データセット ID
JGAD000635
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 2.7 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0182
- 公開日
- 2022-05-23
- 更新日
- 2022-05-23
- DDBJ Search
- JGAD000635 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000516 (新しいタブで開きます)
解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 肝臓がん （ICD10：C22.0）：42症例
腫瘍組織：42検体、腫瘍組織周辺の非腫瘍組織：42検体
乳がん細胞株（MCF-7）：1検体 - 健康状態罹患
- 対象者数42 (人数)
- 疾患
- 肝臓がん (C220)
- 試料説明
- 腫瘍組織および腫瘍組織周辺の非腫瘍組織、ならびに、乳がん細胞株から抽出したRNA
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 細胞株
- MCF-7
- 試料の入手元
- MCF-7：コスモバイオ 株式会社より購入したRNA
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Ligation Sequencing Kit (SQK-LSK109)
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Oxford Nanopore Technologies MinION
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 1411.4 bp