大腸がん（hum0159） 10 Per-sample：2021-12-27
QC：2022-01-06
Joint-call：2022-01-31

腫瘍組織由来の検体と非腫瘍組織由来の検体（matched control）ペアの全ゲノムシークエンス解析データ。非腫瘍組織由来検体（Germline）を対象にデータ加工を実施した。

加工データのDataset ID：JGAD000689
JGAD000234 シークエンス解析によるがんゲノム研究：肝芽腫（hum0161） 33 Per-sample：2021-12-27
QC：2022-01-06
Joint-call：2022-01-31

腫瘍組織由来の検体と非腫瘍組織由来の検体（matched control）ペアの全ゲノムシークエンス解析データ。非腫瘍組織由来検体（Germline）を対象にデータ加工を実施した。

加工データのDataset ID：JGAD000688
JGAD000335

ヒト腫瘍試料の収集・分譲とゲノム情報を利用した研究

既存試料の分譲とゲノム情報を利用した研究

消化器慢性炎症性疾患における遺伝子変異の検索（hum0201）

 14 Per-sample：2021-12-27
QC：2022-01-06
Joint-call：2022-01-06

腫瘍組織由来の検体と非腫瘍組織由来の検体（matched control）ペアの全ゲノムシークエンス解析データ。非腫瘍組織由来検体（Germline）を対象にデータ加工を実施した。

加工データのDataset ID：JGAD000687
JGAD000220 オーダーメイド医療の実現プログラム（hum0014） 1,026 Per-sample：2022-01-16
QC：2022-02-24

2003年から2007年度にバイオバンク・ジャパンに登録された 1,026名の全ゲノムシークエンス解析データを対象にデータ加工を実施した。

加工データのDataset ID：JGAD000690
JGAD000220 オーダーメイド医療の実現プログラム（hum0014） 1,026 Joint-call：
2023-01-30 （autosome and chrX PAR regions; BOTHSEX）、
2023-02-25 （chrX non-PAR regions; FEMALE samples）、
2023-03-02 （chrXY non-PAR regions; MALE samples）

2003年から2007年度にバイオバンク・ジャパンに登録された 1,026名の全ゲノムシークエンス解析データを対象にデータ加工を実施した。Genotypeコールの際、Joint callを実施した。

加工データのDataset ID：JGAD000758

※加工データの利用にあたっては、元データ（表の一番左側に表示されているDataset）のデータ利用申請を実施いただく必要がある。データ利用申請方法はこちら