データセット ID
JGAD000280
- データの種類
- NGS（PBAT-seq、RNA-seq、ChIP-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 1.7 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0177
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000280 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000197 (新しいタブで開きます)
解析手法
PBAT-seq
- 材料と対象者
- 悪性神経膠腫（ICD10：C71.9）：14症例＋細胞株1種
- 健康状態罹患
- 対象者数15 (混在)
- 疾患
- 悪性神経膠腫
- 試料説明
- 悪性神経膠腫の腫瘍組織および細胞株から抽出したDNA
- 腫瘍 / 非腫瘍腫瘍
- 細胞株
- IFO50356
- 試料の入手元
- IFO50356（JCRB）
- 実験方法
- PBAT-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TACS ligation-mediated PBAT
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris S220）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq X
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp