データセット ID
JGAD000688
- データの種類
- JGAD000234の加工データ
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 2.1 TB
- ファイル形式
- CRAM
- CRAI
- VCF
- TBI
- HTML
- Markdown
- TAR
- 研究
- hum0161
- 公開日
- 2023-01-19
- 更新日
- 2024-10-17
- DDBJ Search
- JGAD000688 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000156 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- 肝芽腫（ICD10：C22.2）：33 症例
腫瘍組織：33 検体
非腫瘍組織：33 検体 - 健康状態罹患
- 対象者数33 (人数)
- 疾患
- 肝芽腫 (C222)
- 試料説明
- 肝芽腫切除切片における非腫瘍組織および腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq Nano DNA Library Prep Kit
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 126 bp
- 元データのデータセットID
- JGAD000234