データセット ID
NHA000059
- データの種類
- 乾癬282症例および対照426名のGWAS
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 6.3 MB
- ファイル形式
- XLSX
- ZIP
- 研究
- hum0114
- 公開日
- 2017-12-18
- 更新日
- 2017-12-18
- Secondary ID
- hum0114.v1.gwas.v1
このデータセットに紐づく非制限公開ファイル
| ファイル名 | ラベル | サイズ | URL のコピー |
|---|---|---|---|
| hum0114.v1.gwas.v1.zip | 6.3 MB | ||
| hum0114_ | Dictionary file | 10.9 KB |
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
- 乾癬（ICD10：L400）：282症例（JBIC細胞株）
対照：426名（JBIC細胞株） - 健康状態混在
- 対象者数708 (人数)
- 対象集団日本人
- 疾患
- 乾癬 (L400)
- 試料説明
- JCRB生物資源バンクの日本人由来B細胞株
（JBIC細胞株の健常人：426 名、及び乾癬患者282名）から抽出したDNA - 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 細胞株
- JBIC cell line
- 実験方法
- Genotyping by array
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- HumanCoreExome BeadChip Kit
- プラットフォーム
- Illumina HumanCoreExome
- 参照ゲノム
- GRCh37
- QC・フィルタリング
- sample call rate < 0.99, SNP call rate < 0.99, HWE-P < 1x10^-7
- 解析方法
- GenCall software（GenomeStudio）
- バリアント数
- 255,632 SNPs (常染色体)
- 加工データの種類
- GWAS 要約統計量