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NBDC ヒトデータベース
JGAD000141
公開日
2020-09-28

更新日
2024-01-22

研究
hum0127

データの種類
NGS(Exome)

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000130

解析手法

WES

材料と対象者

POLE変異および高頻度変異を保有するがん: 91症例 (ICD10: C00-D48)

実験方法

Exome

プラットフォーム

Thermo Fisher Scientific [Ion Proton]

試料説明

手術摘出組織(腫瘍組織)および末梢血の白血球(非腫瘍組織)から抽出したDNA

ライブラリ構築

Ion AmpliSeq Exome RDY Kit

リードタイプ

Single-end, multiplex PCR

リード長

180 bp

解析方法

Torrent Suite plugin Variant Caller

フィルタリング

Torrent Suite

マッピング

Torrent Suite

JGAデータセットAccession
総データ量

75 MB(vcf [ref: hg19])

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