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NBDC ヒトデータベース
JGAD000235
公開日
2021-06-01

更新日
2022-12-27

研究
hum0159

データの種類
NGS(WGS)

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000157

解析手法

WGS

材料と対象者

大腸がん(ICD10: C18): 10 症例 腫瘍組織: 10 検体 非腫瘍組織: 10 検体

実験方法

WGS

プラットフォーム

Illumina [HiSeq 2000]

試料説明

大腸がん切除切片における非腫瘍組織および腫瘍組織から抽出したDNA

ライブラリ構築

TruSeq DNA LT Sample Prep Kit、および、 TruSeq Nano DNA Low Throughput Library Prep Kit

断片化

超音波断片化(Covaris)

リードタイプ

Paired-end

リード長

100 bp

JGAデータセットAccession
JGA加工データのデータセットID

JGAD000689 加工方法はこちら

総データ量

2 TB(fastq)

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