研究題目
日本人由来B細胞株DNAのゲノムデータを用いた遺伝統計解析手法の研究
研究概要
目的: 日本人細胞株由来のゲノムデータを用いた遺伝統計解析の実施
研究方法: ゲノムワイド関連解析の実施 (乾癬) 、および、HLA領域に対するTarget capture sequenceの実施、ならびに、KIR領域におけるgenotype imputation reference panelの構築
対象: 日本人細胞株由来ゲノム

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
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目的: 日本人細胞株由来のゲノムデータを用いた遺伝統計解析の実施
研究方法: ゲノムワイド関連解析の実施 (乾癬) 、および、HLA領域に対するTarget capture sequenceの実施、ならびに、KIR領域におけるgenotype imputation reference panelの構築
対象: 日本人細胞株由来ゲノム
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| hum0114.v1.gwas.v1 | 非制限公開 | 乾癬282症例および対照426名のGWAS | 2017-12-18 | |
| DRA007411 | 非制限公開 | NGS(Target Capture) | 2019-01-28 | |
| JGAD000425 | 制限公開(Type I) | NGS(WGS + Target Capture、Target Capture) | 2021-08-10 | |
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| データなし | |
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 科学研究費助成事業 新学術領域研究 | 遺伝統計学とビッグデータの邂逅がもたらす新たながんゲノム創薬 |
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| 科学研究費助成事業 若手研究 (A) | HLA imputation法を用いた自己免疫疾患のバイオマーカーの同定 |
|
| 日本医療研究開発機構 (AMED) ゲノム医療実現推進プラットフォーム事業 (先端ゲノム研究開発) | 遺伝統計学に基づく日本人集団のゲノム個別化医療の実装 |
|
タイトル | DOI | 利用データID |
|---|---|---|
| Variants at HLA-A, HLA-C, and HLA-DQB1 confer risk of psoriasis vulgaris in Japanese | https://doi.org/10.1016/j.jid.2017.10.001 | |
| Genetic and phenotypic landscape of the major histocompatibilty complex region in the Japanese population. | https://doi.org/10.1038/s41588-018-0336-0 | |
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | データ利用期間 | 利用データID |
|---|---|---|---|---|---|
| 福永航也 | RIKEN Center for Integrative Medical Sciences | Japan | 重篤な皮膚有害事象の診断・治療と遺伝子マーカーに関する研究 | 2023-02-10—2026-03-02 | |
| 白石航也 | National Cancer Center Research Institute | Japan | ゲノム解析に基づく宿主並びに腫瘍における免疫応答ネットワーク機構の解明 | 2024-06-24—2025-12-15 | |
| 莚田泰誠 | RIKEN Center for Integrative Medical Sciences | Japan | 薬疹関連遺伝子の探索 | 2021-03-26—2028-03-31 | |
| 水木信久 | Yokohama City University School of Medicine | Japan | ベーチェット病の原因遺伝子マッピング | 2024-08-01—2025-04-04 | |