hum0177 のリリース情報
hum0177-v1
2020-04-27- このリリースで追加されたデータセット
- リリースノート
- ・PBAT-seq
このバージョンでは、悪性神経膠腫14症例の腫瘍組織および細胞株1種から抽出したDNAを用いたPBAT-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。TACS ligation-mediated PBAT（Miura F, Nucleic Acids Res. 2019）によるライブラリ作製後、Hiseq X Ten（Illumina）によりシークエンシングを行っている。
・RNA-seq
このバージョンでは、悪性神経膠腫5症例の腫瘍組織および細胞株1種から抽出したRNAを用いたRNA-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。TruSeq stranded mRNA Kitによるライブラリ作製後、NovaSeq 6000（Illumina）によりシークエンシングを行っている。
・ChIP-seq
このバージョンでは、悪性神経膠腫細胞株1種から抽出したDNAを用いたChIP-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。SMARTer ThruPLEX DNA-seq Kitおよび抗H3.3抗体および抗H3.3 G34V抗体を用いた免疫沈降によりライブラリを作製し、NovaSeq 6000（Illumina）によりシークエンシングを行っている。