研究 ID
hum0182-v1リリース情報
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最新バージョン (v5)研究題目
全ゲノムシークエンスデータの解析による変異と遺伝的多様性の包括的解析
研究概要
- 目的
- 全ゲノムシークエンスによる構造異常の包括的解析
- 研究方法
- 長鎖一分子シークエンサー（nanopore）による全ゲノムシークエンス
- 対象
- ① 国際がんゲノムコンソーシアム（ICGC）の際に収集した日本人肝臓がん1症例（RK067）（hum0158）の末梢血（正常細胞）由来DNA
② HapMap日本人（NA18943）のDNA - URL
- N/A
データセット
データセットの一覧はこのバージョンのものですが、各データセットの内容は現在のものを表示しています。
| カート | データセット ID | データの種類 | プラットフォーム | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000261 | NGS（WGS）：RK067 |
| 制限公開（Type I） | 2020-10-21 | |
| DRA008482 | NGS（WGS）：NA18943 |
| 非制限公開 | 2019-06-21 |
提供者
- 研究代表者
- 藤本 明洋
- 所属機関
- 京都大学大学院医学研究科 創薬医学講座
研究プロジェクト情報
| 研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
国立研究開発法人日本医療研究開発機構 ゲノム医療実現推進プラットフォーム事業「先端ゲノム研究開発」プロジェクト | N/A |
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
日本医療研究開発機構（AMED） ゲノム医療実現推進プラットフォーム事業 | 先進的シークエンス情報解析技術基盤の開発 |
|
関連論文
関連論文はありません。
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| Shuaicheng Li | 香港 | A new method to construct the haplotypes of viral integration regions based on multiple sequencing data. | 2021-12-13 – 2023-01-05 | ||
| zeng tianfu | Laboratory of Omics Technology and Bioinformatics, Sichuan University | 中国 | Study on Heterogeneity of Hepatocellular Carcinoma Based on Nanopore Sequencing Technology | 2023-10-30 – 2024-09-18 |