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NBDC ヒトデータベース
NBDC Research ID:hum0114-v3
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研究題目

日本人由来B細胞株DNAのゲノムデータを用いた遺伝統計解析手法の研究

研究概要

目的: 日本人細胞株由来のゲノムデータを用いた遺伝統計解析の実施

研究方法: ゲノムワイド関連解析の実施 (乾癬) 、および、HLA領域に対するTarget capture sequenceの実施、ならびに、KIR領域におけるgenotype imputation reference panelの構築

対象: 日本人細胞株由来ゲノム

データセット一覧

データセット ID
アクセス制限
データの種類
公開日
hum0114.v1.gwas.v1非制限公開乾癬282症例および対照426名のGWAS2017-12-18
DRA007411非制限公開NGS(Target Capture)2019-01-28
JGAD000425制限公開(Type I)NGS(WGS + Target Capture、Target Capture)2021-08-10

提供者情報

    研究代表者
    岡田 随象
    所属機関名
    大阪大学大学院医学系研究科 遺伝統計学

研究プロジェクト情報

研究プロジェクト名
URL
データなし

助成金情報

科研費・助成金名
タイトル
研究課題番号
科学研究費助成事業 新学術領域研究遺伝統計学とビッグデータの邂逅がもたらす新たながんゲノム創薬
  • 15H05911
科学研究費助成事業 若手研究 (A)HLA imputation法を用いた自己免疫疾患のバイオマーカーの同定
  • 15H05670
日本医療研究開発機構 (AMED) ゲノム医療実現推進プラットフォーム事業 (先端ゲノム研究開発)遺伝統計学に基づく日本人集団のゲノム個別化医療の実装
  • JP21km0405211

関連論文

タイトル
DOI
利用データID
Variants at HLA-A, HLA-C, and HLA-DQB1 confer risk of psoriasis vulgaris in Japanesehttps://doi.org/10.1016/j.jid.2017.10.001
Genetic and phenotypic landscape of the major histocompatibilty complex region in the Japanese population.https://doi.org/10.1038/s41588-018-0336-0

制限公開データの利用者一覧

研究代表者
所属機関
国・州名
研究題目
データ利用期間
利用データID
福永航也RIKEN Center for Integrative Medical SciencesJapan重篤な皮膚有害事象の診断・治療と遺伝子マーカーに関する研究2023-02-102026-03-02
白石航也National Cancer Center Research InstituteJapanゲノム解析に基づく宿主並びに腫瘍における免疫応答ネットワーク機構の解明2024-06-242025-12-15
莚田泰誠RIKEN Center for Integrative Medical SciencesJapan薬疹関連遺伝子の探索2021-03-262028-03-31
水木信久Yokohama City University School of MedicineJapanベーチェット病の原因遺伝子マッピング2024-08-012025-04-04