研究 ID
hum0195-v3リリース情報
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研究題目
消化器癌における遺伝子異常についての網羅的解析
研究概要
- 目的
- 消化器がんの病態進展に関わる遺伝子異常を明らかにすること
- 研究方法
- 全ゲノム解析、全エクソン解析、トランスクリプトーム解析、および、targeted deep sequencing解析
- 対象
- ・結節内結節型肝がん症例の腫瘍組織・非腫瘍組織・末梢血より単離したリンパ球
・C型肝炎ウイルス排除後に肝がんを発症した慢性肝炎/肝硬変症例、C型肝炎ウイルス陽性肝硬変/肝がん症例、および、C型肝炎ウイルス陰性肝がん症例
・胃がん症例、胃粘膜下腫瘍症例 - URL
- N/A
データセット
| カート | データセット ID | データの種類 | 解析手法 | アクセス制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| JGAD000273 | NGS（WGS） |
| 制限公開（Type I） | 2021-04-02 | |
| JGAD000331 | NGS（Exome、RNA-seq） |
| 制限公開（Type I） | 2021-04-02 | |
| JGAD000375 | NGS（Exome、Target Capture、 RNA-seq） |
| 制限公開（Type I） | 2022-03-04 | |
| JGAD000629 | NGS（Exome） |
| 制限公開（Type I） | 2022-03-04 | |
| JGAD000332 | NGS（Exome、RNA-seq） |
| 制限公開（Type I） | 2021-04-02 |
提供者
- 研究代表者
- 髙井 淳
- 所属機関
- 京都大学大学院 医学研究科 消化器内科学
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト情報はありません。
助成金情報
| 科研費・助成金名 | 研究課題名 | 研究課題番号 |
|---|---|---|
科学研究費助成事業 基盤研究（C） | 全ゲノム解析とオルガノイド培養を用いた多段階肝発癌分子メカニズムの解明 |
|
科学研究費助成事業 基盤研究（B） | 肝硬変"再生結節"の細胞クローン動態と発癌機構の解明 |
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関連論文
| タイトル | DOI | データセット ID |
|---|---|---|
Multiregional whole-genome sequencing of hepatocellular carcinoma with nodule-in-nodule appearance reveals stepwise cancer evolution | ||
Oncogenic transcriptomic profile is sustained in the liver after the eradication of the hepatitis C virus | ||
DNA methyltransferase 3B plays a protective role against hepatocarcinogenesis caused by chronic inflammation via maintaining mitochondrial homeostasis | ||
Expansion of gastric intestinal metaplasia with copy number aberrations contributes to field cancerization |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット ID |
|---|---|---|---|---|---|
| Jinyan Huang | Zhejiang University School of Medicine, 79 Qingchun Road, Hangzhou, 310003, Zhejiang, China. Biomedical big data center, the First Affiliated Hospital, Zhejiang University | 中国 | Comprehensive analysis of alternative splicing in malignant tumors | 2022-03-15 – 2024-01-01 | |
| 浜田 道昭 | 浜田研究室, 理工学術院, 早稲田大学 | 日本 | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05 – 2027-10-31 |