2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
JGAD000282
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- 研究
- hum0177
- データの種類
- NGS(PBAT-seq、RNA-seq、ChIP-seq)
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- JGA Study
- JGAS000197
解析手法
ChIP-seq
- 材料と対象者
悪性神経膠腫(ICD10: C71.9)細胞株: 1種
- 実験方法
ChIP-seq
- プラットフォーム
Illumina [NovaSeq 6000]
- 試料説明
悪性神経膠腫細胞株(全細胞溶解液[コントロール]1検体、免疫沈降2検体)から抽出したDNA 免疫沈降: ウサギモノクローナル抗体(抗H3.3抗体、抗H3.3 G34V抗体)
- 細胞株
IFO50356(JCRB)
- ライブラリ構築
SMARTer ThruPLEX DNA-seq Kit
- 断片化
超音波断片化(Covaris S220)
- リードタイプ
Paired-end
- リード長
150 bp
- JGAデータセットAccession
- 総データ量
1 TB(fastq)
- 利用ポリシー