データセット ID
DRA008482
- データの種類
- NGS（WGS）：NA18943
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 68.2 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0182
- 公開日
- 2019-06-21
- 更新日
- 2019-05-31
- DDBJ Search
- DRA008482 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- ① RK067（ICGC日本人肝臓がん症例の正常細胞）
② NA18943（HapMap検体）
④RK014、RK019、RK020、RK085、RK0143、RK147、RK156、RK157、RK167、RK281（ICGC日本人肝臓がん症例の正常細胞）
RK014、RK019、RK020、RK067、RK085、RK0143、RK147、RK156、RK157、RK167、RK281（ICGC日本人肝臓がん症例の腫瘍組織） - 健康状態混在
- コホートHapMap
- 対象集団日本人
- 試料説明
- ① 肝臓がん患者の末梢血（正常組織）から抽出したDNA
② HapMap DNA検体
④ 肝臓がん患者の末梢血（正常組織）および腫瘍組織から抽出したDNA - 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 細胞株
- NA18943
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Ligation Sequencing Kit (SQK-LSK108)
- 断片化
- g-TUBE（Covaris）
- プラットフォーム
- Oxford Nanopore Technologies MinION
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 7463 bp (①④)
3479 bp (②)