データセット ID
JGAD000141
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 79.1 MB
- ファイル形式
- VCF
- 研究
- hum0127
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000141 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000130 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- POLE変異および高頻度変異を保有するがん：91症例
（ICD10：C00-D48） - 健康状態罹患
- 対象者数91 (人数)
- 試料説明
- 手術摘出組織（腫瘍組織）および末梢血の白血球（非腫瘍組織）から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- Ion AmpliSeq Exome RDY Kit
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Thermo Fisher Scientific Ion Proton
- リードタイプ
- シングルエンド
- リード長
- 180 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37
- マッピング
- Torrent Suite
- QC・フィルタリング
- Torrent Suite
- 解析方法
- Torrent Suite plugin Variant Caller
- 表現型データの有無
- あり