データセット ID
JGAD000252
- データの種類
- NGS(WGS:NovaSeq 6000)
NGS(WGS:PromethION) - アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 4.3 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0068
- 公開日
- 2020-10-14
- 更新日
- 2024-10-17
- DDBJ Search
- JGAD000252 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000065 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- 肺腺がん(ICD10:C349):21+56症例(42+112検体)
腫瘍組織:21+56検体
非腫瘍組織:21+56検体 - 健康状態罹患
- 対象者数154 (検体数)
- 疾患
- 肺腺がん (C349)
- 試料説明
- 肺腺がんの腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kit
TruSeq Nano DNA Library Prep Kit - 断片化
- 超音波断片化(Covaris)
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- N/A
- 加工データのデータセットID
- JGAD000670