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NBDC ヒトデータベース
NBDC Research ID:hum0177
  • hum0177-v1

    このリリースで追加されたデータセット

    リリースノート

    ・PBAT-seq このバージョンでは、悪性神経膠腫14症例の腫瘍組織および細胞株1種から抽出したDNAを用いたPBAT-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。TACS ligation-mediated PBAT (Miura F, Nucleic Acids Res. 2019) によるライブラリ作製後、Hiseq X Ten (Illumina) によりシークエンシングを行っている。 ・RNA-seq このバージョンでは、悪性神経膠腫5症例の腫瘍組織および細胞株1種から抽出したRNAを用いたRNA-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。TruSeq stranded mRNA Kitによるライブラリ作製後、NovaSeq 6000 (Illumina) によりシークエンシングを行っている。 ・ChIP-seq このバージョンでは、悪性神経膠腫細胞株1種から抽出したDNAを用いたChIP-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。SMARTer ThruPLEX DNA-seq Kitおよび抗H3.3抗体および抗H3.3 G34V抗体を用いた免疫沈降によりライブラリを作製し、NovaSeq 6000 (Illumina) によりシークエンシングを行っている。

    バージョン公開日

    2020-04-27