hum0127 のリリース情報
hum0127-v4
2024-07-10- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- 静岡がんセンター病院にて手術を受けたがん患者5143症例の内、全エクソンシーケンシングおよび全遺伝子発現解析などでドライバー遺伝子に変化が認められなかった177症例の腫瘍組織と末梢血白血球から抽出したDNAを用いたWGS解析を実施。腫瘍組織と非腫瘍組織の塩基配列を比較し、腫瘍特異的な変異情報を提供する（tab、vcf）。
hum0127-v3
2024-01-22- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- 静岡がんセンター手術症例のうち、消化管間質腫瘍30症例の腫瘍組織と末梢血白血球から抽出したDNAを用いたWGS解析データの差分データ（vcf）、同30症例の腫瘍組織と非腫瘍組織（1症例は腫瘍組織のみ）から抽出したRNAを用いた発現アレイ解析データ（txt）、内19症例の腫瘍組織と非腫瘍組織から抽出したDNAを用いたメチル化アレイ解析データ（idat）を提供する。
hum0127-v2
2021-03-08- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- 静岡がんセンター病院にて手術を受けたがん患者5143例を対象とし、手術摘出組織（腫瘍組織および非腫瘍組織）ならびに末梢血の白血球（非腫瘍組織）から抽出したDNAおよびRNAを用いたExome、DNA amplicon-seq、RNA amplicon-seq解析を実施。配列の解読にはIon Proton（Thermo Fisher Scientific）を用いた。腫瘍組織、非腫瘍組織の変異情報（vcf）およびCNVデータ（tab）、DNA amplicon-seq（409遺伝子パネル）解析結果（vcf）、RNA amplicon-seq（491融合遺伝子パネル）解析結果（tab）を提供する。また、上記RNAを対象とした、SurePrint G3 Human Gene Expression 8 × 60 K v2 Microarray（Agilent Technologies）によるマイクロアレイ解析結果（tab）を提供する。
hum0127-v1
2020-04-14- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- 静岡がんセンター病院にて手術を受けたがん患者2042例のうち、POLE遺伝子領域内の変異、および、がん関連遺伝子内に高頻度で変異を持つ（高頻度遺伝子変異）91症例を対象とし、手術摘出組織（腫瘍組織）ならびに末梢血の白血球（非腫瘍組織）から抽出したDNAを用いたExome解析を実施。腫瘍組織と非腫瘍組織の塩基配列を比較し、腫瘍特異的な変異情報を提供する（vcf）。配列の解読にはIon Proton（Thermo Fisher Scientific）を用いた。