データセット ID
JGAD000273
- データの種類
- NGS(WGS)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 1.6 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0195
- 公開日
- 2021-04-02
- 更新日
- 2021-04-02
- DDBJ Search
- JGAD000273 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000190 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- 結節内結節型肝がん(ICD10:C220):5症例(計23検体)
腫瘍組織:14検体
非腫瘍組織:5検体
末梢血より単離したリンパ球:4検体 - 健康状態罹患
- 対象者数23 (検体数)
- 疾患
- 結節内結節型肝がん (C220)
- 試料説明
- 腫瘍組織、非腫瘍組織および末梢血より単離したリンパ球から抽出したDNA
- 組織リンパ球
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kit
- 断片化
- 超音波断片化
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp