研究題目
全ゲノムシークエンスデータの解析による変異と遺伝的多様性の包括的解析
研究概要
目的: 全ゲノムシークエンスによる構造異常の包括的解析
研究方法: 長鎖一分子シークエンサー (nanopore) およびHiSeq 2000、Genome Analyzer IIx (Illumina) による全ゲノムシークエンス
対象: ① 国際がんゲノムコンソーシアム (ICGC) の際に収集した日本人肝臓がん1症例 (RK067) (hum0158) の末梢血 (正常細胞) 由来DNA ② HapMap日本人 (NA18943) のDNA ③ 国際がんゲノムコンソーシアム (ICGC) の際に収集した日本人肝臓がん174症例 (RK001~RK338) (hum0158) の末梢血 (正常細胞) 由来DNA ④ 国際がんゲノムコンソーシアム (ICGC) の際に収集した日本人肝臓がん11症例 (RK014、RK019、RK020、RK067、RK085、RK0143、RK147、RK156、RK157、RK167、RK281) (hum0158) の末梢血 (正常細胞) および腫瘍組織由来DNA ⑤ ICGCの際に収集した日本人肝臓がん42症例の腫瘍組織および腫瘍組織周辺の非腫瘍組織由来RNA 、ならびに、乳がん細胞株のRNA
