研究題目
脳腫瘍の悪性化に関与する遺伝子の解析
研究概要
目的: H3F3A遺伝子変異をもつ悪性神経膠腫におけるDNAメチル化解析
研究方法: 悪性神経膠腫症例の腫瘍組織から抽出したDNA・RNAを用いたPBAT-seq (14症例＋細胞株1種) 、RNA-seq (14症例中の5症例＋細胞株1種) およびChIP-seq (細胞株1種)
対象: 悪性神経膠腫
2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
NBDC Research ID:hum0177-v1
リリース情報 データセット一覧
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| JGAD000280 | 制限公開（Type I） | NGS(PBAT-seq、RNA-seq、ChIP-seq) | 2020-09-28 | |
| JGAD000281 | 制限公開（Type I） | NGS(PBAT-seq、RNA-seq、ChIP-seq) | 2020-09-28 | |
| JGAD000282 | 制限公開（Type I） | NGS(PBAT-seq、RNA-seq、ChIP-seq) | 2020-09-28 | |
提供者情報
- 研究代表者
- 伊藤 隆司
- 所属機関名
- 九州大学大学院医学研究院 医化学分野
研究プロジェクト情報
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| データなし | |
助成金情報
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 日本医療研究開発機構 (AMED) 創薬等ライフサイエンス研究支援基盤事業 | メチローム解析の高度化と支援 |
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| 日本医療研究開発機構 (AMED) 創薬等ライフサイエンス研究支援基盤事業 | 先進メチローム解析の支援と高度化 |
|
| 科学研究費助成事業 新学術領域研究 (研究領域提案型) | 次世代エピゲノム解析技術の開発とその応用 |
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関連論文
タイトル | DOI | 利用データID |
|---|---|---|
| Highly efficient single-stranded DNA ligation technique improves low-input whole-genome bisulfite sequencing by post-bisulfite adaptor tagging | https://doi.org/10.1093/nar/gkz435 | |
制限公開データの利用者一覧
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | 利用データID |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田道昭 | Waseda University | Japan | RNA標的創薬データベースの構築 | 2023-01-05—2027-10-31 | |